MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM100

Total Repeats: 70

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010008	TTG	2	6	214	219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010008	TAT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010008	CAA	2	6	263	268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010008	A	6	6	267	272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010008	GGA	2	6	282	287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010008	AATG	2	8	295	302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010008	AAC	2	6	322	327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010008	GGA	2	6	370	375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010008	T	7	7	1743	1749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010008	TAT	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010008	CAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010008	ATA	2	6	1832	1837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010008	AGA	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010008	A	6	6	1856	1861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010008	T	7	7	1882	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010008	TA	3	6	1898	1903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010008	ATA	2	6	1908	1913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010008	TA	3	6	1932	1937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010008	GATA	2	8	2000	2007	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010008	GTAA	2	8	2019	2026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010008	TAT	2	6	2032	2037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010008	GCT	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010008	T	7	7	2047	2053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010008	TGTTT	2	10	2058	2067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010008	ATG	2	6	2070	2075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010008	CGG	2	6	2087	2092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010008	TTG	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010008	GCTT	2	8	2179	2186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010008	T	6	6	2185	2190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010008	AATA	2	8	2230	2237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010008	A	6	6	2265	2270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010008	ATAA	2	8	2274	2281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010008	TTA	2	6	2315	2320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010008	TG	3	6	2375	2380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010008	ATC	2	6	2751	2756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010008	CAT	2	6	3311	3316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010008	ATA	2	6	3322	3327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010008	A	6	6	3339	3344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010008	C	6	6	3366	3371	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_010008	AT	3	6	3402	3407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010008	A	6	6	3420	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010008	A	7	7	3428	3434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010008	TTAA	2	8	3452	3459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010008	T	7	7	3485	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010008	GTT	2	6	3526	3531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010008	CAA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010008	CTT	2	6	3572	3577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010008	T	6	6	3606	3611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010008	GTG	2	6	3612	3617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010008	ATG	2	6	3738	3743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010008	AAAAG	2	10	3749	3758	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010008	GAA	2	6	3806	3811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010008	GAT	2	6	3835	3840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010008	A	6	6	3850	3855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010008	T	7	7	3885	3891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010008	AGAA	2	8	3920	3927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010008	AT	3	6	3928	3933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010008	CCT	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_010008	A	7	7	4247	4253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010008	ATTT	2	8	4348	4355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010008	A	6	6	4759	4764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010008	CAG	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010008	A	6	6	4878	4883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010008	GCCTA	2	10	4912	4921	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_010008	GAA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010008	T	8	8	4991	4998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010008	A	6	6	5000	5005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010008	T	7	7	5294	5300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010008	TCT	2	6	5310	5315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010008	ATAA	2	8	5381	5388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.