MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl37

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011258	TTGATA	2	12	161	172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011258	TAA	2	6	192	197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011258	AAC	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011258	ATA	2	6	232	237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011258	GCA	2	6	259	264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011258	TGA	2	6	297	302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011258	TAA	2	6	338	343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011258	ATG	3	9	365	373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011258	A	6	6	421	426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011258	AGA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011258	A	7	7	568	574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011258	A	6	6	600	605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011258	GAA	2	6	638	643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011258	ACA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011258	TTAA	2	8	677	684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011258	GAT	2	6	695	700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011258	ACT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011258	A	6	6	724	729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011258	TTA	2	6	777	782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011258	AGT	2	6	785	790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011258	AAT	2	6	834	839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011258	ATAA	2	8	840	847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011258	AT	3	6	848	853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011258	AG	3	6	880	885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011258	TAT	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011258	TAAA	2	8	945	952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011258	ATT	2	6	960	965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011258	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011258	AT	4	8	997	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011258	TAT	3	9	1002	1010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011258	ATA	3	9	1011	1019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011258	ATT	2	6	1020	1025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011258	ATA	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011258	AAGG	2	8	1056	1063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011258	TAAAA	2	10	1926	1935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011258	AG	3	6	1960	1965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011258	T	6	6	1974	1979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011258	CT	3	6	1980	1985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011258	AT	3	6	2051	2056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011258	TA	3	6	2062	2067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011258	T	7	7	2075	2081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011258	ATA	2	6	2100	2105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011258	TA	3	6	2114	2119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011258	TTA	2	6	2141	2146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011258	TATAT	2	10	2147	2156	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011258	ACAA	2	8	2206	2213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011258	TCA	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011258	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011258	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011258	ACA	2	6	3355	3360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011258	ATA	2	6	3368	3373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011258	ATATTA	2	12	3384	3395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011258	AT	3	6	3401	3406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011258	T	6	6	3435	3440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011258	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011258	ATT	2	6	3471	3476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011258	TAT	2	6	3484	3489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011258	TAA	3	9	3516	3524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011258	CAT	2	6	3552	3557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011258	ATA	2	6	3558	3563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011258	ATT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011258	TAA	2	6	3611	3616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011258	TAT	2	6	3620	3625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011258	T	7	7	3628	3634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011258	TAATT	2	10	3642	3651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011258	TAG	2	6	3657	3662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011258	TAA	2	6	3674	3679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011258	A	8	8	3682	3689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011258	AT	4	8	3701	3708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011258	CAT	3	9	3740	3748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011258	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011258	TAGT	2	8	3808	3815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011258	AAGT	2	8	3837	3844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011258	T	6	6	3883	3888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011258	ATT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011258	GAT	2	6	3905	3910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011258	T	6	6	3940	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011258	TA	3	6	3986	3991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011258	TTC	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011258	TGG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011258	TGAT	2	8	4104	4111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011258	TTTTG	2	10	4135	4144	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011258	A	6	6	4203	4208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011258	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011258	AAT	2	6	4232	4237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011258	TA	3	6	4245	4250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011258	TAT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011258	TAAA	2	8	4289	4296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011258	TTA	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011258	ATT	3	9	4318	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011258	TAA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011258	ATTT	2	8	4349	4356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011258	ATA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011258	AAT	2	6	4372	4377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011258	AT	3	6	4421	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011258	ATAAAA	2	12	4432	4443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011258	CCA	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_011258	T	8	8	4472	4479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011258	A	6	6	4480	4485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011258	TATT	2	8	4497	4504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011258	TTTATA	2	12	4544	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011258	ATT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011258	ATT	2	6	4648	4653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011258	TAA	2	6	4661	4666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011258	TA	3	6	4676	4681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011258	ATT	2	6	4714	4719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011258	AAC	2	6	4727	4732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011258	TTTAA	2	10	4752	4761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011258	AT	3	6	4792	4797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011258	A	7	7	4812	4818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011258	GGT	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011258	TAT	2	6	4891	4896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011258	ATA	2	6	4903	4908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011258	TAAAAT	2	12	4944	4955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011258	ATA	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011258	ATT	2	6	4968	4973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011258	AAT	2	6	5000	5005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011258	TA	3	6	5020	5025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011258	CT	3	6	5090	5095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011258	TA	3	6	5096	5101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011258	ATTA	2	8	5147	5154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011258	TTA	2	6	5194	5199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011258	TGT	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011258	AT	3	6	5281	5286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011258	T	8	8	5297	5304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011258	TTA	2	6	5330	5335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011258	TTA	2	6	5342	5347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011258	ATC	2	6	5391	5396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011258	TAT	2	6	5502	5507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011258	CAG	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011258	TAA	2	6	5577	5582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011258	ATT	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011258	AAAC	2	8	5715	5722	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011258	TAA	3	9	5758	5766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011258	TTA	2	6	5779	5784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011258	TTGT	2	8	5789	5796	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011258	CTT	2	6	5810	5815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011258	TCTT	2	8	5889	5896	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011258	ACT	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011258	ATC	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_011258	AT	3	6	5995	6000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011258	T	6	6	6000	6005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011258	ATT	3	9	6018	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011258	ATT	2	6	6038	6043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011258	AT	3	6	6049	6054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011258	ATT	2	6	6099	6104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011258	TAT	2	6	6128	6133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011258	T	6	6	6133	6138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011258	AAC	2	6	6146	6151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011258	TAT	2	6	6157	6162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011258	ATC	2	6	6169	6174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011258	AT	3	6	7078	7083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011258	TA	3	6	7089	7094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011258	T	6	6	7107	7112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011258	A	7	7	7116	7122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_011258	AAAG	2	8	26622	26629	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
452	NC_011258	CTA	2	6	26663	26668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
453	NC_011258	GCAAGT	2	12	26686	26697	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
454	NC_011258	AGC	2	6	26778	26783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_011258	GAG	2	6	26827	26832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
456	NC_011258	AGA	2	6	26859	26864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_011258	AGG	2	6	26925	26930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
458	NC_011258	AGG	2	6	26982	26987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
459	NC_011258	ATG	2	6	27035	27040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_011258	TCA	2	6	27064	27069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
461	NC_011258	GAGT	2	8	27071	27078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011258	TAAA	2	8	27083	27090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_011258	TTA	2	6	27091	27096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_011258	GAA	2	6	27117	27122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
466	NC_011258	GAA	2	6	27150	27155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_011258	TA	3	6	27206	27211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_011258	AAT	2	6	27218	27223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_011258	CT	3	6	27257	27262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
471	NC_011258	T	6	6	27262	27267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_011258	TA	3	6	27290	27295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_011258	T	6	6	27313	27318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_011258	A	8	8	27338	27345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_011258	ATT	2	6	28499	28504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
476	NC_011258	AG	3	6	28523	28528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_011258	CT	3	6	28540	28545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
478	NC_011258	T	8	8	28545	28552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_011258	T	6	6	28574	28579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_011258	A	6	6	28615	28620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_011258	AGG	2	6	28623	28628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011258	AG	3	6	28676	28681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_011258	AG	4	8	28686	28693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_011258	AG	5	10	28697	28706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_011258	ATT	2	6	29605	29610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_011258	ATA	3	9	29644	29652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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