MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis BSn5 chromosome

Total Repeats: 12312

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014976	TAA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014976	ACTTT	2	10	1459	1468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014976	TAG	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014976	CTT	2	6	1600	1605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014976	AGTA	2	8	1631	1638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014976	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014976	TAA	2	6	1692	1697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014976	A	6	6	1707	1712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014976	T	6	6	1717	1722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014976	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014976	TGC	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014976	T	6	6	5754	5759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014976	CAA	2	6	5811	5816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014976	GAT	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014976	TTCT	2	8	5885	5892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014976	TA	3	6	5916	5921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014976	TAT	2	6	5946	5951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014976	TTTA	2	8	5952	5959	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014976	TA	3	6	6011	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014976	T	6	6	6059	6064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014976	TAC	2	6	6084	6089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014976	AGAA	2	8	6093	6100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014976	ACA	2	6	6126	6131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014976	ATG	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014976	TTGA	2	8	6193	6200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014976	CCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_014976	ATT	2	6	6699	6704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014976	CAGT	2	8	6734	6741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014976	GTT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014976	TTG	2	6	6773	6778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014976	TTG	2	6	6804	6809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014976	ATGA	2	8	7447	7454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014976	AGT	2	6	8390	8395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014976	AGG	2	6	8411	8416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014976	GAA	2	6	8431	8436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014976	CATT	2	8	8438	8445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014976	AAGA	2	8	8446	8453	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014976	ATC	2	6	8850	8855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014976	TTTA	2	8	8891	8898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014976	GA	3	6	8925	8930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014976	GCTTAG	2	12	8965	8976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014976	AAT	2	6	9094	9099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014976	GCA	2	6	9201	9206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014976	TG	3	6	9260	9265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014976	ATT	2	6	9304	9309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014976	T	6	6	10258	10263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014976	A	6	6	10275	10280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014976	AGTTC	2	10	10301	10310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014976	ACA	2	6	10324	10329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014976	ATT	2	6	10709	10714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014976	A	6	6	10716	10721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014976	TAAT	2	8	10785	10792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014976	TAT	2	6	11290	11295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014976	TAA	2	6	11314	11319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014976	AGT	2	6	11346	11351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014976	GA	3	6	11437	11442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014976	ATT	2	6	11476	11481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014976	GAA	2	6	11485	11490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014976	TTA	2	6	11504	11509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014976	TGAAA	2	10	11546	11555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014976	GC	3	6	11577	11582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014976	GCTT	2	8	11631	11638	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014976	AT	3	6	11654	11659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014976	AATG	2	8	11663	11670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014976	CAG	2	6	11686	11691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014976	TAA	2	6	11715	11720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014976	TTAA	2	8	11729	11736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014976	TAT	2	6	11767	11772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014976	A	7	7	12132	12138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014976	ATT	2	6	12185	12190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014976	TC	3	6	12289	12294	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014976	ATT	2	6	12317	12322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014976	GTT	2	6	12353	12358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014976	AAAG	2	8	12412	12419	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014976	CG	3	6	12560	12565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014976	T	6	6	12800	12805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014976	AGTA	2	8	12824	12831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014976	A	6	6	12844	12849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014976	AGA	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014976	A	7	7	12958	12964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014976	AGTT	2	8	13003	13010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014976	CAA	2	6	13019	13024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014976	TA	3	6	13069	13074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014976	TGGA	2	8	13075	13082	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014976	T	7	7	13233	13239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014976	TGC	2	6	13270	13275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014976	GAG	3	9	14752	14760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014976	A	7	7	16462	16468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014976	TCCAT	2	10	16490	16499	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014976	A	6	6	16500	16505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014976	TAT	2	6	17727	17732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014976	A	6	6	17748	17753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014976	A	8	8	17756	17763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014976	TGA	2	6	17776	17781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014976	TA	3	6	17785	17790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014976	AGTT	2	8	17802	17809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014976	ACA	2	6	17817	17822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014976	ATTT	2	8	17885	17892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014976	TTCCT	2	10	19303	19312	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014976	TTG	2	6	19318	19323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014976	ATTT	2	8	19351	19358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014976	T	6	6	19370	19375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014976	GAA	2	6	20922	20927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014976	ATCA	2	8	20937	20944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014976	TCA	3	9	20942	20950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014976	TGA	2	6	20959	20964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014976	CTT	2	6	20974	20979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014976	CAG	2	6	21034	21039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014976	ACGA	2	8	21045	21052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014976	AAG	2	6	21083	21088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014976	ACG	2	6	21137	21142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014976	ATG	2	6	21163	21168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014976	AC	3	6	21186	21191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014976	T	6	6	21224	21229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014976	CAT	2	6	21309	21314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014976	TGC	2	6	21353	21358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014976	T	7	7	21359	21365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014976	AACA	2	8	21366	21373	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014976	CAT	3	9	22058	22066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014976	T	6	6	22083	22088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014976	CATCAC	2	12	22164	22175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014976	AAAT	2	8	22183	22190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014976	ATA	2	6	22201	22206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014976	ATA	2	6	22234	22239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014976	AAT	2	6	22251	22256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014976	TAC	2	6	22270	22275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014976	AAC	2	6	22281	22286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014976	TTA	2	6	22400	22405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014976	TAA	2	6	22414	22419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014976	ATGA	2	8	22437	22444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014976	ATCGAA	2	12	22447	22458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014976	TC	3	6	23859	23864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014976	AGG	2	6	23872	23877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014976	T	7	7	23880	23886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014976	A	6	6	23895	23900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014976	CTTC	3	12	25138	25149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014976	ACC	2	6	25165	25170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014976	TTG	2	6	25195	25200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014976	GAT	2	6	25201	25206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014976	TTATT	2	10	25213	25222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014976	ATT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014976	T	7	7	25380	25386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014976	GAT	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014976	GTT	2	6	25432	25437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014976	GAA	2	6	25447	25452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014976	GAG	2	6	25463	25468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014976	TA	3	6	25544	25549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014976	TAAG	2	8	25577	25584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014976	AAAT	2	8	26522	26529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014976	TG	3	6	26548	26553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014976	TTAA	2	8	26627	26634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014976	TAA	2	6	26676	26681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014976	TGCTT	2	10	26730	26739	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
154	NC_014976	T	6	6	26738	26743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014976	C	6	6	26772	26777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
156	NC_014976	TA	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014976	TAT	2	6	26832	26837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_014976	TAA	2	6	27009	27014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_014976	A	6	6	27111	27116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014976	AATA	2	8	27138	27145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014976	TCC	2	6	27427	27432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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167	NC_014976	ATGGT	2	10	27472	27481	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014976	AAAAC	2	10	27530	27539	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_014976	GA	4	8	27558	27565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014976	ATA	2	6	27584	27589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_014976	TGAA	2	8	27800	27807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014976	AG	3	6	27811	27816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014976	ATTT	2	8	27818	27825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014976	AAAG	2	8	27827	27834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014976	AGTG	2	8	28117	28124	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_014976	TAA	2	6	28182	28187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014976	AAG	2	6	28211	28216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_014976	TGC	2	6	29511	29516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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198	NC_014976	TA	3	6	30306	30311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014976	TA	3	6	30374	30379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_014976	T	6	6	48800	48805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_014976	AAATT	2	10	49092	49101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_014976	T	6	6	116344	116349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_014976	CCGT	3	12	116458	116469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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439	NC_014976	CTT	2	6	116562	116567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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441	NC_014976	GTC	2	6	116693	116698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_014976	GCT	2	6	116981	116986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_014976	TCA	2	6	117371	117376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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460	NC_014976	ATT	2	6	117943	117948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_014976	TTC	2	6	119410	119415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_014976	GCA	2	6	119644	119649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
486	NC_014976	ATGTG	2	10	119699	119708	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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