MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009485	CTT	2	6	6019044	6019049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19002	NC_009485	TCGC	2	8	6019082	6019089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19003	NC_009485	CAA	2	6	6019169	6019174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_009485	TC	3	6	6019195	6019200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19005	NC_009485	GTA	2	6	6019299	6019304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_009485	TCC	2	6	6019326	6019331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19007	NC_009485	TTC	2	6	6019344	6019349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_009485	CCAG	2	8	6019364	6019371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19009	NC_009485	GGAGC	2	10	6019488	6019497	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19010	NC_009485	TTA	2	6	6019546	6019551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19011	NC_009485	GAAA	2	8	6019592	6019599	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19012	NC_009485	GTC	2	6	6019667	6019672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19013	NC_009485	GGAA	2	8	6019723	6019730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19014	NC_009485	TAT	2	6	6019731	6019736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_009485	CTC	2	6	6020781	6020786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19016	NC_009485	GGC	2	6	6020807	6020812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19017	NC_009485	GCC	2	6	6020893	6020898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19018	NC_009485	CGCAGG	2	12	6020917	6020928	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_009485	CT	3	6	6020982	6020987	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19020	NC_009485	CTC	2	6	6022719	6022724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19021	NC_009485	TTGAC	2	10	6023667	6023676	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19022	NC_009485	CG	4	8	6023793	6023800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19023	NC_009485	TTC	2	6	6023832	6023837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19024	NC_009485	GTC	2	6	6023854	6023859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19025	NC_009485	CAA	2	6	6023894	6023899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_009485	GGA	2	6	6024073	6024078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19027	NC_009485	GGC	2	6	6024121	6024126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19028	NC_009485	GGC	2	6	6024169	6024174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19029	NC_009485	ACT	2	6	6024295	6024300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_009485	A	7	7	6024360	6024366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19031	NC_009485	GC	3	6	6024369	6024374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19032	NC_009485	GC	3	6	6024382	6024387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19033	NC_009485	GCC	2	6	6025418	6025423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19034	NC_009485	CGG	2	6	6025427	6025432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19035	NC_009485	ATC	2	6	6025498	6025503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_009485	GCGCG	2	10	6025866	6025875	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19037	NC_009485	GCC	2	6	6027728	6027733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19038	NC_009485	ATC	2	6	6027818	6027823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19039	NC_009485	TCC	2	6	6031577	6031582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19040	NC_009485	A	6	6	6031583	6031588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19041	NC_009485	GGC	2	6	6031593	6031598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19042	NC_009485	GCC	2	6	6031605	6031610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19043	NC_009485	GAT	3	9	6031620	6031628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19044	NC_009485	TGG	2	6	6032613	6032618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19045	NC_009485	GCGCA	2	10	6032621	6032630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19046	NC_009485	CGC	2	6	6032638	6032643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19047	NC_009485	CG	4	8	6032671	6032678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19048	NC_009485	CCG	2	6	6032734	6032739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19049	NC_009485	GA	3	6	6032752	6032757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19050	NC_009485	TC	3	6	6032758	6032763	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19051	NC_009485	TTG	2	6	6032846	6032851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19052	NC_009485	GAC	2	6	6032893	6032898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_009485	CGG	2	6	6032922	6032927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19054	NC_009485	CGG	2	6	6033074	6033079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_009485	GAA	2	6	6033100	6033105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19056	NC_009485	GTC	2	6	6033156	6033161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19057	NC_009485	TGAT	2	8	6033192	6033199	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19058	NC_009485	TCG	2	6	6033213	6033218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_009485	TCT	2	6	6033244	6033249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_009485	TTCT	2	8	6033319	6033326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19061	NC_009485	CTGTT	2	10	6033335	6033344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19062	NC_009485	CAG	2	6	6034253	6034258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_009485	CCG	2	6	6034269	6034274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19064	NC_009485	GCG	2	6	6034306	6034311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19065	NC_009485	GC	3	6	6034360	6034365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19066	NC_009485	CCG	2	6	6034377	6034382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19067	NC_009485	GCA	2	6	6034413	6034418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19068	NC_009485	GGC	2	6	6034422	6034427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19069	NC_009485	GAT	2	6	6034437	6034442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19070	NC_009485	CGA	2	6	6034484	6034489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19071	NC_009485	GTC	2	6	6034568	6034573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19072	NC_009485	AG	3	6	6034585	6034590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19073	NC_009485	CG	3	6	6034602	6034607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19074	NC_009485	CTG	2	6	6034634	6034639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19075	NC_009485	TC	3	6	6034701	6034706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19076	NC_009485	TGA	2	6	6034737	6034742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19077	NC_009485	CGA	2	6	6034749	6034754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19078	NC_009485	TCG	2	6	6035689	6035694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19079	NC_009485	GTC	2	6	6035730	6035735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19080	NC_009485	GC	3	6	6035746	6035751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19081	NC_009485	GC	3	6	6035845	6035850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19082	NC_009485	CAG	2	6	6035889	6035894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19083	NC_009485	CCG	2	6	6038056	6038061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19084	NC_009485	ATC	2	6	6038117	6038122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19085	NC_009485	CG	3	6	6038133	6038138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19086	NC_009485	TGC	2	6	6038163	6038168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19087	NC_009485	AACA	2	8	6038179	6038186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19088	NC_009485	CG	3	6	6038218	6038223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19089	NC_009485	GTC	2	6	6040267	6040272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19090	NC_009485	CGGC	2	8	6040277	6040284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19091	NC_009485	TCT	2	6	6040942	6040947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19092	NC_009485	CCG	2	6	6041007	6041012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19093	NC_009485	CTG	2	6	6041030	6041035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19094	NC_009485	CTG	2	6	6041131	6041136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19095	NC_009485	CGG	2	6	6041152	6041157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19096	NC_009485	TCA	2	6	6041206	6041211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19097	NC_009485	CATCT	2	10	6041684	6041693	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19098	NC_009485	ATG	3	9	6041814	6041822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19099	NC_009485	ACG	2	6	6041870	6041875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19100	NC_009485	GACTC	2	10	6041877	6041886	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19101	NC_009485	CG	3	6	6041891	6041896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19102	NC_009485	GAT	2	6	6041907	6041912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19103	NC_009485	GC	3	6	6042185	6042190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19104	NC_009485	GCT	2	6	6042231	6042236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19105	NC_009485	TTC	2	6	6042292	6042297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_009485	ATTG	2	8	6042335	6042342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19107	NC_009485	CGA	2	6	6042345	6042350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19108	NC_009485	CT	3	6	6042430	6042435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19109	NC_009485	TGC	2	6	6042461	6042466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19110	NC_009485	GCGG	2	8	6043165	6043172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19111	NC_009485	GCCGC	2	10	6043207	6043216	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19112	NC_009485	GCG	2	6	6045161	6045166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19113	NC_009485	CG	3	6	6045165	6045170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19114	NC_009485	CGC	2	6	6046267	6046272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19115	NC_009485	CGC	2	6	6046300	6046305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19116	NC_009485	CGG	2	6	6046355	6046360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19117	NC_009485	GC	3	6	6046391	6046396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19118	NC_009485	CGT	2	6	6046407	6046412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19119	NC_009485	TCC	2	6	6046460	6046465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19120	NC_009485	TGCCG	2	10	6046495	6046504	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19121	NC_009485	CGA	2	6	6046528	6046533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19122	NC_009485	GCA	2	6	6046592	6046597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19123	NC_009485	TCAG	2	8	6046618	6046625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19124	NC_009485	CAC	2	6	6046628	6046633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19125	NC_009485	CGG	2	6	6046711	6046716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19126	NC_009485	ACC	2	6	6046723	6046728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19128	NC_009485	GCG	2	6	6047638	6047643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19385	NC_009485	TCC	2	6	6121745	6121750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19497	NC_009485	CGC	2	6	6158352	6158357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19499	NC_009485	A	6	6	6158461	6158466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19500	NC_009485	TCG	2	6	6158492	6158497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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