MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	TAT	2	6	9	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011245	ATA	2	6	50	55	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011245	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011245	GAA	2	6	65	70	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011245	TAT	2	6	71	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011245	AT	4	8	97	104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011245	TA	3	6	143	148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011245	AGG	2	6	159	164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011245	CCT	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011245	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011245	AAAT	2	8	1641	1648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011245	A	6	6	1656	1661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011245	TAA	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011245	TAC	2	6	1736	1741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011245	CTTA	2	8	1753	1760	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011245	TAAG	2	8	1777	1784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011245	A	6	6	1810	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011245	T	6	6	1816	1821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011245	AATAC	2	10	1834	1843	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011245	CAA	2	6	1858	1863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011245	ATA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011245	CT	3	6	1898	1903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011245	CTT	2	6	2503	2508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011245	ATTT	2	8	2510	2517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011245	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011245	TTA	2	6	5053	5058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011245	CTTTT	2	10	5069	5078	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011245	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011245	A	6	6	5093	5098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011245	T	6	6	5099	5104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011245	TGT	2	6	5146	5151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011245	ATT	3	9	5152	5160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011245	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011245	AGG	2	6	5188	5193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011245	GAT	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011245	TAA	2	6	6584	6589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011245	TAA	2	6	6599	6604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011245	GT	3	6	6614	6619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011245	ATT	2	6	6649	6654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011245	A	6	6	6655	6660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011245	ACA	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011245	TA	3	6	7222	7227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011245	TAT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011245	ATT	2	6	7681	7686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011245	TAT	2	6	7689	7694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011245	T	9	9	7711	7719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011245	TTAT	2	8	7724	7731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011245	TAAA	2	8	7791	7798	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011245	A	7	7	7796	7802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011245	ATGT	2	8	7804	7811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011245	CT	3	6	7830	7835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011245	ACAT	2	8	7853	7860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011245	T	6	6	7860	7865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011245	T	7	7	7922	7928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011245	A	6	6	7956	7961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011245	CTT	2	6	7983	7988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011245	TAT	2	6	8000	8005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011245	TC	3	6	8863	8868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011245	ATTT	2	8	8898	8905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011245	TAA	2	6	8906	8911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011245	GCA	2	6	8933	8938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011245	TTCT	2	8	8997	9004	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011245	ATTTT	2	10	9007	9016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011245	GA	3	6	9038	9043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011245	T	7	7	9055	9061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011245	T	7	7	9112	9118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011245	CTTT	2	8	9162	9169	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011245	AT	3	6	9665	9670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011245	ATT	2	6	9675	9680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011245	TTG	2	6	9689	9694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011245	AAAT	2	8	9734	9741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011245	TCT	2	6	12195	12200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011245	T	9	9	12220	12228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011245	T	6	6	12233	12238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011245	TTA	2	6	12249	12254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011245	T	6	6	12255	12260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011245	ATAA	2	8	12268	12275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011245	ATT	2	6	12286	12291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011245	T	6	6	12290	12295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011245	AGG	2	6	15661	15666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011245	TCAA	2	8	16236	16243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011245	AGG	2	6	20584	20589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011245	TAT	2	6	25160	25165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011245	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011245	AGG	2	6	26418	26423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011245	TA	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011245	TA	3	6	27973	27978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011245	TAT	2	6	27993	27998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011245	ATT	2	6	27999	28004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011245	GAT	2	6	28024	28029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011245	ATT	3	9	28085	28093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011245	ATT	2	6	28120	28125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011245	CAAAGA	2	12	28189	28200	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011245	A	8	8	28272	28279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011245	A	6	6	28284	28289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011245	T	7	7	28294	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011245	ATA	2	6	28306	28311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011245	TA	3	6	28324	28329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.