MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_011593	TGCG	2	8	2710786	2710793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8002	NC_011593	GCCG	2	8	2710794	2710801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_011593	GTCA	2	8	2710821	2710828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8004	NC_011593	TCAG	2	8	2710833	2710840	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8005	NC_011593	TCC	2	6	2712610	2712615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_011593	C	9	9	2716830	2716838	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8007	NC_011593	CTT	2	6	2716885	2716890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_011593	AGT	2	6	2717018	2717023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_011593	CCG	2	6	2717024	2717029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_011593	CGC	2	6	2717050	2717055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8011	NC_011593	GCA	2	6	2717058	2717063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_011593	CAT	2	6	2717077	2717082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_011593	AT	3	6	2718633	2718638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_011593	TC	3	6	2718650	2718655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8015	NC_011593	AG	3	6	2718661	2718666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_011593	GCTGA	2	10	2718722	2718731	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8017	NC_011593	TCA	2	6	2718744	2718749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_011593	GTGTCC	2	12	2720015	2720026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_011593	TG	3	6	2720057	2720062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_011593	TTCA	2	8	2720128	2720135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_011593	G	6	6	2720220	2720225	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_011593	AAG	2	6	2720243	2720248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_011593	TCA	2	6	2720308	2720313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_011593	CAC	2	6	2720408	2720413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8025	NC_011593	CTT	2	6	2720731	2720736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_011593	T	6	6	2720742	2720747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_011593	A	6	6	2720830	2720835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_011593	CGG	2	6	2720842	2720847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_011593	GCC	2	6	2720853	2720858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8030	NC_011593	GA	5	10	2720863	2720872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_011593	AG	3	6	2720873	2720878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_011593	AAG	2	6	2720879	2720884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_011593	GAA	2	6	2720903	2720908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_011593	TCT	2	6	2720943	2720948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_011593	CGCC	2	8	2721024	2721031	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8036	NC_011593	ACC	2	6	2721080	2721085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_011593	GC	3	6	2723288	2723293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_011593	GCT	2	6	2724355	2724360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_011593	CTC	2	6	2725494	2725499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_011593	GGC	2	6	2725554	2725559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_011593	TG	3	6	2725637	2725642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_011593	TCC	2	6	2725680	2725685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8043	NC_011593	TG	3	6	2725727	2725732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_011593	ACC	2	6	2726942	2726947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8045	NC_011593	AC	3	6	2726950	2726955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8046	NC_011593	GAAT	2	8	2727042	2727049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_011593	CGAA	2	8	2727101	2727108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8048	NC_011593	CAA	2	6	2727168	2727173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_011593	GCCCG	2	10	2727254	2727263	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8050	NC_011593	CGC	2	6	2727274	2727279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_011593	TGG	2	6	2727291	2727296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_011593	ATC	2	6	2728332	2728337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_011593	TCAG	2	8	2728390	2728397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_011593	G	8	8	2730368	2730375	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_011593	TGTGG	2	10	2732287	2732296	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_011593	GGTT	2	8	2732302	2732309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_011593	GTG	2	6	2732316	2732321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_011593	TTAC	2	8	2732362	2732369	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8059	NC_011593	GCC	2	6	2732454	2732459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_011593	TCCGTT	2	12	2733029	2733040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_011593	GCG	2	6	2733047	2733052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_011593	GGGCG	2	10	2733127	2733136	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8063	NC_011593	CCG	2	6	2733149	2733154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8064	NC_011593	CCG	2	6	2733159	2733164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_011593	ATTTC	2	10	2734700	2734709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8066	NC_011593	TCT	2	6	2734710	2734715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_011593	CCG	2	6	2734716	2734721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8068	NC_011593	GCTCA	2	10	2734798	2734807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8069	NC_011593	GAT	2	6	2734819	2734824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_011593	A	6	6	2734842	2734847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_011593	CACCAA	2	12	2734856	2734867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_011593	GTT	2	6	2738518	2738523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_011593	CAC	2	6	2739314	2739319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8074	NC_011593	ACA	2	6	2739372	2739377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_011593	CGC	2	6	2741051	2741056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_011593	ACT	2	6	2741807	2741812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_011593	TGC	2	6	2741818	2741823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_011593	CGC	2	6	2741865	2741870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8079	NC_011593	ACG	2	6	2741899	2741904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_011593	TCA	2	6	2741909	2741914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_011593	CGC	2	6	2741922	2741927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8082	NC_011593	CTG	2	6	2741949	2741954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_011593	GAC	2	6	2741984	2741989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_011593	TCC	3	9	2743701	2743709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8085	NC_011593	CTCCAG	2	12	2743888	2743899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_011593	TCT	2	6	2743903	2743908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8087	NC_011593	TA	3	6	2743927	2743932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_011593	CGC	2	6	2743992	2743997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8089	NC_011593	ATCA	3	12	2744000	2744011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8090	NC_011593	CA	3	6	2745097	2745102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8091	NC_011593	CCA	2	6	2745110	2745115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8092	NC_011593	GT	3	6	2745217	2745222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_011593	GCG	2	6	2745239	2745244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_011593	GCG	2	6	2745276	2745281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_011593	GCAC	2	8	2746734	2746741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_011593	TAT	2	6	2746764	2746769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_011593	CTT	2	6	2746781	2746786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8098	NC_011593	GCG	2	6	2746806	2746811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_011593	ATC	2	6	2746820	2746825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_011593	CGAT	2	8	2746931	2746938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_011593	ACA	2	6	2746960	2746965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_011593	CAC	2	6	2747013	2747018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_011593	GCCC	2	8	2747030	2747037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8104	NC_011593	CCA	2	6	2747825	2747830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8105	NC_011593	GAT	2	6	2747854	2747859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_011593	CTA	2	6	2747867	2747872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8107	NC_011593	GAT	2	6	2748273	2748278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_011593	GTTG	2	8	2748286	2748293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_011593	CA	3	6	2748372	2748377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_011593	GTC	2	6	2749255	2749260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_011593	CGA	2	6	2749276	2749281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_011593	TCA	2	6	2749305	2749310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_011593	CCG	2	6	2749340	2749345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_011593	CAG	2	6	2749430	2749435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8115	NC_011593	GTG	2	6	2749447	2749452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_011593	GT	3	6	2754610	2754615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_011593	AGC	2	6	2754635	2754640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_011593	GTC	2	6	2755029	2755034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_011593	CG	3	6	2755035	2755040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_011593	CGCGC	2	10	2755083	2755092	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8121	NC_011593	TG	3	6	2755172	2755177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_011593	GGTT	2	8	2755190	2755197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_011593	GCG	3	9	2755256	2755264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_011593	TC	3	6	2755346	2755351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8125	NC_011593	GCC	2	6	2755362	2755367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8126	NC_011593	TCT	2	6	2755373	2755378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8127	NC_011593	GGC	2	6	2755414	2755419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8128	NC_011593	TCG	2	6	2755483	2755488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_011593	AGG	2	6	2755504	2755509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_011593	ATG	2	6	2755510	2755515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_011593	CAG	2	6	2755636	2755641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_011593	ACG	2	6	2755847	2755852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8135	NC_011593	CGT	2	6	2756083	2756088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8255	NC_011593	GA	3	6	2763888	2763893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_011593	C	6	6	2763944	2763949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8257	NC_011593	TCC	2	6	2763974	2763979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8258	NC_011593	ATC	2	6	2764018	2764023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8392	NC_011593	GAC	2	6	2794793	2794798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8393	NC_011593	TCA	2	6	2794836	2794841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8394	NC_011593	CCG	2	6	2796461	2796466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8395	NC_011593	CGG	2	6	2796502	2796507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8396	NC_011593	ATA	2	6	2796529	2796534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8397	NC_011593	GCC	2	6	2796648	2796653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8398	NC_011593	CTT	2	6	2797927	2797932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8399	NC_011593	TACA	2	8	2799027	2799034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8400	NC_011593	CTT	2	6	2799058	2799063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8401	NC_011593	TG	3	6	2799064	2799069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8402	NC_011593	ACAG	2	8	2799082	2799089	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8405	NC_011593	AAAAG	2	10	2800630	2800639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8410	NC_011593	CG	3	6	2803421	2803426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8411	NC_011593	CGG	2	6	2803431	2803436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8420	NC_011593	C	6	6	2806930	2806935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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8422	NC_011593	AGC	2	6	2807861	2807866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8424	NC_011593	CCA	2	6	2808074	2808079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8425	NC_011593	CCGG	2	8	2808175	2808182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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8427	NC_011593	GA	3	6	2808261	2808266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8428	NC_011593	TCA	2	6	2810537	2810542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8430	NC_011593	CGC	2	6	2810565	2810570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8431	NC_011593	TG	3	6	2810593	2810598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8432	NC_011593	ATG	2	6	2810676	2810681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8433	NC_011593	GCC	2	6	2811803	2811808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8434	NC_011593	GTC	2	6	2811822	2811827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8436	NC_011593	A	6	6	2811860	2811865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8442	NC_011593	CAG	2	6	2812149	2812154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8448	NC_011593	GGC	2	6	2825331	2825336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8462	NC_011593	ATG	2	6	2829123	2829128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8463	NC_011593	ATG	2	6	2829181	2829186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8470	NC_011593	GTT	2	6	2832613	2832618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8471	NC_011593	ACGG	2	8	2832736	2832743	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.