MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis 157F chromosome

Total Repeats: 6575

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015052	TGT	2	6	2096698	2096703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_015052	GTA	2	6	2096706	2096711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_015052	TA	3	6	2096727	2096732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_015052	TTA	2	6	2096835	2096840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_015052	TTC	2	6	2096848	2096853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_015052	GCA	2	6	2096877	2096882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_015052	CG	3	6	2097759	2097764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_015052	TCA	2	6	2097778	2097783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_015052	GCTG	2	8	2097864	2097871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_015052	A	7	7	2097883	2097889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_015052	CGCCC	2	10	2097896	2097905	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5512	NC_015052	TCC	2	6	2097981	2097986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_015052	GCA	2	6	2098002	2098007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_015052	AACGCC	2	12	2098009	2098020	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_015052	CCG	2	6	2098024	2098029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5516	NC_015052	GAGG	2	8	2098128	2098135	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_015052	TC	3	6	2098159	2098164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5518	NC_015052	CT	3	6	2111446	2111451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_015052	AGAGG	2	10	2111456	2111465	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_015052	CA	3	6	2111478	2111483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_015052	CG	4	8	2111519	2111526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_015052	A	6	6	2111563	2111568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_015052	CCG	2	6	2111579	2111584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_015052	GC	3	6	2111598	2111603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_015052	AAG	2	6	2111610	2111615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_015052	AAATCG	2	12	2111649	2111660	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5527	NC_015052	GACCG	2	10	2111760	2111769	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5528	NC_015052	CGC	2	6	2111782	2111787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_015052	CCA	2	6	2111827	2111832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_015052	CCG	2	6	2111869	2111874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5531	NC_015052	CATC	2	8	2111886	2111893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_015052	CCGC	2	8	2111899	2111906	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5533	NC_015052	CTA	2	6	2112551	2112556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_015052	GCTA	2	8	2112557	2112564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_015052	AAC	2	6	2113648	2113653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_015052	AT	3	6	2113704	2113709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_015052	CAG	2	6	2116592	2116597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_015052	TTCC	2	8	2117427	2117434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_015052	CCT	2	6	2118303	2118308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_015052	AC	3	6	2121099	2121104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_015052	GGGCCG	2	12	2121186	2121197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_015052	GCG	3	9	2121260	2121268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_015052	GCC	2	6	2121366	2121371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_015052	TCT	2	6	2121377	2121382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_015052	GGC	2	6	2121418	2121423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_015052	AGG	2	6	2121507	2121512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_015052	CCT	2	6	2121804	2121809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5548	NC_015052	ACG	2	6	2121852	2121857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_015052	CGA	2	6	2121932	2121937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_015052	CGT	2	6	2122088	2122093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_015052	TGCACT	2	12	2122115	2122126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_015052	ACC	2	6	2122537	2122542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_015052	CG	3	6	2122715	2122720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_015052	GGC	2	6	2122722	2122727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_015052	ACC	2	6	2122824	2122829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_015052	GGC	2	6	2122849	2122854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_015052	CCA	2	6	2122919	2122924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5558	NC_015052	ACC	2	6	2122990	2122995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_015052	CGGC	2	8	2123000	2123007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5560	NC_015052	CTA	2	6	2123036	2123041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_015052	CCCGGA	2	12	2123094	2123105	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5562	NC_015052	GGC	2	6	2123131	2123136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_015052	GGT	2	6	2123391	2123396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_015052	GCT	2	6	2123470	2123475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_015052	CCT	2	6	2123486	2123491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_015052	GAC	2	6	2123547	2123552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_015052	CGA	3	9	2123573	2123581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_015052	CCG	2	6	2123592	2123597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5569	NC_015052	GA	3	6	2123729	2123734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_015052	C	6	6	2123785	2123790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5571	NC_015052	TCC	2	6	2123815	2123820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_015052	ATC	2	6	2123859	2123864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_015052	CTCCC	2	10	2124048	2124057	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5574	NC_015052	GCCG	2	8	2124278	2124285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_015052	AC	3	6	2124300	2124305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_015052	CG	3	6	2124323	2124328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_015052	CAT	2	6	2124365	2124370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_015052	TCGC	2	8	2124377	2124384	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5579	NC_015052	ACT	2	6	2124386	2124391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_015052	C	6	6	2124442	2124447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5581	NC_015052	CGGT	2	8	2124473	2124480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5582	NC_015052	GGC	2	6	2124521	2124526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_015052	CCA	2	6	2124584	2124589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_015052	GCAA	2	8	2124599	2124606	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5585	NC_015052	CA	3	6	2124607	2124612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5586	NC_015052	CATG	2	8	2124618	2124625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_015052	CGC	2	6	2124626	2124631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5588	NC_015052	GAC	2	6	2124655	2124660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_015052	ATC	2	6	2124663	2124668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_015052	TTCGA	2	10	2124711	2124720	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5591	NC_015052	CCA	2	6	2124786	2124791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_015052	CGGC	2	8	2124821	2124828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_015052	ACG	2	6	2124837	2124842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_015052	ACC	2	6	2124906	2124911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_015052	CACC	2	8	2124916	2124923	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5596	NC_015052	CGG	2	6	2124931	2124936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5597	NC_015052	ACG	2	6	2124947	2124952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_015052	CGC	2	6	2124972	2124977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_015052	CG	3	6	2124993	2124998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_015052	AGG	2	6	2125044	2125049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_015052	TGC	2	6	2125159	2125164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_015052	GT	3	6	2125188	2125193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_015052	TCCGC	2	10	2125308	2125317	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5604	NC_015052	CGC	2	6	2125320	2125325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_015052	ATG	2	6	2125383	2125388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_015052	TCC	2	6	2125409	2125414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5607	NC_015052	CGG	2	6	2125425	2125430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_015052	CACGA	2	10	2125510	2125519	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5609	NC_015052	GAC	3	9	2125523	2125531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_015052	CAC	2	6	2125536	2125541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_015052	TTC	2	6	2125610	2125615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_015052	CCG	2	6	2125643	2125648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_015052	CTC	2	6	2125827	2125832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5614	NC_015052	TTC	2	6	2125874	2125879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_015052	GCCC	2	8	2125939	2125946	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5616	NC_015052	CGA	2	6	2125995	2126000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_015052	AAT	2	6	2126025	2126030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_015052	GCT	2	6	2126065	2126070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_015052	ACTC	2	8	2126106	2126113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5620	NC_015052	CTG	2	6	2126213	2126218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_015052	CCG	2	6	2126312	2126317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5622	NC_015052	CCCAT	2	10	2126338	2126347	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5623	NC_015052	AGA	2	6	2126365	2126370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_015052	ACC	2	6	2126400	2126405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_015052	GGTC	2	8	2126438	2126445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5626	NC_015052	CAC	2	6	2126473	2126478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_015052	CGC	2	6	2126524	2126529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_015052	A	8	8	2126565	2126572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_015052	CAAAA	2	10	2126604	2126613	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5630	NC_015052	AAGG	2	8	2126632	2126639	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_015052	A	6	6	2126648	2126653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5763	NC_015052	TGCG	2	8	2172288	2172295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5764	NC_015052	TGA	2	6	2173017	2173022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5889	NC_015052	GCG	2	6	2228076	2228081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5890	NC_015052	GCG	2	6	2228117	2228122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5891	NC_015052	CCGA	2	8	2229140	2229147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5893	NC_015052	CG	3	6	2231515	2231520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5894	NC_015052	AGC	2	6	2231521	2231526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5895	NC_015052	CGA	2	6	2231601	2231606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5896	NC_015052	TAC	2	6	2231622	2231627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5897	NC_015052	ATCA	2	8	2231663	2231670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5898	NC_015052	AT	3	6	2233218	2233223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5899	NC_015052	TC	3	6	2233236	2233241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5905	NC_015052	GC	3	6	2233566	2233571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5938	NC_015052	CGC	2	6	2238719	2238724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5956	NC_015052	TCAG	2	8	2245295	2245302	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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