MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brucella microti CCM 4915 chromosome 1

Total Repeats: 5123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013119	TCCC	2	8	2071380	2071387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5002	NC_013119	TTCTTT	2	12	2071392	2071403	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5003	NC_013119	GCT	2	6	2071457	2071462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_013119	TGA	2	6	2074309	2074314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013119	TC	3	6	2074332	2074337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_013119	CGG	2	6	2075928	2075933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_013119	GGC	2	6	2075972	2075977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013119	GGC	2	6	2076746	2076751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_013119	TCC	2	6	2076759	2076764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_013119	GGTG	2	8	2076803	2076810	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013119	GGC	2	6	2076852	2076857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_013119	GAT	2	6	2076928	2076933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013119	ATT	2	6	2077046	2077051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013119	CG	5	10	2078390	2078399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_013119	GTTTG	2	10	2080721	2080730	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_013119	CAA	2	6	2080763	2080768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013119	CTT	2	6	2080776	2080781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_013119	CCGG	2	8	2080796	2080803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5019	NC_013119	ACA	2	6	2080847	2080852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_013119	CGG	2	6	2080889	2080894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_013119	CAA	2	6	2083021	2083026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013119	CGA	2	6	2083051	2083056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013119	CG	3	6	2083098	2083103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_013119	CAGC	2	8	2083159	2083166	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5025	NC_013119	TGC	2	6	2083183	2083188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_013119	TGC	2	6	2083233	2083238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_013119	GCC	2	6	2083293	2083298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013119	GC	4	8	2083316	2083323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5029	NC_013119	GTG	2	6	2083470	2083475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_013119	GGT	2	6	2083483	2083488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013119	GAG	2	6	2083544	2083549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013119	GCG	2	6	2083560	2083565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_013119	GTG	2	6	2083619	2083624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_013119	CG	3	6	2083632	2083637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_013119	GCG	2	6	2083698	2083703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013119	GC	3	6	2083802	2083807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_013119	CG	3	6	2083848	2083853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5038	NC_013119	GCG	2	6	2083874	2083879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_013119	ATCTGC	2	12	2083908	2083919	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_013119	TCG	2	6	2084046	2084051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_013119	CGC	2	6	2084142	2084147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_013119	CGA	2	6	2084173	2084178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_013119	GAG	2	6	2084186	2084191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_013119	GAT	2	6	2084263	2084268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013119	GATG	2	8	2084278	2084285	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013119	TGG	2	6	2084322	2084327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_013119	CCTG	2	8	2084344	2084351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_013119	TCA	2	6	2084352	2084357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_013119	ACA	2	6	2084364	2084369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_013119	ATT	2	6	2084387	2084392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013119	ATG	3	9	2084454	2084462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013119	GTTT	2	8	2084539	2084546	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013119	A	6	6	2084657	2084662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013119	CGA	2	6	2084666	2084671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_013119	GCAG	2	8	2085671	2085678	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_013119	A	7	7	2085718	2085724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_013119	CTG	2	6	2085779	2085784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_013119	TCCG	2	8	2086337	2086344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_013119	GTC	2	6	2086397	2086402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_013119	TGG	2	6	2089060	2089065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_013119	GAACA	2	10	2089127	2089136	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5062	NC_013119	TGAA	2	8	2089137	2089144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_013119	GAG	2	6	2089158	2089163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_013119	CGG	2	6	2089620	2089625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_013119	A	6	6	2091814	2091819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_013119	TA	3	6	2091834	2091839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_013119	T	6	6	2091892	2091897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013119	GA	3	6	2092672	2092677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_013119	GCG	2	6	2094349	2094354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_013119	ACAAA	2	10	2094522	2094531	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5071	NC_013119	ACAAA	2	10	2094585	2094594	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5072	NC_013119	TTG	2	6	2094655	2094660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_013119	TGA	2	6	2094687	2094692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013119	GGC	2	6	2098332	2098337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_013119	TG	3	6	2098434	2098439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013119	TGTGC	2	10	2098510	2098519	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5077	NC_013119	GGGC	2	8	2098540	2098547	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_013119	AAG	2	6	2098558	2098563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_013119	GC	3	6	2100008	2100013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_013119	G	6	6	2100015	2100020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013119	ATTT	2	8	2100025	2100032	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013119	GAC	2	6	2100120	2100125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013119	CCCGG	2	10	2100128	2100137	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5084	NC_013119	ACCCG	2	10	2100516	2100525	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5085	NC_013119	CGGAT	2	10	2100541	2100550	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5086	NC_013119	GCAG	2	8	2100599	2100606	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_013119	TCT	2	6	2102883	2102888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_013119	GC	3	6	2102901	2102906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_013119	GC	3	6	2102913	2102918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_013119	GCC	2	6	2104014	2104019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_013119	G	6	6	2106155	2106160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013119	T	6	6	2106232	2106237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013119	CGGC	2	8	2106822	2106829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_013119	AT	3	6	2106959	2106964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013119	AAG	2	6	2107522	2107527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013119	T	6	6	2107541	2107546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_013119	ATC	2	6	2108429	2108434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_013119	A	6	6	2108435	2108440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013119	TTTC	2	8	2109129	2109136	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_013119	TCTTTG	2	12	2109148	2109159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5101	NC_013119	CGC	2	6	2109163	2109168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_013119	AGG	2	6	2109222	2109227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_013119	GGC	2	6	2109330	2109335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_013119	GGCTT	2	10	2111206	2111215	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5105	NC_013119	TC	3	6	2113909	2113914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_013119	AAAG	2	8	2114020	2114027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013119	AGAA	2	8	2114047	2114054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_013119	GAG	2	6	2114304	2114309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_013119	CAAA	2	8	2114324	2114331	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5110	NC_013119	GAAA	2	8	2114449	2114456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013119	TGA	2	6	2115446	2115451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_013119	AGG	2	6	2115452	2115457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_013119	GGATG	2	10	2116289	2116298	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_013119	TGC	2	6	2116396	2116401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013119	CG	3	6	2116454	2116459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_013119	GCT	2	6	2116466	2116471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013119	GCCC	2	8	2116478	2116485	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5118	NC_013119	GGC	2	6	2116493	2116498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_013119	AG	3	6	2116566	2116571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013119	A	6	6	2116924	2116929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_013119	AGC	2	6	2116941	2116946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_013119	GGC	2	6	2117005	2117010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_013119	CATG	2	8	2117022	2117029	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.