MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_cp26

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012129	AAG	2	6	33	38	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012129	T	6	6	359	364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012129	TA	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012129	TTA	2	6	772	777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012129	A	6	6	829	834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012129	A	6	6	2232	2237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012129	ACCT	2	8	2255	2262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012129	AT	3	6	2263	2268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012129	TAAAT	2	10	2269	2278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012129	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012129	T	7	7	2381	2387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012129	AAAT	2	8	2388	2395	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012129	TAT	2	6	2398	2403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012129	A	7	7	2409	2415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012129	A	7	7	2473	2479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012129	TCC	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012129	TAATT	2	10	3874	3883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012129	AAT	2	6	3884	3889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012129	ATTA	2	8	3891	3898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012129	A	6	6	3906	3911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012129	CTA	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012129	TAAA	2	8	3930	3937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012129	ATT	2	6	3938	3943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012129	AT	3	6	3952	3957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012129	TATAA	2	10	3960	3969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012129	TAT	2	6	3972	3977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012129	AT	3	6	3981	3986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012129	ATTA	2	8	3995	4002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012129	TAAA	2	8	4019	4026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012129	TAA	2	6	5833	5838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012129	TAA	2	6	6506	6511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012129	A	6	6	6523	6528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012129	TTC	2	6	6539	6544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012129	AAT	2	6	6545	6550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012129	TA	3	6	6592	6597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012129	ACTTT	2	10	7699	7708	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012129	T	7	7	7706	7712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012129	TAT	2	6	7721	7726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012129	A	7	7	8693	8699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012129	TAG	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012129	ACT	2	6	9990	9995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012129	A	6	6	10603	10608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012129	A	7	7	10628	10634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012129	TA	3	6	10643	10648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012129	TA	3	6	10655	10660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012129	TTG	2	6	10684	10689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012129	AAT	2	6	10699	10704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012129	TA	3	6	10770	10775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012129	A	8	8	10818	10825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012129	A	7	7	11358	11364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012129	ATA	3	9	11381	11389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012129	T	6	6	11392	11397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012129	TAA	2	6	11421	11426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012129	ATTA	2	8	11427	11434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012129	AATT	2	8	11477	11484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012129	ATT	2	6	11491	11496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012129	TAT	2	6	11510	11515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012129	AAT	2	6	11548	11553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012129	A	6	6	11571	11576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012129	A	6	6	11585	11590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012129	TAT	2	6	11626	11631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012129	TTAA	2	8	11642	11649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012129	AAT	2	6	11693	11698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012129	ATT	2	6	11704	11709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012129	A	6	6	11790	11795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012129	ATTTA	2	10	11889	11898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012129	T	6	6	11920	11925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012129	ATTT	2	8	11940	11947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012129	T	7	7	11945	11951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012129	A	6	6	11955	11960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012129	TAA	2	6	11961	11966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012129	TATAT	2	10	11970	11979	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012129	AAT	2	6	11998	12003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012129	ATT	2	6	12016	12021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012129	TA	3	6	12024	12029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012129	T	7	7	12071	12077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012129	TAA	2	6	12106	12111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012129	ATT	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012129	A	7	7	12165	12171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012129	A	8	8	12205	12212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012129	GAA	2	6	12287	12292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012129	AAT	2	6	12317	12322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012129	T	6	6	12328	12333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012129	AAT	2	6	12334	12339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012129	AT	3	6	12361	12366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012129	AAATTT	2	12	12382	12393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012129	TATTT	2	10	14017	14026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012129	T	7	7	14024	14030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012129	A	6	6	14031	14036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012129	AAT	2	6	14091	14096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012129	A	6	6	14097	14102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012129	TTCT	2	8	14107	14114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_012129	TTA	2	6	14129	14134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012129	ATG	2	6	14201	14206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012129	ATT	2	6	14213	14218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012129	ATAA	2	8	17062	17069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012129	TTA	3	9	17075	17083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012129	TCATT	2	10	17088	17097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012129	ATTA	2	8	17151	17158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012129	AAT	2	6	17182	17187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012129	ATT	2	6	17225	17230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012129	T	8	8	17229	17236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012129	A	6	6	17241	17246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012129	A	6	6	17250	17255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012129	TTG	2	6	17261	17266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012129	TAA	2	6	17270	17275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012129	AGG	2	6	17286	17291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012129	CTT	2	6	18114	18119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012129	TAA	2	6	18131	18136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012129	GAAA	2	8	18238	18245	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012129	T	7	7	18256	18262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012129	T	6	6	18276	18281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012129	T	6	6	18326	18331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012129	ATTTT	2	10	19721	19730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012129	CTA	2	6	19770	19775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012129	GTA	2	6	19783	19788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012129	TAAAT	2	10	19790	19799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012129	TAA	3	9	21200	21208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012129	TTATA	2	10	22235	22244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012129	TAA	2	6	23554	23559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012129	TAAAG	2	10	23562	23571	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012129	TA	3	6	23586	23591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012129	TGT	2	6	24878	24883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012129	AATTA	2	10	24890	24899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012129	ACA	2	6	24905	24910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012129	TTA	2	6	24936	24941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012129	AATTT	2	10	24949	24958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012129	AAT	2	6	24961	24966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012129	TAA	3	9	24999	25007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012129	A	6	6	25006	25011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012129	AAATT	2	10	25016	25025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012129	AAT	2	6	25029	25034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012129	TAT	2	6	25086	25091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012129	TAT	2	6	25144	25149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012129	ATTA	2	8	25154	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012129	TAAT	3	12	25165	25176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012129	TAA	2	6	25184	25189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012129	ATATA	2	10	26842	26851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.