MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia rhizoxinica HKI 454 chromosome

Total Repeats: 6068

< Previous12345678910111213Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014722	CG	3	6	2724674	2724679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6002	NC_014722	TGC	2	6	2724683	2724688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_014722	TCAT	2	8	2734341	2734348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_014722	ACG	2	6	2734369	2734374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014722	CG	3	6	2737735	2737740	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_014722	CGT	2	6	2737783	2737788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014722	GAC	2	6	2737792	2737797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014722	CGG	2	6	2737819	2737824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014722	CGC	2	6	2737851	2737856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_014722	GC	3	6	2737969	2737974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6011	NC_014722	TCA	2	6	2737981	2737986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014722	ATG	2	6	2739239	2739244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014722	CTC	2	6	2739352	2739357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6014	NC_014722	GTG	2	6	2741429	2741434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_014722	CAA	2	6	2741556	2741561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014722	TTG	2	6	2743765	2743770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014722	CTGC	2	8	2743815	2743822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_014722	GCCT	2	8	2743846	2743853	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_014722	TGCG	2	8	2743878	2743885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_014722	AGT	2	6	2744061	2744066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014722	GC	3	6	2744095	2744100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_014722	GGCTA	2	10	2744104	2744113	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6023	NC_014722	GCT	2	6	2744117	2744122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014722	TGC	2	6	2744246	2744251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014722	AGC	2	6	2744361	2744366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_014722	TCAC	2	8	2744398	2744405	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6027	NC_014722	CCA	2	6	2744409	2744414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6028	NC_014722	AGC	2	6	2744430	2744435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014722	T	6	6	2744448	2744453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014722	TTA	2	6	2744471	2744476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014722	TC	3	6	2744521	2744526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_014722	GGC	2	6	2744617	2744622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014722	GC	3	6	2744703	2744708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6034	NC_014722	AGT	2	6	2744709	2744714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_014722	CGAG	2	8	2744752	2744759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6036	NC_014722	AAGC	2	8	2744905	2744912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6037	NC_014722	CGG	2	6	2744917	2744922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_014722	ACA	2	6	2744931	2744936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_014722	GTC	2	6	2744971	2744976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6040	NC_014722	AGCC	2	8	2746079	2746086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6041	NC_014722	A	6	6	2746790	2746795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_014722	GT	4	8	2746844	2746851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014722	ACA	2	6	2746855	2746860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_014722	TGC	2	6	2746869	2746874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_014722	CGC	2	6	2746913	2746918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6046	NC_014722	CG	3	6	2747956	2747961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_014722	TGG	2	6	2748131	2748136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014722	TGA	2	6	2748244	2748249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014722	GCG	2	6	2749197	2749202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014722	CGC	2	6	2749246	2749251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_014722	CGC	2	6	2749425	2749430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_014722	GCG	2	6	2749442	2749447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014722	CGG	2	6	2749458	2749463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014722	A	7	7	2749810	2749816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014722	TCA	2	6	2749841	2749846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014722	ACG	2	6	2749893	2749898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014722	GAT	2	6	2749902	2749907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014722	GC	3	6	2749931	2749936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6059	NC_014722	GCA	2	6	2749943	2749948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_014722	ATC	2	6	2750230	2750235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014722	CTC	2	6	2750287	2750292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_014722	AAC	2	6	2751797	2751802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_014722	CCGG	2	8	2752174	2752181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6064	NC_014722	GAA	4	12	2752182	2752193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014722	GCG	2	6	2753878	2753883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_014722	CGC	2	6	2755084	2755089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_014722	GCC	2	6	2755094	2755099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_014722	GAA	2	6	2755158	2755163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678910111213Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.