MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 18672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014150	AAT	2	6	2	7	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014150	ATA	2	6	21	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014150	TAA	2	6	49	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014150	GAT	2	6	89	94	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014150	A	7	7	1531	1537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014150	A	6	6	1541	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014150	AT	3	6	1563	1568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014150	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014150	CCT	2	6	1616	1621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014150	T	6	6	1635	1640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014150	T	6	6	1654	1659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014150	TA	3	6	1687	1692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014150	ATA	2	6	1704	1709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014150	T	7	7	1721	1727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014150	ATA	2	6	1728	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014150	ATA	2	6	1742	1747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014150	TATT	2	8	1751	1758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014150	CAT	2	6	1782	1787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014150	T	6	6	1820	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014150	AT	3	6	1826	1831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014150	TAA	2	6	1845	1850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014150	AAT	2	6	1863	1868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014150	AT	3	6	1878	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014150	TTTG	2	8	1907	1914	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014150	T	6	6	1927	1932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014150	A	7	7	1950	1956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014150	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014150	AT	4	8	1982	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014150	TAA	3	9	2021	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014150	AT	3	6	2910	2915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014150	AACA	2	8	2916	2923	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014150	A	6	6	2954	2959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014150	ATTA	2	8	2961	2968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014150	AAT	2	6	2969	2974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014150	AT	3	6	4935	4940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014150	T	6	6	4968	4973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014150	TA	3	6	5012	5017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014150	ATT	2	6	5028	5033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014150	AAT	2	6	5047	5052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014150	ATTA	2	8	5099	5106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014150	TAA	2	6	6409	6414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014150	TA	3	6	6416	6421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014150	T	6	6	6422	6427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014150	AAT	2	6	6460	6465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014150	T	7	7	6512	6518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014150	ATA	2	6	6524	6529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014150	AAT	2	6	7251	7256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014150	AT	3	6	7263	7268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014150	ATA	2	6	7597	7602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014150	ATATT	2	10	8737	8746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014150	T	6	6	8767	8772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014150	AT	3	6	8806	8811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014150	TAAT	2	8	8826	8833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014150	AT	3	6	8832	8837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014150	T	6	6	9915	9920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014150	AT	3	6	9933	9938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014150	TA	3	6	9956	9961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014150	AT	3	6	10014	10019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014150	T	6	6	10039	10044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014150	TGC	2	6	10068	10073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014150	AAT	2	6	10108	10113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014150	CTT	2	6	10177	10182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014150	AAG	2	6	10200	10205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014150	ATTT	2	8	10248	10255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014150	TA	3	6	10279	10284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014150	TAA	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014150	ATTA	2	8	13296	13303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014150	T	8	8	13312	13319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014150	ATG	2	6	13322	13327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014150	A	6	6	13329	13334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014150	TAT	2	6	13340	13345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014150	ATT	2	6	13347	13352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014150	TTAA	2	8	13448	13455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014150	AT	3	6	13464	13469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014150	TA	3	6	13470	13475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014150	TTA	3	9	13476	13484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014150	ATTT	2	8	13501	13508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014150	TC	3	6	15548	15553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014150	TAAA	2	8	15555	15562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014150	TAA	2	6	15569	15574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014150	TTA	2	6	15575	15580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014150	TAA	2	6	16790	16795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014150	T	6	6	16798	16803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014150	AT	3	6	16815	16820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014150	AT	4	8	17533	17540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014150	AT	3	6	17583	17588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014150	TAA	2	6	17603	17608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014150	A	7	7	17607	17613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014150	ATTT	2	8	17641	17648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014150	TTTGAT	2	12	17652	17663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014150	TAA	2	6	17716	17721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014150	T	8	8	17730	17737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014150	AT	3	6	17766	17771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014150	TAA	2	6	17775	17780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014150	CGG	2	6	17791	17796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014150	ATC	2	6	17835	17840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014150	CGC	2	6	17855	17860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014150	ATT	2	6	19785	19790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014150	TAT	2	6	21270	21275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014150	ATT	2	6	21281	21286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014150	T	7	7	21285	21291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014150	TATAAA	2	12	22475	22486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014150	TA	3	6	23163	23168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014150	TATT	2	8	23174	23181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014150	ATA	2	6	23182	23187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014150	AT	6	12	23191	23202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014150	T	8	8	23219	23226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014150	TAT	2	6	23259	23264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014150	TTTA	2	8	23293	23300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014150	ATT	2	6	23309	23314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014150	A	6	6	23317	23322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014150	TAAT	2	8	27138	27145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014150	ATG	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014150	ATT	2	6	27182	27187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014150	T	6	6	27196	27201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014150	TAA	2	6	27209	27214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014150	TTTA	2	8	27215	27222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014150	T	6	6	27224	27229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014150	TAAT	2	8	27236	27243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014150	A	7	7	27272	27278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014150	T	6	6	27299	27304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014150	TA	3	6	27308	27313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014150	TAA	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014150	TA	3	6	29873	29878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014150	T	6	6	29898	29903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014150	ATA	2	6	29919	29924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014150	TAT	2	6	29931	29936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014150	TAT	2	6	29949	29954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014150	T	7	7	29954	29960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014150	AT	3	6	29983	29988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014150	A	6	6	30027	30032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014150	ATA	2	6	30061	30066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014150	AT	3	6	30096	30101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014150	AT	3	6	30107	30112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014150	ATTA	2	8	30116	30123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014150	T	6	6	30124	30129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014150	ATTT	2	8	30143	30150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014150	TAA	2	6	30155	30160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014150	ATATT	2	10	30161	30170	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014150	TTTA	2	8	30187	30194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014150	A	6	6	30209	30214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014150	TAAA	2	8	30215	30222	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014150	A	6	6	30220	30225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014150	TA	3	6	30227	30232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014150	T	6	6	30238	30243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014150	TAT	2	6	30255	30260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014150	ATT	2	6	31617	31622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014150	ATA	2	6	31623	31628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014150	TA	3	6	31627	31632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014150	ATT	2	6	34135	34140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014150	AAT	2	6	34146	34151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014150	TTTATT	2	12	35366	35377	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014150	TAT	2	6	35380	35385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014150	TATT	2	8	38034	38041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014150	AAT	3	9	38073	38081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014150	TTTAA	2	10	38086	38095	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014150	ATTAT	2	10	38096	38105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014150	A	6	6	38135	38140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014150	TTTA	2	8	38146	38153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014150	ATT	2	6	38193	38198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014150	TTA	2	6	38221	38226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014150	TAT	2	6	38248	38253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014150	AAT	2	6	38259	38264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014150	TAA	2	6	38273	38278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014150	TA	3	6	38319	38324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014150	T	6	6	38325	38330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_014150	TAA	2	6	42370	42375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_014150	TAA	2	6	43503	43508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014150	ATT	2	6	43518	43523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014150	AT	3	6	44676	44681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_014150	TAT	2	6	48057	48062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014150	ATT	3	9	48078	48086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_014150	A	7	7	49265	49271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_014150	T	6	6	69642	69647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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