MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 2759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011244	T	6	6	813164	813169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_011244	AT	3	6	813653	813658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_011244	TA	3	6	813671	813676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_011244	AATAT	2	10	813682	813691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_011244	AGTATG	2	12	813730	813741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011244	T	6	6	815377	815382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_011244	T	6	6	815384	815389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011244	ATTTT	2	10	815399	815408	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011244	T	8	8	815419	815426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011244	TAA	2	6	815434	815439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_011244	TTGATT	2	12	815454	815465	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011244	TGA	2	6	815467	815472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011244	ATG	2	6	815481	815486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_011244	ATA	2	6	815496	815501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011244	T	7	7	815506	815512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_011244	AGATTT	2	12	815515	815526	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011244	ATT	2	6	815532	815537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_011244	TTA	2	6	815575	815580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011244	TAT	2	6	815583	815588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011244	GAT	2	6	815624	815629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_011244	T	6	6	815665	815670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_011244	AATA	2	8	815671	815678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_011244	A	6	6	815690	815695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011244	TGAGT	2	10	815710	815719	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_011244	GAT	2	6	815720	815725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011244	T	7	7	815794	815800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011244	TTTAT	2	10	815834	815843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011244	AAT	2	6	821021	821026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011244	T	8	8	821113	821120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_011244	T	6	6	821127	821132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011244	TAG	2	6	821140	821145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_011244	AGAT	2	8	821187	821194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_011244	AT	3	6	821193	821198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_011244	TAT	2	6	821210	821215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_011244	CA	3	6	821227	821232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_011244	ATTAT	2	10	821241	821250	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_011244	T	8	8	821250	821257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_011244	ATT	2	6	821285	821290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_011244	TAA	2	6	821296	821301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_011244	AATT	2	8	821315	821322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011244	T	7	7	822431	822437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_011244	AAT	2	6	822439	822444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_011244	TATT	2	8	822445	822452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_011244	TATT	2	8	822462	822469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2545	NC_011244	TG	3	6	822476	822481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_011244	TAATTA	2	12	822507	822518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_011244	TA	4	8	822517	822524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_011244	CAT	2	6	823875	823880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_011244	TAT	2	6	823894	823899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011244	TAC	2	6	823900	823905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_011244	TGG	2	6	823917	823922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_011244	AC	3	6	823932	823937	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_011244	GAG	2	6	823953	823958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_011244	TATT	2	8	825253	825260	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_011244	TTTA	2	8	825267	825274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_011244	T	9	9	825282	825290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_011244	TAT	2	6	825300	825305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011244	TAT	2	6	826224	826229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_011244	TAT	3	9	826241	826249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011244	TAAAT	2	10	826264	826273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_011244	T	6	6	826286	826291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_011244	TTTA	2	8	826299	826306	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011244	ATTT	2	8	826311	826318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_011244	AT	3	6	826335	826340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_011244	T	7	7	826358	826364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_011244	A	6	6	826370	826375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_011244	ATT	2	6	826414	826419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011244	T	6	6	831591	831596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_011244	TAA	2	6	831606	831611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_011244	T	6	6	831635	831640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_011244	TTA	2	6	831660	831665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_011244	AAAT	2	8	831671	831678	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011244	TAT	2	6	831685	831690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011244	TTA	2	6	834412	834417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011244	ACT	2	6	835249	835254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2576	NC_011244	TGATG	2	10	835300	835309	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_011244	AAT	2	6	835332	835337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_011244	TTA	2	6	835346	835351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_011244	ATT	2	6	836721	836726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_011244	TG	3	6	836742	836747	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_011244	T	7	7	836759	836765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_011244	TGAAA	2	10	836778	836787	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_011244	GAA	2	6	836798	836803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2585	NC_011244	TTG	2	6	836810	836815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_011244	TAAC	2	8	836830	836837	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2587	NC_011244	TA	3	6	836859	836864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_011244	TTTG	2	8	839254	839261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_011244	A	7	7	839283	839289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2590	NC_011244	TTG	2	6	839302	839307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_011244	TA	3	6	839335	839340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_011244	ATAAA	2	10	839361	839370	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_011244	T	6	6	839381	839386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_011244	ATTT	2	8	840535	840542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_011244	AATA	2	8	840543	840550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_011244	TAA	2	6	840568	840573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_011244	ATTA	2	8	840576	840583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_011244	TTAA	2	8	840584	840591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_011244	ATTTAA	2	12	840596	840607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011244	TTA	2	6	840625	840630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011244	ATT	2	6	841578	841583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011244	T	6	6	842597	842602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_011244	TAT	2	6	842619	842624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_011244	GTTT	2	8	842635	842642	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011244	TGA	2	6	842646	842651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011244	TTA	2	6	844763	844768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011244	A	8	8	844772	844779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_011244	ATT	2	6	844796	844801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011244	A	6	6	844805	844810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011244	ATA	2	6	845149	845154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011244	GTT	2	6	845206	845211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011244	ATA	2	6	853955	853960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011244	TCCT	2	8	854587	854594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_011244	TA	3	6	855270	855275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011244	AT	4	8	855276	855283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_011244	AT	3	6	862719	862724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_011244	TAA	2	6	863287	863292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011244	TGTT	2	8	865968	865975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_011244	T	7	7	866004	866010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_011244	GAT	2	6	866032	866037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011244	T	7	7	866046	866052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_011244	A	6	6	866071	866076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_011244	TGAT	2	8	866097	866104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_011244	T	6	6	866126	866131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_011244	TTGATT	2	12	866163	866174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_011244	GTT	2	6	866177	866182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_011244	T	6	6	866211	866216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_011244	AT	3	6	866236	866241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_011244	TAT	2	6	866250	866255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_011244	TTAAG	2	10	866358	866367	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_011244	TGA	2	6	866410	866415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_011244	TGA	2	6	866514	866519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2634	NC_011244	TTG	2	6	866535	866540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_011244	ATTTG	2	10	866554	866563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_011244	GATT	2	8	866564	866571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2637	NC_011244	TAA	2	6	866580	866585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_011244	ATA	2	6	872385	872390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2640	NC_011244	TAT	2	6	872402	872407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.