MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella petrii DSM 12804 chromosome

Total Repeats: 11203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010170	GGC	2	6	5186269	5186274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_010170	GGCAAC	2	12	5186396	5186407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_010170	CTG	2	6	5186467	5186472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_010170	GGCAAC	2	12	5186524	5186535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_010170	GC	3	6	5186543	5186548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11006	NC_010170	CTG	2	6	5186594	5186599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_010170	AGTC	2	8	5186639	5186646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_010170	CGG	3	9	5186650	5186658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_010170	CTG	2	6	5186722	5186727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_010170	AGC	2	6	5186729	5186734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_010170	CGG	2	6	5186778	5186783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_010170	GTC	2	6	5186808	5186813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_010170	CG	3	6	5186835	5186840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_010170	ACG	2	6	5186841	5186846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_010170	CAGGC	2	10	5186878	5186887	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11016	NC_010170	A	7	7	5190333	5190339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_010170	G	6	6	5190340	5190345	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_010170	TGC	2	6	5190409	5190414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_010170	GCCG	2	8	5190419	5190426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11020	NC_010170	CG	4	8	5190425	5190432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11021	NC_010170	CCCG	2	8	5193037	5193044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11022	NC_010170	GCT	2	6	5195351	5195356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_010170	CGGC	2	8	5195366	5195373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_010170	GCG	2	6	5195380	5195385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11025	NC_010170	CG	3	6	5195420	5195425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11026	NC_010170	CGG	2	6	5195891	5195896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_010170	CCG	2	6	5195924	5195929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_010170	A	6	6	5195936	5195941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_010170	GGGC	2	8	5195945	5195952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11030	NC_010170	GCCC	2	8	5195958	5195965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11031	NC_010170	GCC	2	6	5196419	5196424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11032	NC_010170	TCT	2	6	5196437	5196442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_010170	A	6	6	5197536	5197541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_010170	TTAC	2	8	5197563	5197570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_010170	GCCC	2	8	5197577	5197584	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11036	NC_010170	TGCG	2	8	5202404	5202411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11037	NC_010170	T	6	6	5203358	5203363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_010170	TCA	2	6	5203674	5203679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_010170	CCG	2	6	5205021	5205026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_010170	GGCA	2	8	5207099	5207106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11041	NC_010170	A	8	8	5207106	5207113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_010170	GCG	2	6	5207149	5207154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_010170	GCC	2	6	5207156	5207161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_010170	CAT	2	6	5207169	5207174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_010170	GCA	2	6	5212055	5212060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_010170	GCC	2	6	5212504	5212509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11047	NC_010170	TGGT	2	8	5212515	5212522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_010170	GAT	2	6	5213753	5213758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_010170	GCG	2	6	5213785	5213790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_010170	TCAGT	2	10	5216405	5216414	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11051	NC_010170	GCC	2	6	5216442	5216447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_010170	CACG	2	8	5216471	5216478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11053	NC_010170	CG	3	6	5216515	5216520	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_010170	GGC	2	6	5216999	5217004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_010170	CAG	2	6	5217111	5217116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_010170	CGCCCG	2	12	5217168	5217179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_010170	TGGC	2	8	5217183	5217190	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_010170	CG	3	6	5217292	5217297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_010170	AGG	2	6	5217308	5217313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_010170	CAA	2	6	5217322	5217327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_010170	AAG	2	6	5218244	5218249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_010170	TTA	2	6	5218263	5218268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_010170	GCAGT	2	10	5218271	5218280	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11064	NC_010170	TCGCG	2	10	5218282	5218291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11065	NC_010170	CG	3	6	5218297	5218302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_010170	GCG	2	6	5218320	5218325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_010170	CGTC	2	8	5220207	5220214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_010170	ATT	2	6	5223822	5223827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_010170	TAA	2	6	5223891	5223896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11070	NC_010170	GCG	2	6	5223927	5223932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11071	NC_010170	TTCAT	2	10	5223986	5223995	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11072	NC_010170	TTC	2	6	5224029	5224034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_010170	CACAGG	2	12	5224035	5224046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_010170	CTTTG	2	10	5224083	5224092	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11075	NC_010170	CCTT	2	8	5224101	5224108	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_010170	GGC	2	6	5224109	5224114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_010170	GCCC	2	8	5224143	5224150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11078	NC_010170	AGC	2	6	5224156	5224161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_010170	GCCGG	2	10	5224457	5224466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11080	NC_010170	A	6	6	5224486	5224491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11081	NC_010170	TAC	2	6	5224536	5224541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11082	NC_010170	AGGC	2	8	5224542	5224549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11083	NC_010170	GCG	2	6	5234130	5234135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_010170	TTC	2	6	5234146	5234151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_010170	CAG	2	6	5234268	5234273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_010170	CGC	2	6	5235483	5235488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11087	NC_010170	GCG	2	6	5235494	5235499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_010170	GCC	2	6	5236549	5236554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11089	NC_010170	CATA	2	8	5236708	5236715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11090	NC_010170	TAC	2	6	5236717	5236722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11091	NC_010170	T	6	6	5236723	5236728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_010170	AAG	2	6	5238010	5238015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_010170	A	8	8	5238021	5238028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_010170	GTG	2	6	5238029	5238034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_010170	TCG	2	6	5238137	5238142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11097	NC_010170	GGC	2	6	5238276	5238281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11098	NC_010170	TGG	2	6	5238308	5238313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_010170	AGG	2	6	5238314	5238319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_010170	GCC	2	6	5240428	5240433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11101	NC_010170	CCT	2	6	5240459	5240464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11102	NC_010170	ATG	2	6	5240546	5240551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_010170	GGAA	2	8	5244299	5244306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_010170	CGG	2	6	5244400	5244405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_010170	GCCC	2	8	5244447	5244454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11106	NC_010170	AAC	2	6	5244501	5244506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_010170	GCA	3	9	5244527	5244535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11109	NC_010170	GTA	2	6	5244653	5244658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_010170	TTC	2	6	5244673	5244678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11111	NC_010170	GCC	2	6	5244744	5244749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_010170	TACT	2	8	5244800	5244807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11113	NC_010170	GGCCGG	2	12	5244831	5244842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_010170	CG	3	6	5244843	5244848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_010170	AAC	2	6	5244867	5244872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11116	NC_010170	GGGC	2	8	5244910	5244917	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11117	NC_010170	TAA	2	6	5245173	5245178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_010170	GA	3	6	5245214	5245219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_010170	ACAAA	2	10	5245274	5245283	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11120	NC_010170	GTT	2	6	5245286	5245291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_010170	GGC	3	9	5245317	5245325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_010170	TGG	2	6	5245357	5245362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11123	NC_010170	TTTC	2	8	5245376	5245383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11124	NC_010170	ATT	2	6	5245387	5245392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11125	NC_010170	GCT	2	6	5245401	5245406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11126	NC_010170	A	9	9	5246582	5246590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_010170	AGC	2	6	5246625	5246630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_010170	GC	3	6	5248650	5248655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11129	NC_010170	GGC	2	6	5248656	5248661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11130	NC_010170	GGC	2	6	5248670	5248675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11134	NC_010170	TGG	2	6	5251972	5251977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11161	NC_010170	GC	4	8	5272462	5272469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11162	NC_010170	CG	5	10	5273323	5273332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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11170	NC_010170	GCC	2	6	5273499	5273504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11200	NC_010170	GACA	2	8	5287802	5287809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11203	NC_010170	ACCC	2	8	5287906	5287913	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.