MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015052	GAT	2	6	2259738	2259743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015052	GCC	2	6	2259866	2259871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_015052	GCC	2	6	2259873	2259878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_015052	TAA	2	6	2259893	2259898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_015052	GCCA	2	8	2259901	2259908	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_015052	ATTTC	2	10	2261451	2261460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6007	NC_015052	TCT	2	6	2261461	2261466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015052	GCC	2	6	2261469	2261474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_015052	GCTCA	2	10	2261550	2261559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6010	NC_015052	GAT	2	6	2261571	2261576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_015052	A	6	6	2261594	2261599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015052	GTT	2	6	2265333	2265338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015052	ACA	2	6	2266186	2266191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_015052	CAAC	2	8	2266206	2266213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_015052	TCGC	2	8	2266869	2266876	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6016	NC_015052	CGG	2	6	2266962	2266967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_015052	AACG	2	8	2266976	2266983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6018	NC_015052	GA	3	6	2267030	2267035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_015052	TGA	2	6	2268551	2268556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015052	CCT	2	6	2270009	2270014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6021	NC_015052	ATC	2	6	2270371	2270376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_015052	CGG	2	6	2270411	2270416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015052	TGG	2	6	2270481	2270486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_015052	CACC	2	8	2271464	2271471	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6025	NC_015052	A	7	7	2271489	2271495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_015052	CA	3	6	2271535	2271540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_015052	AGC	2	6	2271572	2271577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015052	TC	3	6	2274787	2274792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6029	NC_015052	ATT	2	6	2274853	2274858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015052	GAT	2	6	2274862	2274867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_015052	TA	3	6	2274909	2274914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015052	C	6	6	2274948	2274953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6033	NC_015052	GCC	2	6	2275019	2275024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_015052	AG	3	6	2275069	2275074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015052	CGC	2	6	2275093	2275098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_015052	GA	3	6	2275107	2275112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015052	ACT	2	6	2275727	2275732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_015052	AGGG	2	8	2275758	2275765	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_015052	ACG	2	6	2275831	2275836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_015052	TCA	2	6	2275841	2275846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015052	CGC	2	6	2275854	2275859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_015052	CTG	2	6	2275881	2275886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015052	GAC	2	6	2275916	2275921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015052	TCC	3	9	2277633	2277641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6045	NC_015052	TCT	2	6	2277835	2277840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_015052	TA	3	6	2277859	2277864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_015052	CGC	2	6	2277924	2277929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_015052	ATCA	3	12	2277932	2277943	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_015052	CA	3	6	2279029	2279034	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6050	NC_015052	CCA	2	6	2279042	2279047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_015052	GT	3	6	2279133	2279138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_015052	GTGC	2	8	2279149	2279156	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_015052	T	6	6	2279164	2279169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015052	GCG	2	6	2279170	2279175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_015052	GCG	2	6	2279207	2279212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_015052	CTT	2	6	2280712	2280717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_015052	ATC	2	6	2280751	2280756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_015052	CAA	2	6	2280773	2280778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_015052	A	8	8	2280888	2280895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_015052	GCCC	2	8	2280965	2280972	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6061	NC_015052	CCA	2	6	2281760	2281765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_015052	GAT	2	6	2281789	2281794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_015052	GAT	2	6	2282208	2282213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_015052	GTTG	2	8	2282221	2282228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_015052	CA	3	6	2282307	2282312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_015052	GTC	2	6	2283189	2283194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015052	CGA	2	6	2283210	2283215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_015052	TCA	2	6	2283239	2283244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015052	CCG	2	6	2283274	2283279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_015052	CAA	2	6	2283292	2283297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_015052	CAAC	2	8	2283327	2283334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6072	NC_015052	CAG	2	6	2283364	2283369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_015052	GTG	2	6	2283381	2283386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015052	CCGTTG	2	12	2283494	2283505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015052	GT	3	6	2288508	2288513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_015052	AGC	2	6	2288533	2288538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_015052	TG	3	6	2288646	2288651	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_015052	TG	3	6	2288705	2288710	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_015052	G	8	8	2288918	2288925	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015052	CAG	2	6	2288937	2288942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_015052	G	6	6	2288946	2288951	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015052	AGG	2	6	2288952	2288957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015052	CGCGC	2	10	2289022	2289031	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6084	NC_015052	TC	3	6	2289034	2289039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_015052	CGG	2	6	2289051	2289056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015052	GGCC	2	8	2289057	2289064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_015052	TTG	2	6	2289132	2289137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_015052	GAA	2	6	2289142	2289147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_015052	AAC	2	6	2290566	2290571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6090	NC_015052	CAA	2	6	2290575	2290580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_015052	GT	3	6	2290607	2290612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_015052	GCG	3	9	2290691	2290699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015052	GCC	2	6	2290797	2290802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_015052	TCT	2	6	2290808	2290813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015052	GGC	2	6	2290849	2290854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_015052	AGG	2	6	2290938	2290943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_015052	CCT	2	6	2291235	2291240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_015052	ACG	2	6	2291283	2291288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015052	CGA	2	6	2291363	2291368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015052	CGT	2	6	2291519	2291524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_015052	TGCACT	2	12	2291546	2291557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_015052	CG	3	6	2291724	2291729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6103	NC_015052	ACC	2	6	2291968	2291973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_015052	GT	3	6	2292153	2292158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015052	ACC	2	6	2292255	2292260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6106	NC_015052	GGC	2	6	2292280	2292285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_015052	CAT	2	6	2292351	2292356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_015052	ACC	2	6	2292421	2292426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_015052	CGGC	2	8	2292431	2292438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_015052	CTA	2	6	2292467	2292472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_015052	CCCGGA	2	12	2292525	2292536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_015052	GGC	2	6	2292562	2292567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_015052	TC	3	6	2292706	2292711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6114	NC_015052	GGT	2	6	2292822	2292827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015052	GCT	2	6	2292901	2292906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_015052	CCT	2	6	2292917	2292922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_015052	GAC	2	6	2292978	2292983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_015052	CGA	3	9	2293004	2293012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_015052	CCG	2	6	2293023	2293028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_015052	GA	3	6	2293160	2293165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_015052	C	6	6	2293216	2293221	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6122	NC_015052	TCC	2	6	2293246	2293251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_015052	ATC	2	6	2293290	2293295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015052	CTCCC	2	10	2293479	2293488	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6125	NC_015052	GCCG	2	8	2293709	2293716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_015052	CG	3	6	2293754	2293759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_015052	CAT	2	6	2293796	2293801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015052	TCGC	2	8	2293808	2293815	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_015052	ACT	2	6	2293817	2293822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6130	NC_015052	C	6	6	2293873	2293878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6131	NC_015052	CGGT	2	8	2293904	2293911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6132	NC_015052	GGC	2	6	2293952	2293957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_015052	CCA	2	6	2294015	2294020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6134	NC_015052	GCAA	2	8	2294030	2294037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_015052	CA	3	6	2294038	2294043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6136	NC_015052	GAC	2	6	2294087	2294092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6139	NC_015052	CCA	2	6	2294218	2294223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6140	NC_015052	CGCCA	2	10	2294229	2294238	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6141	NC_015052	CGGC	2	8	2294252	2294259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6145	NC_015052	ACG	2	6	2294378	2294383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6151	NC_015052	TCCGC	2	10	2294739	2294748	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6152	NC_015052	CGC	2	6	2294751	2294756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6155	NC_015052	CGG	2	6	2294856	2294861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6192	NC_015052	TGCA	2	8	2296738	2296745	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6241	NC_015052	GAC	2	6	2302725	2302730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6242	NC_015052	ATC	2	6	2302733	2302738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6243	NC_015052	TTCGA	2	10	2302781	2302790	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6244	NC_015052	CCA	2	6	2302856	2302861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6245	NC_015052	CGCCA	2	10	2302867	2302876	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6246	NC_015052	CGGC	2	8	2302890	2302897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6247	NC_015052	ACG	2	6	2302906	2302911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6250	NC_015052	ACG	2	6	2303016	2303021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6253	NC_015052	AGG	2	6	2303113	2303118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6257	NC_015052	CGC	2	6	2303389	2303394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6261	NC_015052	CACGA	2	10	2303579	2303588	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6262	NC_015052	GAC	3	9	2303592	2303600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_015052	CAC	2	6	2303605	2303610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6264	NC_015052	TTC	2	6	2303679	2303684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6265	NC_015052	CCG	2	6	2303712	2303717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6268	NC_015052	GCCC	2	8	2304008	2304015	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6275	NC_015052	CCCAT	2	10	2304407	2304416	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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6283	NC_015052	AAGG	2	8	2304700	2304707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6284	NC_015052	A	6	6	2304716	2304721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6295	NC_015052	GGTG	2	8	2305993	2306000	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6296	NC_015052	TGA	2	6	2306011	2306016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6332	NC_015052	TCC	2	6	2314072	2314077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6375	NC_015052	ACAG	2	8	2332085	2332092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6376	NC_015052	TG	3	6	2333550	2333555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6384	NC_015052	CAG	3	9	2345520	2345528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6385	NC_015052	CTG	2	6	2345532	2345537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6386	NC_015052	TTG	2	6	2345549	2345554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6387	NC_015052	GAA	2	6	2345579	2345584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6388	NC_015052	GAA	2	6	2345603	2345608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6389	NC_015052	ACATTG	2	12	2345696	2345707	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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6391	NC_015052	TAT	2	6	2345733	2345738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6392	NC_015052	C	9	9	2345739	2345747	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6393	NC_015052	CAT	2	6	2345777	2345782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6395	NC_015052	CTC	2	6	2345897	2345902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6396	NC_015052	CT	3	6	2346005	2346010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6422	NC_015052	TCGG	2	8	2355614	2355621	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6432	NC_015052	CTG	2	6	2359385	2359390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6434	NC_015052	GGCT	2	8	2359544	2359551	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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6452	NC_015052	TCTTT	2	10	2363593	2363602	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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6480	NC_015052	TGCA	2	8	2384244	2384251	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6490	NC_015052	TTCCT	2	10	2386889	2386898	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6491	NC_015052	GCCG	2	8	2386907	2386914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6492	NC_015052	GAC	2	6	2387002	2387007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6497	NC_015052	TTTCC	2	10	2387204	2387213	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6498	NC_015052	TCCA	2	8	2387223	2387230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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