MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_cp32-12

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011735	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011735	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011735	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011735	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011735	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011735	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011735	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011735	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011735	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011735	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011735	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011735	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011735	T	6	6	629	634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011735	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011735	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011735	AGC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011735	AAT	2	6	720	725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011735	TCT	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011735	T	6	6	752	757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011735	AAT	2	6	858	863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011735	TTA	2	6	907	912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011735	AGG	2	6	934	939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011735	ATTA	2	8	947	954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011735	ATG	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011735	ATT	2	6	1051	1056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011735	GAA	2	6	1164	1169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011735	TAA	2	6	1244	1249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011735	GAG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011735	ATT	2	6	1277	1282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011735	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011735	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011735	G	6	6	7819	7824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011735	TA	3	6	15091	15096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011735	TAAAAA	2	12	15106	15117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011735	ACA	2	6	16420	16425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011735	CTC	2	6	16990	16995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011735	AAT	3	9	17004	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011735	TC	3	6	17049	17054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011735	ATTTT	2	10	17107	17116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011735	TGT	2	6	17126	17131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011735	TCAA	2	8	17770	17777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011735	ATT	2	6	17792	17797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011735	AGC	2	6	17806	17811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011735	TCC	2	6	18859	18864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011735	TAA	2	6	18877	18882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011735	T	6	6	18917	18922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011735	T	7	7	18994	19000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011735	A	6	6	19025	19030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011735	TAC	2	6	19042	19047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011735	GTA	2	6	19055	19060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011735	ATTAA	2	10	19125	19134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011735	T	7	7	19151	19157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011735	TAA	2	6	19195	19200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011735	ATT	2	6	19204	19209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011735	T	6	6	21679	21684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011735	TAA	2	6	22865	22870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011735	T	6	6	22906	22911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011735	TTTTA	2	10	22935	22944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011735	ACAAAT	2	12	22945	22956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011735	TTG	2	6	22988	22993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011735	AAT	2	6	23007	23012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011735	TAA	2	6	23016	23021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011735	TTA	2	6	23045	23050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011735	TAA	2	6	23071	23076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011735	ATTA	2	8	23084	23091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011735	TAA	2	6	23092	23097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011735	ATATGT	2	12	23136	23147	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011735	A	6	6	23154	23159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011735	T	6	6	23239	23244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011735	T	6	6	23250	23255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011735	A	6	6	23258	23263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011735	ATA	2	6	23291	23296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011735	TTA	2	6	23298	23303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011735	GGA	2	6	23316	23321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011735	A	6	6	24667	24672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011735	A	7	7	24675	24681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011735	AGG	2	6	24694	24699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011735	ATTA	2	8	24700	24707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011735	AAGTAA	2	12	25950	25961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011735	CAAAAA	2	12	25996	26007	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011735	A	7	7	26003	26009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011735	TG	3	6	26021	26026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011735	TGCA	2	8	26036	26043	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011735	AGA	2	6	26075	26080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011735	AAGA	2	8	26104	26111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011735	AT	3	6	26128	26133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011735	GA	3	6	26203	26208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011735	TA	3	6	26275	26280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011735	TATT	2	8	26301	26308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011735	TAA	2	6	27077	27082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011735	T	7	7	27092	27098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011735	TGT	2	6	27150	27155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011735	TTAT	2	8	27156	27163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011735	CT	3	6	27167	27172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011735	TAA	2	6	27758	27763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011735	AATA	2	8	27769	27776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011735	ATA	2	6	27806	27811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011735	GTT	2	6	27858	27863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011735	CAAA	2	8	28466	28473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011735	ACA	2	6	28481	28486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011735	AAAT	2	8	28504	28511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011735	AT	3	6	28521	28526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011735	TTC	2	6	28549	28554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011735	AATT	2	8	28555	28562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011735	GAA	2	6	28574	28579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011735	A	7	7	28599	28605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011735	AAT	2	6	28628	28633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011735	AGA	2	6	28638	28643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011735	TAA	2	6	28744	28749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011735	CTT	2	6	28820	28825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011735	AT	3	6	28861	28866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011735	TGAT	2	8	28869	28876	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011735	TGG	2	6	28897	28902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011735	AGG	2	6	28995	29000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011735	TAT	2	6	29032	29037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011735	ATC	2	6	29055	29060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011735	TAA	2	6	29089	29094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011735	TGC	2	6	29139	29144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011735	CAT	2	6	29193	29198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011735	AGTG	2	8	29219	29226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011735	AGCA	2	8	29230	29237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011735	AAAT	2	8	29256	29263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011735	TGA	2	6	29269	29274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011735	TGA	2	6	29362	29367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011735	TAT	2	6	29372	29377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011735	TAT	2	6	29419	29424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011735	ATA	2	6	29487	29492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011735	TGG	2	6	29503	29508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011735	AAG	2	6	29533	29538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011735	TAA	2	6	29584	29589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011735	CAG	2	6	29653	29658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011735	TTC	2	6	29659	29664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011735	ATG	3	9	29709	29717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011735	GCA	2	6	29735	29740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011735	TGT	2	6	29748	29753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011735	AG	3	6	29765	29770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.