MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl27

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011265	GAT	2	6	1386	1391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011265	TAA	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011265	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011265	GT	3	6	1430	1435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011265	ATT	2	6	1465	1470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011265	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011265	ACA	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011265	ATG	3	9	1573	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011265	AGG	2	6	2032	2037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011265	TAT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011265	ATT	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011265	TAT	2	6	2494	2499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011265	T	8	8	2516	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011265	T	6	6	2531	2536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011265	TGT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011265	A	8	8	2624	2631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011265	CTT	2	6	2653	2658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011265	TAT	2	6	2670	2675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011265	TC	3	6	3542	3547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011265	ATTT	2	8	3577	3584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011265	GCA	2	6	3612	3617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011265	TTCT	2	8	3676	3683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011265	GA	3	6	3717	3722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011265	T	7	7	3734	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011265	T	7	7	3791	3797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011265	TACTTT	2	12	3813	3824	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011265	CTTT	2	8	3843	3850	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011265	AT	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011265	ATT	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011265	TATT	2	8	4379	4386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011265	AATT	2	8	4433	4440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011265	AT	3	6	5016	5021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011265	AGT	3	9	5024	5032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011265	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011265	TAAA	2	8	5144	5151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011265	A	6	6	5149	5154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011265	TCT	2	6	6943	6948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011265	T	8	8	6969	6976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011265	T	6	6	6981	6986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011265	TAT	2	6	6998	7003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011265	T	6	6	7003	7008	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011265	AAT	2	6	7019	7024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011265	ATT	2	6	7034	7039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011265	T	6	6	7038	7043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011265	GAG	2	6	10355	10360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011265	AGG	2	6	14483	14488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011265	AT	3	6	15246	15251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011265	A	6	6	15303	15308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011265	GAAA	2	8	15325	15332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011265	A	8	8	15330	15337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011265	CAAA	2	8	15349	15356	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011265	AGA	2	6	15382	15387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011265	A	6	6	15387	15392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011265	A	8	8	15420	15427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011265	A	6	6	15489	15494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011265	CGT	2	6	15511	15516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011265	TAT	2	6	15528	15533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011265	GGC	2	6	15555	15560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011265	CGG	2	6	15567	15572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011265	TGC	2	6	15585	15590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011265	AGA	2	6	15693	15698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011265	AGA	2	6	15759	15764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011265	ATTA	2	8	15769	15776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011265	CAA	2	6	15816	15821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011265	GAA	2	6	15823	15828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011265	ATT	2	6	15877	15882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011265	GAT	2	6	15883	15888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011265	TGC	3	9	15891	15899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011265	GTA	2	6	15907	15912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011265	TAGAA	2	10	16044	16053	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011265	A	8	8	16059	16066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011265	TGA	2	6	16071	16076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011265	AGA	2	6	16113	16118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011265	A	6	6	16118	16123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011265	AAT	2	6	16129	16134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011265	A	7	7	16211	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011265	GAC	2	6	16251	16256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011265	CAC	2	6	16276	16281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_011265	ACT	2	6	16287	16292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011265	AGG	2	6	16340	16345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011265	TAT	2	6	18737	18742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011265	TTA	2	6	18751	18756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011265	AGG	2	6	19995	20000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011265	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011265	TA	3	6	21546	21551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011265	TAT	2	6	21566	21571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011265	ATT	2	6	21572	21577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011265	GAT	2	6	21597	21602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011265	ATT	3	9	21658	21666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011265	ATT	2	6	21693	21698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011265	CAAAGA	2	12	21762	21773	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011265	A	8	8	21845	21852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011265	A	6	6	21857	21862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011265	TA	3	6	21874	21879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011265	ACA	2	6	21972	21977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011265	AAAC	2	8	21992	21999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011265	ATGG	2	8	22004	22011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011265	A	6	6	22036	22041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011265	ATT	2	6	22075	22080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011265	TTGT	2	8	23800	23807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011265	TGT	2	6	23816	23821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011265	ATT	2	6	23846	23851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011265	TA	3	6	23892	23897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011265	AATA	2	8	23898	23905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011265	AATT	2	8	23916	23923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011265	TA	3	6	23933	23938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011265	A	7	7	23994	24000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011265	CTT	2	6	24018	24023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011265	TTA	2	6	24033	24038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011265	ACC	2	6	24062	24067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011265	CAA	2	6	24102	24107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011265	TAC	3	9	24108	24116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011265	ATA	2	6	24120	24125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011265	TAA	2	6	24132	24137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011265	AT	4	8	24155	24162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011265	ACAT	2	8	24170	24177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011265	TA	3	6	24180	24185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011265	T	6	6	24228	24233	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011265	TAATAT	2	12	24254	24265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011265	TAA	2	6	27325	27330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011265	TAA	2	6	27362	27367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011265	T	8	8	27373	27380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011265	A	8	8	27383	27390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011265	ATT	2	6	27422	27427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011265	ATTT	2	8	27439	27446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.