MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 12879

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010581	GTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010581	CCG	2	6	308	313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_010581	T	6	6	317	322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010581	TCTT	2	8	327	334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010581	CTCTTG	2	12	345	356	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010581	C	6	6	827	832	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7	NC_010581	TGCTT	2	10	866	875	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010581	GTT	2	6	1022	1027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010581	AT	3	6	1059	1064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010581	CTT	2	6	1096	1101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010581	ATT	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010581	GTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010581	CTGTTT	2	12	1148	1159	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010581	GT	3	6	1203	1208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010581	GGAG	2	8	1225	1232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010581	AT	3	6	1234	1239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010581	CGA	2	6	1382	1387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010581	GAA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010581	GCGATG	2	12	1416	1427	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_010581	CTGC	2	8	1442	1449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_010581	AAAGC	2	10	1455	1464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_010581	AGA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010581	GA	3	6	3061	3066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010581	CCG	2	6	3086	3091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_010581	TCC	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_010581	GGA	2	6	3131	3136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010581	TGG	2	6	4301	4306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010581	TGA	2	6	4308	4313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010581	GCC	2	6	5467	5472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010581	ATC	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010581	TCA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010581	GAAT	2	8	5512	5519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010581	TTCA	2	8	9418	9425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010581	ATG	2	6	9442	9447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010581	TG	3	6	9446	9451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010581	CGT	2	6	9465	9470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010581	GCC	2	6	9477	9482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010581	CGGA	2	8	9491	9498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010581	GGA	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010581	GGC	2	6	9548	9553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010581	CGG	2	6	9567	9572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010581	CGT	2	6	9692	9697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010581	GAAG	2	8	10262	10269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010581	AAG	2	6	10335	10340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010581	GGC	2	6	10416	10421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010581	GC	3	6	10425	10430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010581	GGC	2	6	10445	10450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010581	TCG	2	6	10474	10479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010581	TTG	2	6	10495	10500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010581	ATG	2	6	10605	10610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010581	CAC	2	6	10651	10656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_010581	TA	3	6	14385	14390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010581	ATT	2	6	14441	14446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010581	GCTAA	2	10	14465	14474	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_010581	TGA	2	6	16546	16551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010581	TCA	2	6	16559	16564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010581	CGG	2	6	16581	16586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010581	GGC	3	9	16587	16595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010581	CCG	2	6	16599	16604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010581	TCA	2	6	16653	16658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010581	GAG	2	6	16676	16681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010581	T	6	6	16723	16728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010581	GGA	2	6	16788	16793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010581	GT	3	6	18280	18285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010581	GCA	2	6	19809	19814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010581	AT	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010581	TGG	2	6	19866	19871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010581	TGG	2	6	20522	20527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010581	TCA	3	9	20594	20602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010581	GA	4	8	22713	22720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010581	TTC	2	6	25374	25379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010581	CGG	2	6	26073	26078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010581	CGCA	2	8	26105	26112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010581	GCAA	2	8	26160	26167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010581	CTGG	2	8	26187	26194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_010581	TGG	2	6	26267	26272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010581	TTCC	2	8	26318	26325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010581	CAG	2	6	26337	26342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010581	AAC	2	6	26398	26403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010581	AAT	2	6	26442	26447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010581	T	6	6	26464	26469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010581	ATG	2	6	26510	26515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010581	CGCCT	2	10	26601	26610	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_010581	ACA	2	6	27673	27678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010581	AGC	2	6	27699	27704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010581	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010581	AT	3	6	29012	29017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010581	GCG	2	6	29165	29170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010581	GCA	2	6	29190	29195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010581	AG	3	6	29225	29230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010581	CCA	2	6	29659	29664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010581	GTC	2	6	29716	29721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010581	GCG	2	6	29772	29777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010581	TTG	2	6	29939	29944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010581	AATC	2	8	31583	31590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010581	GCG	2	6	31606	31611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010581	CCA	2	6	31629	31634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_010581	CTG	2	6	31669	31674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010581	GCT	2	6	31677	31682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010581	TCG	2	6	31683	31688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010581	TGA	2	6	31759	31764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010581	GTTC	2	8	31817	31824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010581	CTG	2	6	31844	31849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010581	GC	3	6	33783	33788	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010581	CGG	2	6	34512	34517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010581	CGG	2	6	34532	34537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010581	CGC	2	6	34586	34591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_010581	TAA	2	6	35524	35529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010581	GAT	2	6	36290	36295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010581	GAC	2	6	36345	36350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010581	GGT	2	6	36431	36436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010581	GTG	2	6	36448	36453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010581	GGT	2	6	36467	36472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010581	CGG	2	6	36496	36501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010581	CGA	2	6	36519	36524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010581	TC	3	6	36571	36576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_010581	GCG	2	6	36591	36596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010581	CGG	2	6	36602	36607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010581	GGT	2	6	36623	36628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010581	GC	3	6	36633	36638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010581	ATGC	2	8	38691	38698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010581	ACT	2	6	38752	38757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010581	GGAA	2	8	38812	38819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010581	CGG	2	6	38832	38837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010581	GGC	2	6	38992	38997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010581	TGC	2	6	39041	39046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010581	CTGG	2	8	39098	39105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010581	GCAA	2	8	39127	39134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010581	CAA	2	6	39200	39205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010581	AAC	2	6	40106	40111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010581	CGC	2	6	40595	40600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010581	GGC	2	6	40627	40632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010581	ACG	2	6	40661	40666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010581	CTT	2	6	40984	40989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010581	G	6	6	41010	41015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010581	TGC	2	6	41023	41028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010581	AGA	2	6	41148	41153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010581	GCC	2	6	41158	41163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010581	GCA	2	6	41172	41177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010581	AAG	2	6	44540	44545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010581	GCC	2	6	45278	45283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_010581	TC	3	6	45285	45290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_010581	CTG	2	6	45324	45329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_010581	TCAA	2	8	45368	45375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010581	CGG	2	6	45386	45391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_010581	GGC	2	6	45407	45412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_010581	G	7	7	45456	45462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010581	ATG	2	6	45579	45584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010581	CGG	2	6	45629	45634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_010581	GCTT	2	8	45714	45721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010581	GAG	2	6	45794	45799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_010581	CT	3	6	45840	45845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_010581	TCG	2	6	45873	45878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_010581	GAG	2	6	46197	46202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010581	TTTA	2	8	46210	46217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_010581	GGCCG	2	10	46244	46253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_010581	CGC	2	6	46591	46596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_010581	AGCCC	2	10	46696	46705	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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160	NC_010581	T	7	7	48343	48349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010581	GCG	2	6	48350	48355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_010581	GACA	2	8	48384	48391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_010581	TGA	2	6	48434	48439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_010581	GT	3	6	48529	48534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010581	AAAG	2	8	48535	48542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010581	ACTA	2	8	48545	48552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
167	NC_010581	A	6	6	50068	50073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_010581	GAT	2	6	50160	50165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010581	ACG	2	6	50169	50174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_010581	CTTG	2	8	50208	50215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_010581	ATC	2	6	50585	50590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_010581	GC	3	6	50623	50628	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_010581	TCG	2	6	50630	50635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_010581	TTG	2	6	55364	55369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_010581	T	6	6	55411	55416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_010581	TGA	2	6	57668	57673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_010581	AAG	2	6	57917	57922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010581	AAC	2	6	57976	57981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_010581	TGG	2	6	101985	101990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_010581	TCC	2	6	104840	104845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_010581	TG	3	6	105611	105616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
284	NC_010581	T	6	6	105618	105623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_010581	CCCGG	2	10	105684	105693	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
286	NC_010581	TA	3	6	105729	105734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_010581	CGG	2	6	105791	105796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_010581	GGCT	2	8	105840	105847	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
290	NC_010581	GCG	2	6	105867	105872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_010581	CTTT	2	8	106753	106760	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_010581	GGC	2	6	106775	106780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_010581	TAA	2	6	106807	106812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_010581	GGGC	2	8	106839	106846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
295	NC_010581	GA	3	6	106857	106862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
296	NC_010581	GA	3	6	107218	107223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
297	NC_010581	ATT	2	6	107254	107259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_010581	GCG	2	6	109358	109363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
312	NC_010581	GCGT	2	8	109563	109570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
313	NC_010581	GCG	2	6	109619	109624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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420	NC_010581	CAA	2	6	146444	146449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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422	NC_010581	TTC	2	6	146847	146852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_010581	AT	3	6	146883	146888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_010581	CGC	2	6	146956	146961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_010581	CTT	2	6	146998	147003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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