MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia MC0-3 chromosome 2

Total Repeats: 10825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010515	CGG	3	9	3139707	3139715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_010515	CGC	2	6	3139724	3139729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10503	NC_010515	CGG	2	6	3139768	3139773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_010515	CG	3	6	3139838	3139843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10505	NC_010515	GCC	2	6	3139913	3139918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10506	NC_010515	CCAT	2	8	3139945	3139952	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_010515	TCATT	2	10	3140050	3140059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10508	NC_010515	GCG	2	6	3140098	3140103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_010515	CCG	2	6	3140178	3140183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10510	NC_010515	CAT	2	6	3140216	3140221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_010515	GC	3	6	3140295	3140300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10512	NC_010515	ACG	2	6	3140816	3140821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10513	NC_010515	CGCC	2	8	3140825	3140832	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10514	NC_010515	CGG	2	6	3140845	3140850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_010515	CGGG	2	8	3140888	3140895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10516	NC_010515	CCG	2	6	3140900	3140905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_010515	AGC	2	6	3141990	3141995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_010515	CGAA	2	8	3142017	3142024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10519	NC_010515	AAC	2	6	3142030	3142035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_010515	GT	3	6	3142077	3142082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_010515	GGC	2	6	3142094	3142099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_010515	ACGC	2	8	3142100	3142107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_010515	ACC	2	6	3142125	3142130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10524	NC_010515	CG	3	6	3143607	3143612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_010515	CG	3	6	3143627	3143632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10526	NC_010515	ACAGAA	2	12	3143640	3143651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10527	NC_010515	CGC	2	6	3143659	3143664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_010515	GGCA	2	8	3143668	3143675	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10529	NC_010515	CGG	2	6	3143682	3143687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10530	NC_010515	GGCA	2	8	3143695	3143702	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10531	NC_010515	CGT	2	6	3143714	3143719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10532	NC_010515	GTC	2	6	3145043	3145048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10533	NC_010515	GCG	2	6	3147763	3147768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_010515	ACG	2	6	3147772	3147777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_010515	CG	3	6	3147776	3147781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_010515	GTC	3	9	3147794	3147802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_010515	CGT	2	6	3147813	3147818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_010515	CG	3	6	3147832	3147837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_010515	GCGG	2	8	3147846	3147853	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10540	NC_010515	CGG	2	6	3147858	3147863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_010515	TGC	2	6	3147874	3147879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_010515	GGAAAC	2	12	3148197	3148208	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10543	NC_010515	CGT	2	6	3148227	3148232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_010515	GTC	2	6	3148259	3148264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_010515	CGA	2	6	3148268	3148273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10546	NC_010515	CGT	2	6	3149364	3149369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_010515	CAG	2	6	3149395	3149400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_010515	GC	3	6	3149406	3149411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10549	NC_010515	CGG	2	6	3149415	3149420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_010515	CGG	2	6	3149424	3149429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_010515	ATGA	2	8	3149515	3149522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_010515	GTC	2	6	3149535	3149540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_010515	GC	3	6	3149562	3149567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10554	NC_010515	GC	3	6	3149572	3149577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10555	NC_010515	GTC	2	6	3150233	3150238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_010515	GC	3	6	3150336	3150341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_010515	TCG	2	6	3150367	3150372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_010515	CG	3	6	3150403	3150408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10559	NC_010515	CGT	2	6	3150471	3150476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_010515	CCT	2	6	3150479	3150484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10561	NC_010515	CGG	2	6	3152112	3152117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_010515	CGTG	2	8	3152134	3152141	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10563	NC_010515	TCA	2	6	3153203	3153208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_010515	ATA	2	6	3153209	3153214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_010515	CAAT	2	8	3153236	3153243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10566	NC_010515	AAT	2	6	3153246	3153251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_010515	ATT	2	6	3153262	3153267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_010515	GCT	2	6	3153312	3153317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10569	NC_010515	CGTGG	2	10	3153326	3153335	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
10570	NC_010515	TCC	2	6	3153404	3153409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10571	NC_010515	GCC	2	6	3153421	3153426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10572	NC_010515	CG	3	6	3153455	3153460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_010515	CAA	2	6	3153480	3153485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_010515	CGAG	2	8	3153490	3153497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10575	NC_010515	CGG	2	6	3153505	3153510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10578	NC_010515	CGT	2	6	3154382	3154387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10579	NC_010515	GTTT	2	8	3154423	3154430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_010515	ATAC	2	8	3154465	3154472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10581	NC_010515	TC	3	6	3154510	3154515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10582	NC_010515	ACCG	2	8	3156279	3156286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_010515	CCA	2	6	3156336	3156341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10591	NC_010515	CGG	2	6	3157780	3157785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_010515	GCC	2	6	3157897	3157902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10593	NC_010515	GCA	2	6	3157946	3157951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10594	NC_010515	GCC	2	6	3157963	3157968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10595	NC_010515	CGGC	2	8	3159338	3159345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10596	NC_010515	CG	3	6	3159413	3159418	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10597	NC_010515	CGC	2	6	3159451	3159456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10598	NC_010515	CAT	2	6	3159471	3159476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10599	NC_010515	GTCA	2	8	3159487	3159494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10600	NC_010515	GATG	2	8	3160821	3160828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_010515	GC	3	6	3160831	3160836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10602	NC_010515	GTCGC	2	10	3160843	3160852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10603	NC_010515	GCA	2	6	3160938	3160943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10605	NC_010515	CGA	2	6	3160989	3160994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10606	NC_010515	C	6	6	3161111	3161116	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10607	NC_010515	CAG	2	6	3161150	3161155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10608	NC_010515	CGC	2	6	3161552	3161557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10609	NC_010515	TTGA	2	8	3161574	3161581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_010515	CCT	2	6	3161826	3161831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10611	NC_010515	GTC	2	6	3161841	3161846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10612	NC_010515	CAC	2	6	3161909	3161914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10613	NC_010515	CG	3	6	3161916	3161921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10614	NC_010515	CG	3	6	3161960	3161965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10615	NC_010515	CCGGCG	2	12	3162749	3162760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10616	NC_010515	GATC	2	8	3166756	3166763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10617	NC_010515	CG	4	8	3166813	3166820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10618	NC_010515	CCG	2	6	3166832	3166837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10619	NC_010515	ACGAA	2	10	3167750	3167759	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10620	NC_010515	GGCA	2	8	3167797	3167804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10621	NC_010515	GCG	2	6	3167809	3167814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10622	NC_010515	ACGCG	2	10	3167849	3167858	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10623	NC_010515	GAT	2	6	3167921	3167926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_010515	GC	4	8	3168476	3168483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10625	NC_010515	GAC	2	6	3168497	3168502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10626	NC_010515	GCC	2	6	3168543	3168548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.