MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Brachyspira murdochii DSM 12563 chromosome

Total Repeats: 18672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014150	AATT	2	8	119596	119603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014150	TAA	2	6	120242	120247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014150	TTTA	2	8	120250	120257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014150	T	6	6	120287	120292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014150	AAT	2	6	120321	120326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014150	ATA	2	6	120339	120344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014150	TAAT	2	8	120345	120352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014150	TTA	2	6	120373	120378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014150	TAT	2	6	121096	121101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014150	GAA	2	6	121168	121173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014150	TTTG	2	8	121177	121184	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014150	T	6	6	121186	121191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014150	TA	3	6	121213	121218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014150	ACAA	2	8	121276	121283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_014150	AT	3	6	121292	121297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_014150	TA	4	8	121298	121305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014150	TTA	2	6	121313	121318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014150	A	7	7	121333	121339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014150	TTTA	2	8	121365	121372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014150	TAA	2	6	121398	121403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014150	AT	3	6	121425	121430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014150	AGA	2	6	121446	121451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014150	T	6	6	121461	121466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014150	ATA	2	6	121469	121474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014150	A	7	7	121474	121480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014150	TAT	2	6	121530	121535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014150	TAA	2	6	121565	121570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014150	A	7	7	121569	121575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014150	A	6	6	121591	121596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014150	GAAA	2	8	121599	121606	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014150	TAT	2	6	121632	121637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014150	A	7	7	121772	121778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014150	TTA	2	6	121875	121880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014150	TAAAGA	2	12	121907	121918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014150	ATTAT	2	10	121931	121940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014150	ATA	2	6	121954	121959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014150	AAT	2	6	121964	121969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014150	GGC	2	6	121989	121994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_014150	AAT	2	6	122005	122010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014150	T	6	6	122033	122038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014150	TTA	2	6	123355	123360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014150	TAA	3	9	125006	125014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014150	TAA	2	6	125033	125038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014150	TAT	2	6	125049	125054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014150	AT	3	6	125053	125058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014150	T	6	6	125128	125133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014150	T	6	6	125145	125150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014150	ATA	2	6	125167	125172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014150	AAT	2	6	125211	125216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014150	TAT	2	6	125230	125235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014150	TAA	2	6	125254	125259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014150	AAT	2	6	125260	125265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014150	T	6	6	125270	125275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014150	TAT	2	6	126460	126465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014150	TAATTT	2	12	126476	126487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014150	AT	3	6	126492	126497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014150	ATT	2	6	126499	126504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014150	A	6	6	126505	126510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014150	T	6	6	128313	128318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014150	AAAT	2	8	128327	128334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014150	A	6	6	130732	130737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014150	TAA	2	6	130758	130763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014150	TA	3	6	134001	134006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014150	AT	3	6	134042	134047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014150	TTTA	2	8	134062	134069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014150	TAA	3	9	134084	134092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014150	ATA	2	6	135504	135509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014150	TA	3	6	135517	135522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014150	T	7	7	135525	135531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014150	T	7	7	135548	135554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014150	T	6	6	135562	135567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014150	T	6	6	136546	136551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014150	TTTTA	2	10	136570	136579	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014150	TTAATT	2	12	136603	136614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014150	CA	3	6	136637	136642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_014150	GCACA	3	15	136643	136657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
577	NC_014150	A	6	6	136666	136671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_014150	A	7	7	136752	136758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014150	A	7	7	136764	136770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014150	TCA	2	6	136805	136810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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585	NC_014150	TAAT	2	8	136821	136828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014150	ATA	2	6	136851	136856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014150	TTA	2	6	136857	136862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014150	ATA	2	6	136868	136873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014150	T	6	6	137249	137254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_014150	ATA	3	9	139925	139933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014150	ATTT	2	8	139945	139952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014150	TAT	2	6	139985	139990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014150	ATA	2	6	140027	140032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014150	CAT	2	6	140081	140086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_014150	ATT	2	6	140139	140144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014150	ATT	2	6	140216	140221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014150	T	6	6	140220	140225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014150	ATA	2	6	140306	140311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014150	ATC	2	6	140321	140326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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602	NC_014150	A	7	7	140411	140417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014150	CTA	2	6	140419	140424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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605	NC_014150	T	6	6	140470	140475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014150	CAT	2	6	140506	140511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014150	AT	5	10	140510	140519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014150	GTA	2	6	140535	140540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014150	ATT	2	6	140579	140584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014150	TAT	2	6	140588	140593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014150	ATT	2	6	140594	140599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014150	ATC	2	6	140637	140642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014150	TTA	2	6	140709	140714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014150	T	8	8	140729	140736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014150	TTA	2	6	140745	140750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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617	NC_014150	AGG	2	6	140777	140782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014150	TTTA	2	8	140783	140790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014150	TA	3	6	140789	140794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014150	TGA	2	6	140799	140804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014150	ATTT	2	8	140813	140820	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014150	TTC	2	6	140830	140835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_014150	TTG	2	6	140840	140845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014150	TTTA	2	8	140930	140937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014150	TTA	2	6	140941	140946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014150	ACTA	2	8	140979	140986	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
627	NC_014150	ATTA	2	8	141016	141023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014150	ATA	2	6	141043	141048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014150	A	6	6	141048	141053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014150	TAT	2	6	141078	141083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014150	AT	3	6	141098	141103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014150	T	6	6	141153	141158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014150	CAA	2	6	141170	141175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014150	AGC	2	6	141189	141194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_014150	TCC	2	6	141195	141200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_014150	ATT	2	6	141378	141383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014150	T	6	6	141382	141387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014150	ATT	2	6	141391	141396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014150	CAT	2	6	141416	141421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014150	TAT	2	6	141447	141452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_014150	T	7	7	141509	141515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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