MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis BMB171 chromosome

Total Repeats: 27912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014171	T	8	8	8	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014171	TTATC	2	10	60	69	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014171	T	7	7	135	141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014171	ACG	2	6	167	172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014171	TATT	2	8	215	222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014171	TTG	2	6	234	239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014171	AGG	2	6	270	275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014171	TAGA	2	8	1677	1684	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014171	CTATTA	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014171	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014171	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014171	ATTA	2	8	1760	1767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014171	TTTA	2	8	3025	3032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014171	TCT	2	6	6420	6425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014171	ATGT	2	8	6438	6445	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014171	AGG	2	6	6462	6467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014171	CT	3	6	8964	8969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014171	T	7	7	8973	8979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014171	ATA	3	9	8980	8988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014171	TA	3	6	9011	9016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014171	GA	3	6	9036	9041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014171	A	7	7	9053	9059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014171	TTG	2	6	9061	9066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014171	ATA	2	6	9073	9078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014171	AT	3	6	9086	9091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014171	AAAC	2	8	9137	9144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014171	TTTTA	2	10	9161	9170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014171	AACT	2	8	9182	9189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014171	GGC	2	6	9227	9232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014171	GCG	2	6	9289	9294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014171	GGC	2	6	9401	9406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014171	ATGG	2	8	9421	9428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014171	GCA	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014171	CGC	2	6	9595	9600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014171	GTGA	2	8	9601	9608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014171	TGT	2	6	9634	9639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014171	GAA	2	6	9644	9649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014171	CAG	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014171	ATT	2	6	9758	9763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014171	GC	4	8	9773	9780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014171	GGT	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014171	AGA	2	6	9858	9863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014171	GGA	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014171	GAA	2	6	10172	10177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014171	GGT	2	6	10246	10251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014171	GTC	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014171	TCGTG	2	10	10269	10278	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014171	CAT	2	6	10328	10333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014171	GGA	2	6	10372	10377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014171	ATC	2	6	10396	10401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014171	AC	3	6	10423	10428	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014171	AC	3	6	10592	10597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014171	CAC	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014171	AGCC	2	8	10655	10662	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014171	GAT	2	6	10678	10683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014171	CCT	2	6	10734	10739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014171	GCT	2	6	10761	10766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014171	TTTCGT	2	12	10787	10798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014171	AGCC	2	8	10881	10888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_014171	GAT	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014171	CCT	2	6	10960	10965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_014171	TGA	2	6	10979	10984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014171	TCA	2	6	10992	10997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014171	GA	3	6	11031	11036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014171	TC	3	6	11041	11046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014171	AT	3	6	11047	11052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014171	ATGT	2	8	11055	11062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014171	T	6	6	11095	11100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014171	GTAA	2	8	11200	11207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014171	CCA	2	6	11253	11258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014171	T	6	6	11321	11326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014171	GTAA	2	8	11426	11433	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014171	CCA	2	6	11466	11471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014171	ATGGT	2	10	11478	11487	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014171	AGAC	2	8	11516	11523	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014171	GGA	2	6	11551	11556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014171	GCG	2	6	11585	11590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014171	CGT	2	6	11698	11703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014171	AAC	2	6	11711	11716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014171	TC	3	6	11736	11741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014171	CGG	2	6	11760	11765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014171	GGA	2	6	11792	11797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014171	CACG	2	8	12122	12129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014171	GT	3	6	12395	12400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014171	AGC	2	6	12454	12459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014171	ACC	2	6	12532	12537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014171	TGG	2	6	12613	12618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014171	ACA	2	6	12763	12768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014171	ACC	2	6	12784	12789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014171	AGA	2	6	12827	12832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014171	GAG	2	6	13014	13019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014171	GA	3	6	13037	13042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014171	CT	3	6	13154	13159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014171	CTGAA	2	10	13242	13251	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014171	CGG	2	6	13263	13268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014171	TGG	2	6	13525	13530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014171	CCT	2	6	13621	13626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014171	GGT	2	6	13757	13762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014171	CGT	2	6	13952	13957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014171	CGT	2	6	13978	13983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014171	GAG	2	6	14001	14006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014171	GTT	2	6	14055	14060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014171	C	6	6	14128	14133	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_014171	GAT	2	6	14179	14184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014171	ATA	2	6	14261	14266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014171	TGA	2	6	14314	14319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014171	AG	3	6	14324	14329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014171	CT	3	6	14366	14371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014171	AT	4	8	15496	15503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014171	CTA	2	6	15537	15542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014171	ATA	2	6	15543	15548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014171	TA	3	6	17045	17050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014171	T	9	9	17082	17090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014171	CTC	2	6	18464	18469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_014171	T	9	9	18481	18489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014171	AGT	2	6	18521	18526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014171	TAGT	2	8	18541	18548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014171	G	6	6	18607	18612	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014171	AG	3	6	20216	20221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014171	TGGT	2	8	20226	20233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014171	ATCC	2	8	20259	20266	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014171	TGGAA	2	10	20267	20276	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014171	TA	3	6	20393	20398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014171	T	6	6	20409	20414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014171	TAAAA	2	10	20423	20432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014171	GGA	2	6	20433	20438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014171	TA	3	6	20440	20445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014171	TTTCC	2	10	21800	21809	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014171	ATTT	2	8	21815	21822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014171	TAG	2	6	21823	21828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014171	ATATT	2	10	21853	21862	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014171	GGC	2	6	21923	21928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014171	CG	3	6	21935	21940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014171	CCT	2	6	21959	21964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014171	ACA	2	6	21978	21983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014171	TTTTA	2	10	22032	22041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014171	TTA	2	6	22080	22085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014171	GAT	2	6	22100	22105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014171	TCC	2	6	23875	23880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014171	ACT	2	6	23903	23908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014171	ATT	2	6	23925	23930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014171	AGCG	2	8	23946	23953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014171	AT	3	6	23985	23990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014171	CT	3	6	24544	24549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_014171	T	6	6	24549	24554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014171	GTA	2	6	24594	24599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014171	TAAG	2	8	25319	25326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014171	GGAA	2	8	25381	25388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014171	GCA	2	6	25389	25394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014171	TCT	2	6	25404	25409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_014171	TA	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014171	T	6	6	25531	25536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014171	TAA	2	6	25579	25584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014171	ATA	2	6	25590	25595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014171	GAGG	2	8	25602	25609	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014171	AGG	2	6	27317	27322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_014171	T	6	6	28543	28548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014171	TTTA	2	8	28566	28573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014171	TGC	2	6	28590	28595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014171	T	6	6	28611	28616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014171	TTGTC	2	10	28618	28627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014171	TCAT	2	8	28649	28656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_014171	AGG	2	6	28658	28663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014171	ATT	2	6	28940	28945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014171	T	7	7	28952	28958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014171	TAA	2	6	28996	29001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014171	GAAA	2	8	29016	29023	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_014171	GTT	2	6	29027	29032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_014171	AACT	2	8	29149	29156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
175	NC_014171	GGC	2	6	29194	29199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_014171	ATT	2	6	29725	29730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014171	GC	4	8	29740	29747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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189	NC_014171	GGA	2	6	29875	29880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_014171	ATAG	2	8	34798	34805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014171	GAAT	2	8	34807	34814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_014171	TA	4	8	41512	41519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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278	NC_014171	T	7	7	41596	41602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014171	TG	3	6	43851	43856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014171	T	6	6	43864	43869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014171	CT	3	6	43879	43884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
288	NC_014171	GTA	2	6	43902	43907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014171	TTA	2	6	43922	43927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_014171	TAG	2	6	44793	44798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014171	TGA	2	6	44802	44807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_014171	AC	3	6	84071	84076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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