MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bartonella grahamii as4aup plasmid pBGR3

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012847	ATTT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012847	TATT	2	8	20	27	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012847	ATT	3	9	41	49	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012847	TAA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012847	TA	4	8	187	194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012847	TA	3	6	204	209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012847	T	6	6	220	225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012847	TGAG	2	8	873	880	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012847	ACC	2	6	925	930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_012847	TTG	2	6	933	938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012847	AT	3	6	963	968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012847	AATA	2	8	982	989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012847	ATAA	2	8	990	997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012847	ATTT	2	8	1003	1010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012847	ATA	2	6	1031	1036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012847	AT	3	6	1781	1786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012847	A	6	6	1797	1802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012847	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012847	T	6	6	1844	1849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012847	A	6	6	1913	1918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012847	AT	3	6	2394	2399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012847	TTA	2	6	2418	2423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012847	AAT	2	6	2437	2442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012847	TAAAA	2	10	2528	2537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012847	ATC	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012847	TCTT	2	8	2594	2601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012847	TCT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012847	TAA	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012847	AAT	2	6	2853	2858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012847	TAAA	2	8	2862	2869	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012847	TA	3	6	2879	2884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012847	GA	4	8	2895	2902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012847	TCAAAA	2	12	2961	2972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012847	CCT	2	6	2990	2995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012847	A	6	6	3006	3011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012847	ATTT	2	8	3048	3055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012847	TA	3	6	3058	3063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012847	CT	3	6	4423	4428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012847	A	8	8	4438	4445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012847	TAAAT	2	10	4497	4506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012847	TAATT	2	10	4522	4531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012847	ATTTA	4	20	4534	4553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012847	TTTGG	2	10	4555	4564	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012847	T	7	7	4632	4638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012847	A	6	6	4679	4684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012847	A	10	10	4709	4718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012847	T	6	6	4752	4757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012847	ACA	2	6	4783	4788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012847	AAC	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012847	AAT	2	6	4880	4885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012847	CCA	2	6	4905	4910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012847	TGTA	2	8	4916	4923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012847	TGA	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012847	GA	3	6	4988	4993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012847	ATA	2	6	5005	5010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012847	ATA	3	9	5053	5061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012847	AT	3	6	5074	5079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012847	T	6	6	5131	5136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012847	ATTA	2	8	5141	5148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012847	TAG	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012847	A	6	6	5182	5187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012847	T	6	6	5191	5196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012847	GGAT	2	8	5206	5213	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012847	TTAAT	2	10	5228	5237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012847	ATT	2	6	9433	9438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012847	AAT	2	6	9451	9456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012847	ACA	2	6	12262	12267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012847	TAAA	2	8	14472	14479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012847	TCAT	2	8	14480	14487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_012847	AT	3	6	14486	14491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012847	CCT	2	6	14734	14739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_012847	CTT	2	6	14748	14753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012847	TG	3	6	14755	14760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012847	TAA	2	6	14775	14780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012847	TCC	2	6	16514	16519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_012847	TTG	2	6	16521	16526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012847	TAT	2	6	16532	16537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012847	A	6	6	20302	20307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012847	AAT	2	6	20326	20331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012847	TTTTA	2	10	20347	20356	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012847	A	7	7	20389	20395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012847	T	6	6	20400	20405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012847	A	6	6	20476	20481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012847	AAAG	2	8	20484	20491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012847	A	6	6	20764	20769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012847	GGA	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012847	TTCG	2	8	22921	22928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_012847	A	7	7	23183	23189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012847	ATTTT	2	10	23191	23200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012847	T	6	6	23197	23202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012847	A	7	7	23215	23221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012847	TGT	2	6	23266	23271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012847	AAT	2	6	23732	23737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012847	TCA	2	6	23777	23782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012847	CTG	2	6	23792	23797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012847	ATACAG	2	12	23824	23835	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012847	AG	3	6	23837	23842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012847	A	7	7	23846	23852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012847	TAA	2	6	23853	23858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012847	TAG	2	6	23864	23869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012847	AAT	2	6	23890	23895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012847	TCT	2	6	23925	23930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012847	GA	3	6	24248	24253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012847	TAA	2	6	24587	24592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012847	TTTTA	2	10	25044	25053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012847	TTAT	2	8	25061	25068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012847	TA	3	6	25074	25079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012847	AAT	2	6	25080	25085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012847	T	6	6	25102	25107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012847	C	6	6	25154	25159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
111	NC_012847	TGT	2	6	25917	25922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012847	TAT	2	6	25942	25947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012847	CAGT	2	8	26000	26007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_012847	AAAG	2	8	26019	26026	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012847	T	6	6	26112	26117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012847	T	6	6	26122	26127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012847	ATA	2	6	26128	26133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012847	TCTT	2	8	26176	26183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_012847	GTA	2	6	26186	26191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012847	A	6	6	26412	26417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012847	TAA	2	6	26422	26427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012847	A	6	6	26426	26431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012847	ATT	2	6	26457	26462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012847	TGAG	2	8	26466	26473	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012847	AAT	2	6	26493	26498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012847	G	6	6	26677	26682	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012847	TACA	2	8	27070	27077	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012847	TCT	2	6	27082	27087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012847	TTA	2	6	27113	27118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012847	ATA	2	6	27135	27140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012847	AAT	2	6	27141	27146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.