MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia phytofirmans PsJN chromosome 1

Total Repeats: 14245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010681	GT	3	6	421259	421264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010681	AGCG	2	8	421270	421277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_010681	GC	3	6	421334	421339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_010681	AGCG	2	8	422513	422520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_010681	CGC	2	6	422546	422551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_010681	CGTCTC	2	12	422573	422584	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_010681	CGAT	2	8	422591	422598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_010681	CG	4	8	422607	422614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_010681	CCG	2	6	422620	422625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_010681	GCA	2	6	422627	422632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_010681	TCA	2	6	422706	422711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_010681	GAGT	2	8	422738	422745	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010681	CAT	2	6	423135	423140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010681	TGT	2	6	423177	423182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010681	ACG	2	6	423256	423261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_010681	CGG	2	6	424591	424596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_010681	CG	3	6	424637	424642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_010681	GT	3	6	424684	424689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010681	GGCA	2	8	426252	426259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_010681	GC	3	6	426266	426271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_010681	CCGCG	2	10	426278	426287	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1522	NC_010681	TCG	2	6	426293	426298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_010681	GA	3	6	426354	426359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010681	A	6	6	426409	426414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010681	CG	3	6	426425	426430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_010681	CA	3	6	426454	426459	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_010681	CG	4	8	427219	427226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_010681	GGTC	2	8	427236	427243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_010681	CG	3	6	427378	427383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_010681	GCC	2	6	427385	427390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_010681	GCTC	2	8	427412	427419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_010681	ATC	2	6	427448	427453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_010681	GAT	2	6	428614	428619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010681	A	6	6	428773	428778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010681	AATT	2	8	428787	428794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010681	GC	3	6	428810	428815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_010681	GCC	2	6	428827	428832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_010681	GTC	2	6	428891	428896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_010681	GTT	2	6	428947	428952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010681	GGC	2	6	430140	430145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_010681	TGTC	2	8	430150	430157	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_010681	CG	3	6	430181	430186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_010681	T	6	6	430204	430209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010681	T	6	6	430221	430226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010681	GA	3	6	430245	430250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010681	CG	3	6	431273	431278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_010681	TCG	2	6	431296	431301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010681	GGA	2	6	431315	431320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010681	A	7	7	431347	431353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_010681	CGC	2	6	431375	431380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_010681	C	6	6	431380	431385	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1552	NC_010681	CGT	2	6	431406	431411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_010681	GTT	2	6	431423	431428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010681	AACT	2	8	432910	432917	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_010681	TTTC	2	8	432933	432940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_010681	GGC	2	6	432985	432990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_010681	GGC	2	6	433003	433008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_010681	GC	3	6	433046	433051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_010681	CGTAA	2	10	433060	433069	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1560	NC_010681	GCG	2	6	433117	433122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_010681	GGC	2	6	434279	434284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_010681	GCG	2	6	434304	434309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_010681	GCG	2	6	434316	434321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_010681	GGA	2	6	434327	434332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010681	GAG	2	6	434354	434359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010681	ATT	2	6	434454	434459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010681	TGG	2	6	434501	434506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010681	TATC	2	8	434516	434523	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1569	NC_010681	T	6	6	435201	435206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010681	TAA	2	6	435235	435240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010681	T	6	6	435335	435340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010681	T	6	6	435376	435381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010681	CAG	2	6	435382	435387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_010681	GGC	2	6	435430	435435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_010681	T	6	6	435442	435447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010681	GC	3	6	435470	435475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_010681	CAG	2	6	435910	435915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_010681	T	6	6	436155	436160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010681	CGC	2	6	436164	436169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_010681	AAG	2	6	436203	436208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010681	CATTC	2	10	436217	436226	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1585	NC_010681	CGG	2	6	437499	437504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_010681	CG	3	6	437505	437510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_010681	AAACG	2	10	438056	438065	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_010681	CGA	2	6	438082	438087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_010681	TCG	2	6	439421	439426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010681	GCA	2	6	439473	439478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_010681	TCA	2	6	439490	439495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1593	NC_010681	CG	3	6	439696	439701	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_010681	TGGG	2	8	439730	439737	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010681	CGC	2	6	439743	439748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1596	NC_010681	GC	3	6	439756	439761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_010681	CG	3	6	439769	439774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1598	NC_010681	GGC	2	6	439800	439805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_010681	TGAG	2	8	439875	439882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010681	GCGCG	2	10	439916	439925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1601	NC_010681	GTC	2	6	439928	439933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_010681	GCC	2	6	439938	439943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1603	NC_010681	CGG	2	6	440615	440620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_010681	CTC	2	6	440640	440645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_010681	CGG	2	6	440658	440663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_010681	AGA	2	6	440683	440688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010681	AGA	2	6	441626	441631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010681	CAGA	2	8	441634	441641	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_010681	GCC	2	6	441651	441656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_010681	CG	3	6	442139	442144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1611	NC_010681	AGC	2	6	442203	442208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_010681	GC	3	6	442226	442231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_010681	GGC	2	6	442262	442267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_010681	AGA	2	6	442323	442328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010681	G	8	8	444174	444181	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010681	TCC	3	9	444233	444241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_010681	CCA	2	6	444245	444250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_010681	GTC	2	6	444260	444265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010681	AAC	2	6	444390	444395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_010681	T	6	6	446160	446165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010681	TG	3	6	446226	446231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010681	CCG	2	6	446233	446238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_010681	GGC	2	6	446247	446252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_010681	CG	3	6	446255	446260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_010681	TTC	2	6	446267	446272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_010681	TAAA	2	8	446437	446444	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010681	TGA	2	6	446455	446460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010681	CGAG	2	8	446472	446479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_010681	AAC	2	6	446487	446492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_010681	CCG	2	6	446506	446511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1632	NC_010681	CGCC	2	8	446540	446547	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1633	NC_010681	CCG	2	6	446575	446580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_010681	AGCG	2	8	446645	446652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_010681	GCCCG	2	10	446664	446673	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1636	NC_010681	CGGCG	2	10	446699	446708	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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1638	NC_010681	TGT	2	6	448368	448373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1915	NC_010681	GCC	2	6	542010	542015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1916	NC_010681	CG	3	6	543774	543779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1917	NC_010681	CGCGC	2	10	543789	543798	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1918	NC_010681	GAA	2	6	546871	546876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1919	NC_010681	GGGC	2	8	548721	548728	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1920	NC_010681	CTCG	2	8	548754	548761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1921	NC_010681	GC	3	6	548783	548788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1922	NC_010681	GCG	2	6	549818	549823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1923	NC_010681	CG	3	6	549822	549827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1924	NC_010681	TG	3	6	549829	549834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_010681	GC	3	6	549902	549907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1926	NC_010681	T	6	6	549923	549928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1927	NC_010681	GCC	2	6	549938	549943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1928	NC_010681	CG	3	6	549956	549961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1929	NC_010681	CG	3	6	549979	549984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1930	NC_010681	TGC	2	6	550006	550011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1932	NC_010681	GC	3	6	550104	550109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1933	NC_010681	TGC	2	6	554001	554006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1935	NC_010681	GC	3	6	554033	554038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1938	NC_010681	GCA	2	6	554114	554119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1940	NC_010681	CGG	2	6	554158	554163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1944	NC_010681	CAT	2	6	556800	556805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1947	NC_010681	ATTA	2	8	556899	556906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1948	NC_010681	AAC	2	6	556949	556954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1949	NC_010681	TCG	2	6	557999	558004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1950	NC_010681	GGT	2	6	560433	560438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_010681	CGC	2	6	560453	560458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1952	NC_010681	TGAC	2	8	560460	560467	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1953	NC_010681	CA	3	6	560478	560483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1954	NC_010681	ACT	2	6	560552	560557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1955	NC_010681	CG	3	6	560581	560586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1956	NC_010681	GCA	2	6	560606	560611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1957	NC_010681	T	6	6	563106	563111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_010681	CG	3	6	563125	563130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1959	NC_010681	TG	3	6	563172	563177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_010681	CTA	2	6	563195	563200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1963	NC_010681	T	6	6	563348	563353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1964	NC_010681	GACC	2	8	563362	563369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1965	NC_010681	CG	3	6	563481	563486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1966	NC_010681	TAC	2	6	563543	563548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1967	NC_010681	CG	3	6	563581	563586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1968	NC_010681	GGC	2	6	563604	563609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1969	NC_010681	TGAA	2	8	563656	563663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1971	NC_010681	CG	4	8	564497	564504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1972	NC_010681	CT	3	6	564505	564510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1973	NC_010681	CGG	2	6	565704	565709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1974	NC_010681	CAG	2	6	565710	565715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1975	NC_010681	GC	3	6	565721	565726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1976	NC_010681	GCC	2	6	565754	565759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1977	NC_010681	GC	3	6	565763	565768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1978	NC_010681	GCT	2	6	565770	565775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1979	NC_010681	AGCGC	2	10	565783	565792	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1980	NC_010681	GC	3	6	568731	568736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1981	NC_010681	GCC	2	6	568739	568744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1982	NC_010681	GCC	2	6	568786	568791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1983	NC_010681	TTCCC	2	10	568988	568997	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1984	NC_010681	GAC	2	6	569048	569053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1988	NC_010681	ATCGG	2	10	573878	573887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1989	NC_010681	GCTGC	2	10	573888	573897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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1995	NC_010681	CCGTC	2	10	574669	574678	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1996	NC_010681	T	7	7	574707	574713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1998	NC_010681	GC	3	6	574796	574801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1999	NC_010681	GC	3	6	574808	574813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2000	NC_010681	GCA	2	6	575392	575397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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