MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697 chromosome

Total Repeats: 8471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011593	CTG	2	6	1637411	1637416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_011593	TGA	2	6	1637419	1637424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_011593	CTG	2	6	1637435	1637440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_011593	TCG	2	6	1637482	1637487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_011593	CCT	2	6	1637502	1637507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_011593	TA	3	6	1637519	1637524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_011593	ACT	2	6	1637540	1637545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_011593	TCC	2	6	1637560	1637565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_011593	CTC	2	6	1638485	1638490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_011593	G	6	6	1638495	1638500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_011593	GAA	2	6	1638502	1638507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_011593	TAC	2	6	1639390	1639395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_011593	GAC	2	6	1639412	1639417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_011593	GAC	2	6	1639438	1639443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_011593	G	6	6	1639509	1639514	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_011593	AGAA	2	8	1640808	1640815	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_011593	CTT	2	6	1640825	1640830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_011593	CGT	2	6	1640868	1640873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_011593	ACT	2	6	1641380	1641385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_011593	CGG	2	6	1641428	1641433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_011593	CCA	2	6	1641441	1641446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_011593	TG	3	6	1641463	1641468	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_011593	GCTC	2	8	1643425	1643432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_011593	CTG	2	6	1643455	1643460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_011593	ACC	2	6	1643467	1643472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_011593	G	6	6	1643505	1643510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_011593	CTGT	2	8	1643517	1643524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_011593	TTA	2	6	1643525	1643530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_011593	TAAT	2	8	1645299	1645306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_011593	GAA	2	6	1645332	1645337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_011593	CGA	2	6	1651604	1651609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_011593	CGGG	2	8	1651613	1651620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_011593	TC	3	6	1652687	1652692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_011593	GCC	2	6	1652701	1652706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_011593	AT	3	6	1652900	1652905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_011593	ATG	2	6	1652944	1652949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_011593	ATG	2	6	1652965	1652970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_011593	CAA	2	6	1653057	1653062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_011593	ACGC	2	8	1653085	1653092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_011593	GAC	2	6	1653095	1653100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_011593	ACA	2	6	1653142	1653147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_011593	CAT	2	6	1653288	1653293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_011593	CCG	2	6	1653323	1653328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5044	NC_011593	TC	4	8	1653420	1653427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_011593	CCATG	2	10	1653432	1653441	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5046	NC_011593	GGC	2	6	1653452	1653457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_011593	ACG	2	6	1654620	1654625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_011593	GGCGA	2	10	1655851	1655860	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5049	NC_011593	TCC	2	6	1657762	1657767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_011593	AC	3	6	1657881	1657886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_011593	AG	3	6	1658279	1658284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_011593	CCGC	2	8	1659225	1659232	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5053	NC_011593	ACA	2	6	1659246	1659251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_011593	GC	3	6	1659342	1659347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_011593	AGC	2	6	1659357	1659362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_011593	GGCAC	2	10	1659408	1659417	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5057	NC_011593	ACG	2	6	1659468	1659473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_011593	TCG	2	6	1659489	1659494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_011593	ACG	2	6	1659521	1659526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_011593	CAG	2	6	1659547	1659552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_011593	TGTCT	2	10	1659609	1659618	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5062	NC_011593	CAC	2	6	1659619	1659624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_011593	TAG	2	6	1659633	1659638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_011593	TCA	2	6	1659648	1659653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_011593	AACC	2	8	1660608	1660615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_011593	AGA	2	6	1660628	1660633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_011593	ATT	2	6	1660644	1660649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_011593	TTG	2	6	1660725	1660730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_011593	CGG	2	6	1660830	1660835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_011593	TTGT	2	8	1660890	1660897	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_011593	GC	3	6	1662324	1662329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_011593	GGAA	2	8	1662385	1662392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_011593	CAT	2	6	1663352	1663357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_011593	GCTC	2	8	1664455	1664462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_011593	ATT	2	6	1664466	1664471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_011593	CGC	2	6	1665640	1665645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_011593	GACT	2	8	1665653	1665660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_011593	C	6	6	1665665	1665670	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5079	NC_011593	GCC	2	6	1665701	1665706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5080	NC_011593	TGC	2	6	1665720	1665725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_011593	GCA	2	6	1665736	1665741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_011593	GA	3	6	1665754	1665759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_011593	CTG	2	6	1665835	1665840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_011593	ATC	2	6	1665848	1665853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_011593	CCT	2	6	1665901	1665906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_011593	CGGT	2	8	1666158	1666165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_011593	TAC	2	6	1666211	1666216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_011593	AAT	2	6	1666822	1666827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_011593	ACG	2	6	1667537	1667542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_011593	GGA	2	6	1667544	1667549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_011593	AAGA	2	8	1667616	1667623	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_011593	ACG	2	6	1669069	1669074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_011593	GCG	2	6	1670067	1670072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_011593	CA	3	6	1670097	1670102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5095	NC_011593	AGG	2	6	1670153	1670158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_011593	AAC	2	6	1671056	1671061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_011593	ATC	2	6	1671084	1671089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_011593	GTT	2	6	1671123	1671128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_011593	GAA	2	6	1672294	1672299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_011593	GAA	2	6	1672387	1672392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_011593	CAA	2	6	1672977	1672982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_011593	CGC	2	6	1672994	1672999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_011593	CG	3	6	1673011	1673016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_011593	GAG	2	6	1673716	1673721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_011593	GCG	2	6	1673753	1673758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_011593	AGTGG	2	10	1673805	1673814	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_011593	ATG	2	6	1673830	1673835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_011593	GCC	2	6	1673842	1673847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_011593	CGT	2	6	1673851	1673856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_011593	AGA	2	6	1674453	1674458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_011593	AGT	2	6	1675570	1675575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_011593	GAA	2	6	1675586	1675591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_011593	GGA	2	6	1676295	1676300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_011593	TGG	2	6	1676358	1676363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_011593	CG	3	6	1677419	1677424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_011593	G	6	6	1677424	1677429	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_011593	GGT	2	6	1677473	1677478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_011593	TGC	2	6	1677520	1677525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_011593	CGA	2	6	1677532	1677537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_011593	GCC	2	6	1677562	1677567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5121	NC_011593	TCA	2	6	1677574	1677579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_011593	GCT	2	6	1677625	1677630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_011593	GGA	2	6	1677631	1677636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_011593	GCA	2	6	1678765	1678770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_011593	ATT	2	6	1679251	1679256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_011593	ACT	2	6	1681848	1681853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_011593	AGG	2	6	1681861	1681866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_011593	G	7	7	1681907	1681913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_011593	GCAC	2	8	1681955	1681962	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_011593	TCG	2	6	1682180	1682185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_011593	AAG	2	6	1682206	1682211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5165	NC_011593	AACC	2	8	1689905	1689912	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5242	NC_011593	CCCAC	2	10	1720641	1720650	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5243	NC_011593	AGGA	2	8	1720655	1720662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_011593	ACCT	2	8	1721909	1721916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5245	NC_011593	T	6	6	1722331	1722336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_011593	A	7	7	1722400	1722406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_011593	CTCAG	2	10	1722456	1722465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5248	NC_011593	CAA	2	6	1722475	1722480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_011593	AGA	2	6	1722483	1722488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_011593	CAAC	2	8	1722551	1722558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5251	NC_011593	CAT	2	6	1722626	1722631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5252	NC_011593	T	6	6	1722738	1722743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_011593	ATTG	2	8	1722754	1722761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_011593	ATCA	2	8	1722790	1722797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_011593	TGA	2	6	1722814	1722819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_011593	CGC	2	6	1722874	1722879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5257	NC_011593	AGT	2	6	1722921	1722926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5258	NC_011593	AATA	2	8	1722934	1722941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_011593	CAG	2	6	1722957	1722962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5260	NC_011593	TCC	2	6	1723493	1723498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5262	NC_011593	ATT	2	6	1723650	1723655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5294	NC_011593	ATT	2	6	1739543	1739548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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