MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 1515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011246	TCT	2	6	35958	35963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_011246	TAA	2	6	35979	35984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011246	AAT	3	9	36092	36100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011246	T	6	6	36153	36158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011246	TCA	2	6	36167	36172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_011246	AAC	2	6	36184	36189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_011246	ATATG	2	10	36197	36206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
508	NC_011246	TAAAT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011246	A	6	6	36230	36235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011246	TC	3	6	36270	36275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
511	NC_011246	TC	3	6	36326	36331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_011246	TTA	2	6	36388	36393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011246	AATC	2	8	36542	36549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_011246	A	7	7	36558	36564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_011246	TACT	2	8	36596	36603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
516	NC_011246	A	6	6	36612	36617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_011246	ATT	2	6	36654	36659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_011246	TCT	2	6	36662	36667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_011246	CAT	2	6	36671	36676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_011246	AC	3	6	36716	36721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_011246	A	6	6	36732	36737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_011246	TA	5	10	36817	36826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_011246	AT	3	6	36828	36833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_011246	TA	3	6	37473	37478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011246	TACA	2	8	37518	37525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_011246	AATT	2	8	37534	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011246	TAA	2	6	37551	37556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011246	TAT	2	6	37562	37567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_011246	T	6	6	37574	37579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011246	CAAAA	2	10	37591	37600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_011246	A	7	7	37597	37603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011246	ATT	2	6	37610	37615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011246	TAA	2	6	37616	37621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011246	TAC	2	6	37624	37629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_011246	CTAT	2	8	38264	38271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
536	NC_011246	TAC	2	6	38291	38296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_011246	AATAT	2	10	38315	38324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011246	A	7	7	38348	38354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_011246	AAAAT	2	10	38378	38387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011246	A	6	6	38400	38405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011246	CAT	2	6	38800	38805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_011246	ATA	2	6	39239	39244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011246	CTA	2	6	39245	39250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_011246	AT	3	6	39257	39262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011246	CTT	2	6	39317	39322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_011246	TAT	2	6	40536	40541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011246	TTA	2	6	41035	41040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_011246	CAT	2	6	41048	41053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_011246	ATT	2	6	41131	41136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_011246	A	6	6	42052	42057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_011246	AAAT	2	8	42062	42069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_011246	TTA	2	6	42070	42075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011246	CATG	2	8	42097	42104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
554	NC_011246	CAT	2	6	42121	42126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_011246	AT	3	6	42125	42130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011246	ATTT	2	8	42155	42162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_011246	CTAAA	2	10	42202	42211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
558	NC_011246	AAC	2	6	42217	42222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_011246	A	6	6	42235	42240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011246	TCTA	2	8	42243	42250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
561	NC_011246	T	6	6	42264	42269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_011246	T	6	6	42294	42299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_011246	T	6	6	42309	42314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_011246	CAA	2	6	42322	42327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_011246	A	6	6	42338	42343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_011246	AATT	2	8	42392	42399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_011246	ATT	2	6	42421	42426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_011246	TCA	2	6	42443	42448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011246	A	6	6	42455	42460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_011246	AAT	2	6	42466	42471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_011246	AT	3	6	42478	42483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_011246	ACTA	2	8	42485	42492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_011246	TATTT	2	10	42507	42516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011246	AAAC	2	8	42559	42566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
575	NC_011246	ATT	2	6	42618	42623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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577	NC_011246	ATCA	2	8	42676	42683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_011246	CCT	2	6	42721	42726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_011246	A	6	6	42732	42737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011246	AAT	2	6	42759	42764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011246	TAA	2	6	42770	42775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011246	TA	3	6	42784	42789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_011246	ATA	2	6	42793	42798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_011246	AATT	2	8	42800	42807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_011246	TAA	2	6	42824	42829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_011246	ATCT	2	8	42836	42843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
587	NC_011246	AAAAC	2	10	42845	42854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_011246	AT	3	6	42870	42875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_011246	A	6	6	42876	42881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_011246	AAGC	2	8	42905	42912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
591	NC_011246	ATT	2	6	42942	42947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_011246	TATTTT	2	12	42989	43000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_011246	TCTA	2	8	43117	43124	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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600	NC_011246	A	7	7	43960	43966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011246	ATT	2	6	44004	44009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011246	TAT	2	6	44041	44046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011246	TA	3	6	44062	44067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_011246	ATTAA	2	10	44074	44083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_011246	ATT	2	6	44099	44104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_011246	TAA	2	6	44898	44903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_011246	TAA	2	6	44955	44960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_011246	AAT	2	6	45827	45832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_011246	ATA	2	6	45842	45847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_011246	A	6	6	45891	45896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_011246	A	7	7	45901	45907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_011246	A	6	6	45926	45931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_011246	A	7	7	45939	45945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_011246	CTT	2	6	45973	45978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_011246	AT	3	6	45985	45990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011246	ACA	2	6	46004	46009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_011246	TCAA	2	8	46029	46036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
619	NC_011246	TAA	2	6	46089	46094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_011246	ATT	2	6	46852	46857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011246	TAT	3	9	46871	46879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011246	ATA	2	6	46880	46885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011246	AATTT	2	10	46904	46913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011246	ATT	2	6	46920	46925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011246	A	6	6	46926	46931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011246	TAT	2	6	46945	46950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011246	T	6	6	46950	46955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011246	TAA	2	6	46963	46968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011246	A	6	6	46975	46980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_011246	TAA	2	6	47002	47007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_011246	A	6	6	47010	47015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_011246	A	8	8	47017	47024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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635	NC_011246	A	9	9	47040	47048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_011246	A	6	6	47060	47065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_011246	A	8	8	47070	47077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_011246	TA	3	6	47090	47095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_011246	TA	3	6	47100	47105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_011246	CAAT	2	8	47108	47115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
641	NC_011246	TAA	2	6	48098	48103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_011246	CTC	2	6	48106	48111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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644	NC_011246	TTAA	2	8	51462	51469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_011246	T	7	7	51473	51479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_011246	A	6	6	51481	51486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_011246	AAAC	2	8	51517	51524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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