MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia hermsii DAH chromosome

Total Repeats: 1707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010673	GAT	2	6	804978	804983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_010673	T	6	6	805019	805024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_010673	T	7	7	805034	805040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010673	A	8	8	805043	805050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010673	TGA	2	6	805073	805078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_010673	T	7	7	805150	805156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_010673	AT	3	6	805203	805208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_010673	AAT	2	6	810388	810393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_010673	T	8	8	810399	810406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_010673	AT	3	6	810414	810419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_010673	T	7	7	810480	810486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_010673	T	6	6	810494	810499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_010673	ATAA	2	8	810556	810563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_010673	TAT	2	6	810565	810570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010673	ATATT	2	10	810606	810615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010673	T	7	7	810617	810623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_010673	ATT	2	6	810651	810656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010673	A	6	6	811810	811815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_010673	ATTC	2	8	811833	811840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_010673	ATT	2	6	811845	811850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_010673	TTA	2	6	811863	811868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010673	TAG	2	6	811891	811896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010673	TGTC	2	8	811899	811906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_010673	TTG	2	6	811968	811973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_010673	CAT	2	6	813305	813310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_010673	TAT	2	6	813324	813329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_010673	TGG	2	6	813347	813352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010673	AC	3	6	813362	813367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_010673	GAG	2	6	813383	813388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010673	TATT	2	8	814679	814686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010673	TTTA	2	8	814693	814700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_010673	T	9	9	814708	814716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_010673	TAT	2	6	814724	814729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_010673	T	6	6	815662	815667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_010673	TATT	2	8	815698	815705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_010673	TAA	2	6	815712	815717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_010673	T	7	7	815746	815752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_010673	CTTA	2	8	815773	815780	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_010673	AT	4	8	815799	815806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_010673	ATTT	2	8	815815	815822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_010673	AAT	2	6	815847	815852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_010673	ATT	2	6	815887	815892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010673	TA	3	6	821058	821063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010673	T	6	6	821126	821131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_010673	ATA	2	6	821205	821210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_010673	TTTA	2	8	821212	821219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_010673	TAC	2	6	821224	821229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_010673	ATATT	2	10	821250	821259	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_010673	C	6	6	824860	824865	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1550	NC_010673	TGATG	2	10	824868	824877	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_010673	TAAT	2	8	824902	824909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_010673	ATT	2	6	826314	826319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_010673	ATT	2	6	826326	826331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_010673	AAAGG	2	10	826401	826410	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_010673	TCA	2	6	826426	826431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_010673	ATAA	2	8	826441	826448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_010673	TTA	2	6	828832	828837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_010673	ATTTTA	2	12	828885	828896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_010673	AAT	2	6	828924	828929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_010673	AAAT	2	8	828971	828978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_010673	ATTT	2	8	830146	830153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_010673	AATA	2	8	830154	830161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010673	TTA	2	6	830169	830174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010673	AAT	2	6	830185	830190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_010673	ATT	2	6	832137	832142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_010673	T	6	6	832141	832146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_010673	T	6	6	832148	832153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_010673	TA	3	6	832205	832210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_010673	A	8	8	834320	834327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010673	ATT	2	6	834344	834349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010673	A	6	6	834353	834358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010673	ATT	2	6	834702	834707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010673	GTATT	2	10	834716	834725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010673	TCCTT	2	10	844122	844131	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_010673	TAA	2	6	844137	844142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010673	TACT	2	8	844789	844796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_010673	TAT	2	6	844801	844806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_010673	ATA	2	6	844807	844812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_010673	TTAG	2	8	851703	851710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_010673	AGG	2	6	851720	851725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_010673	GTT	2	6	851726	851731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_010673	TAA	2	6	852819	852824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_010673	ATT	2	6	856055	856060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_010673	ATTT	2	8	856072	856079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_010673	TTATT	2	10	856109	856118	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_010673	TAA	2	6	856119	856124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_010673	TTA	2	6	856144	856149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_010673	TAT	2	6	860668	860673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010673	TAG	2	6	861918	861923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_010673	ATT	2	6	861945	861950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_010673	T	7	7	861996	862002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010673	AAT	2	6	862037	862042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_010673	TGATT	2	10	862043	862052	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_010673	GTTT	2	8	862086	862093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_010673	A	7	7	862107	862113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_010673	TAT	2	6	862114	862119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_010673	AAG	2	6	862148	862153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_010673	ATG	2	6	862173	862178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010673	ATT	2	6	873734	873739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_010673	T	7	7	873756	873762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_010673	AGG	2	6	880095	880100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_010673	GAA	2	6	881224	881229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_010673	A	6	6	881242	881247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_010673	GAAA	2	8	881263	881270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010673	AGA	2	6	881274	881279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_010673	AGA	2	6	881296	881301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_010673	ATAA	2	8	881302	881309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_010673	T	6	6	881326	881331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010673	GCTA	2	8	881332	881339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_010673	TGT	2	6	881349	881354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010673	ATT	2	6	881358	881363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_010673	TAT	2	6	881733	881738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_010673	AT	3	6	881737	881742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010673	TA	4	8	881760	881767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010673	ATA	3	9	881765	881773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010673	T	7	7	881779	881785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_010673	ATTTT	2	10	883644	883653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_010673	TAT	2	6	883657	883662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_010673	T	6	6	883667	883672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010673	AAG	2	6	883682	883687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010673	T	7	7	883699	883705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_010673	CTT	2	6	883706	883711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_010673	TTA	2	6	885189	885194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_010673	TAA	2	6	885200	885205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_010673	T	6	6	885234	885239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_010673	T	6	6	885277	885282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_010673	A	7	7	885287	885293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_010673	AT	3	6	890334	890339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_010673	T	6	6	894465	894470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_010673	ATT	2	6	894479	894484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_010673	TTG	2	6	896083	896088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_010673	TATTTT	2	12	902238	902249	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_010673	T	6	6	902246	902251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_010673	TC	3	6	902261	902266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_010673	TTA	2	6	902286	902291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_010673	AATTA	2	10	904051	904060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_010673	AT	3	6	904071	904076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_010673	AT	3	6	904084	904089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1640	NC_010673	GTT	2	6	904112	904117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.