MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia ambifaria MC40-6 chromosome 2

Total Repeats: 10006

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010552	CGGCC	2	10	541834	541843	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2002	NC_010552	CGA	2	6	541848	541853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_010552	GCGCG	2	10	541854	541863	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2004	NC_010552	GC	4	8	541877	541884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_010552	GCG	2	6	541890	541895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_010552	CGG	2	6	541898	541903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_010552	CCG	2	6	541924	541929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_010552	CGGC	2	8	541930	541937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2009	NC_010552	CG	3	6	542216	542221	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2010	NC_010552	GAAC	2	8	542252	542259	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2011	NC_010552	TTTGC	2	10	542282	542291	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2012	NC_010552	ACG	2	6	542299	542304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2013	NC_010552	CG	3	6	542303	542308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2014	NC_010552	GC	3	6	542340	542345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2015	NC_010552	GCGG	2	8	543391	543398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2016	NC_010552	GCTT	2	8	543404	543411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2017	NC_010552	CGC	2	6	543414	543419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2018	NC_010552	GC	3	6	543418	543423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2019	NC_010552	CCA	2	6	543433	543438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_010552	TCG	2	6	543439	543444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_010552	GAC	3	9	543487	543495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_010552	CGG	2	6	544365	544370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_010552	CCG	2	6	544378	544383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2024	NC_010552	CCT	2	6	544750	544755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2025	NC_010552	CGG	2	6	544780	544785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_010552	CG	3	6	544854	544859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2027	NC_010552	GCGCG	2	10	544903	544912	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2028	NC_010552	ACG	2	6	545611	545616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2029	NC_010552	T	6	6	545622	545627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_010552	GAG	2	6	545651	545656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_010552	CG	3	6	546906	546911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2032	NC_010552	CG	3	6	546915	546920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2033	NC_010552	CGG	2	6	547636	547641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_010552	GCG	2	6	547670	547675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2035	NC_010552	ATT	2	6	547736	547741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_010552	GC	4	8	547842	547849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2037	NC_010552	TCG	2	6	547867	547872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2038	NC_010552	GGC	2	6	547939	547944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2039	NC_010552	TGTA	2	8	548005	548012	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2040	NC_010552	CGG	2	6	548061	548066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2041	NC_010552	GAA	2	6	548114	548119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2042	NC_010552	CGC	2	6	548169	548174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2043	NC_010552	AAGG	2	8	549600	549607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2044	NC_010552	AGC	3	9	550386	550394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_010552	CGTC	2	8	550472	550479	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2046	NC_010552	GC	3	6	550484	550489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2047	NC_010552	CG	3	6	551043	551048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2048	NC_010552	GGC	2	6	551082	551087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2049	NC_010552	GAAA	2	8	551201	551208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_010552	GGC	2	6	551238	551243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2051	NC_010552	CGGC	2	8	551298	551305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2052	NC_010552	AGG	2	6	551310	551315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_010552	GC	3	6	552034	552039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2054	NC_010552	TCGC	3	12	552044	552055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2055	NC_010552	GCT	2	6	552069	552074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2056	NC_010552	CGCCC	2	10	552083	552092	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2057	NC_010552	CGG	2	6	552096	552101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_010552	TGCAT	2	10	553519	553528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
2059	NC_010552	GC	3	6	553552	553557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2060	NC_010552	CG	3	6	553566	553571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2061	NC_010552	GCG	3	9	553591	553599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2062	NC_010552	GACG	2	8	553615	553622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2063	NC_010552	CG	3	6	554453	554458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2064	NC_010552	ACACGC	2	12	554486	554497	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2065	NC_010552	GCA	2	6	554690	554695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_010552	CG	3	6	557440	557445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2067	NC_010552	ACGCC	2	10	557459	557468	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2068	NC_010552	CGA	2	6	557476	557481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2069	NC_010552	GCGAT	2	10	557517	557526	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2070	NC_010552	CG	3	6	557529	557534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2071	NC_010552	TGCC	2	8	557535	557542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2072	NC_010552	CG	3	6	559455	559460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2073	NC_010552	CG	3	6	559495	559500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2074	NC_010552	CACG	2	8	560383	560390	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2075	NC_010552	CCGT	2	8	560396	560403	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2076	NC_010552	CGC	2	6	560409	560414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2077	NC_010552	CGA	2	6	560415	560420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2078	NC_010552	CTT	2	6	561661	561666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2079	NC_010552	GCCG	2	8	561749	561756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2080	NC_010552	CG	3	6	561755	561760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2081	NC_010552	GCG	3	9	561765	561773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2082	NC_010552	GC	3	6	561784	561789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2083	NC_010552	CG	3	6	561800	561805	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2084	NC_010552	TCG	2	6	561821	561826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2085	NC_010552	TCG	2	6	561850	561855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2086	NC_010552	ATCG	2	8	561882	561889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2087	NC_010552	CGG	2	6	561936	561941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2088	NC_010552	GCC	2	6	561977	561982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2089	NC_010552	CG	3	6	562010	562015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2090	NC_010552	CGG	2	6	562057	562062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_010552	CGTG	2	8	562091	562098	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2092	NC_010552	CAT	2	6	562114	562119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_010552	GGTG	2	8	562132	562139	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2094	NC_010552	TCG	2	6	562270	562275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2097	NC_010552	CCG	2	6	562387	562392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_010552	CG	4	8	562481	562488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2099	NC_010552	CGC	2	6	562503	562508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2100	NC_010552	CGG	2	6	562583	562588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_010552	CG	4	8	562599	562606	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_010552	GGCC	2	8	562616	562623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2103	NC_010552	CGG	2	6	562640	562645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_010552	CGC	2	6	562655	562660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2105	NC_010552	CGGA	2	8	562709	562716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2106	NC_010552	CAG	2	6	562727	562732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2107	NC_010552	CACGC	2	10	562749	562758	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2108	NC_010552	AAG	2	6	562772	562777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2109	NC_010552	ACG	2	6	562789	562794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2110	NC_010552	CGG	2	6	562852	562857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2111	NC_010552	CCG	2	6	562858	562863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2112	NC_010552	CG	3	6	567243	567248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2113	NC_010552	CG	3	6	567254	567259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2114	NC_010552	CGC	2	6	567264	567269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2115	NC_010552	CGGC	2	8	567303	567310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2116	NC_010552	AGCG	2	8	567333	567340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2117	NC_010552	GTT	2	6	567368	567373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2118	NC_010552	CTT	2	6	567376	567381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_010552	TCG	2	6	567387	567392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_010552	TCA	2	6	567442	567447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2121	NC_010552	CGA	2	6	567482	567487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2122	NC_010552	CA	3	6	567500	567505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2123	NC_010552	GGTT	2	8	567518	567525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2124	NC_010552	GCC	2	6	567549	567554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2125	NC_010552	GC	3	6	567555	567560	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2126	NC_010552	GAG	2	6	567577	567582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2127	NC_010552	GACGC	2	10	569773	569782	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2128	NC_010552	CGC	2	6	569789	569794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2129	NC_010552	CGA	2	6	569801	569806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2131	NC_010552	GGC	2	6	572860	572865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2132	NC_010552	GC	3	6	572864	572869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2133	NC_010552	GCC	2	6	572892	572897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2134	NC_010552	GGA	2	6	573901	573906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2135	NC_010552	CGA	2	6	573921	573926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2136	NC_010552	AAT	2	6	574001	574006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2137	NC_010552	GCT	2	6	574067	574072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2138	NC_010552	C	6	6	574096	574101	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2139	NC_010552	ACC	2	6	574130	574135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2140	NC_010552	CGT	2	6	574147	574152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2141	NC_010552	GC	3	6	574613	574618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2142	NC_010552	ATGC	2	8	574636	574643	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2143	NC_010552	CGA	2	6	578854	578859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2144	NC_010552	CATCG	2	10	578860	578869	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2145	NC_010552	GGC	2	6	579335	579340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2147	NC_010552	GCG	3	9	579350	579358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2148	NC_010552	CGG	2	6	579391	579396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2150	NC_010552	CGGC	2	8	580381	580388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2151	NC_010552	CGG	2	6	580401	580406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2152	NC_010552	TATGCA	2	12	580422	580433	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2154	NC_010552	GTA	2	6	580892	580897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2159	NC_010552	CG	3	6	585873	585878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2160	NC_010552	GGT	2	6	585881	585886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2164	NC_010552	AT	3	6	586491	586496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2165	NC_010552	TGAA	2	8	586523	586530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2166	NC_010552	TCAA	2	8	587533	587540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2172	NC_010552	CG	3	6	594636	594641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2175	NC_010552	TATT	2	8	596158	596165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2193	NC_010552	TCG	2	6	604522	604527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2258	NC_010552	GC	3	6	626561	626566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2271	NC_010552	GCG	2	6	632098	632103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2272	NC_010552	CCG	2	6	632109	632114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2274	NC_010552	GCATC	2	10	632169	632178	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2275	NC_010552	CG	3	6	632189	632194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2276	NC_010552	CATT	2	8	632231	632238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2277	NC_010552	CCGG	2	8	633864	633871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2278	NC_010552	GA	3	6	634170	634175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2281	NC_010552	AAC	2	6	634313	634318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2282	NC_010552	CGCGG	2	10	635460	635469	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2283	NC_010552	CGC	2	6	635472	635477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2286	NC_010552	T	7	7	635542	635548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2289	NC_010552	GCG	2	6	643420	643425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2293	NC_010552	CGG	2	6	644913	644918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2296	NC_010552	CGG	2	6	645711	645716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2395	NC_010552	GCG	3	9	673003	673011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2398	NC_010552	CGGC	2	8	673667	673674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2399	NC_010552	TCC	2	6	674078	674083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2402	NC_010552	TCG	2	6	674180	674185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_010552	A	6	6	674232	674237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_010552	ACT	2	6	674362	674367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2406	NC_010552	CA	3	6	676218	676223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2407	NC_010552	GAA	2	6	676225	676230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2408	NC_010552	GGCC	2	8	676326	676333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2409	NC_010552	TCG	2	6	676800	676805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2411	NC_010552	CGT	2	6	676836	676841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2412	NC_010552	CGC	2	6	676866	676871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2413	NC_010552	CGA	2	6	676879	676884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2414	NC_010552	CGT	2	6	677324	677329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2415	NC_010552	CATCG	2	10	679091	679100	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2416	NC_010552	CG	3	6	679129	679134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2417	NC_010552	GGC	2	6	679147	679152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2421	NC_010552	GTC	2	6	679208	679213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2423	NC_010552	A	6	6	679271	679276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2435	NC_010552	ACA	2	6	684304	684309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2442	NC_010552	GC	3	6	684932	684937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2443	NC_010552	GCCC	2	8	686295	686302	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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2452	NC_010552	GCC	2	6	687538	687543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2456	NC_010552	CG	3	6	688575	688580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2457	NC_010552	GTC	2	6	688582	688587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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