MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_009485	GC	3	6	5839854	5839859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18502	NC_009485	CAA	2	6	5839878	5839883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18503	NC_009485	CG	3	6	5839887	5839892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18504	NC_009485	TGA	2	6	5839900	5839905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_009485	CG	3	6	5839909	5839914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18506	NC_009485	ACG	2	6	5839935	5839940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_009485	G	6	6	5841479	5841484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18508	NC_009485	GCG	2	6	5841540	5841545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18509	NC_009485	GGC	2	6	5841577	5841582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18510	NC_009485	GCG	2	6	5841669	5841674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18511	NC_009485	GCT	2	6	5841715	5841720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18512	NC_009485	GC	3	6	5841766	5841771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18513	NC_009485	CGA	3	9	5841779	5841787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18514	NC_009485	GA	3	6	5841816	5841821	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_009485	TAT	2	6	5844333	5844338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18516	NC_009485	ATG	2	6	5844359	5844364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18517	NC_009485	CGA	2	6	5844541	5844546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18518	NC_009485	ACG	2	6	5844569	5844574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18519	NC_009485	AAC	2	6	5844586	5844591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18520	NC_009485	CTG	2	6	5844593	5844598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18521	NC_009485	CGG	2	6	5844610	5844615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18522	NC_009485	GC	3	6	5844650	5844655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18523	NC_009485	GCC	2	6	5844763	5844768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18524	NC_009485	GTGAG	2	10	5844783	5844792	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_009485	A	6	6	5845984	5845989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18526	NC_009485	CGA	2	6	5847024	5847029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18527	NC_009485	A	6	6	5847194	5847199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18528	NC_009485	GT	3	6	5847202	5847207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_009485	CTC	2	6	5847249	5847254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18530	NC_009485	CGC	2	6	5847256	5847261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18531	NC_009485	TGT	2	6	5847291	5847296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18532	NC_009485	GAG	2	6	5847319	5847324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_009485	GCG	2	6	5847338	5847343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18534	NC_009485	ATG	2	6	5850327	5850332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_009485	GCA	2	6	5852663	5852668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18536	NC_009485	GCC	2	6	5852696	5852701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18537	NC_009485	CGG	2	6	5854942	5854947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18538	NC_009485	ACG	2	6	5854948	5854953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_009485	ATG	2	6	5856418	5856423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_009485	GCC	2	6	5858822	5858827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18541	NC_009485	CGGCT	2	10	5858832	5858841	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18542	NC_009485	AGCCG	2	10	5858926	5858935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18543	NC_009485	G	6	6	5864048	5864053	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18544	NC_009485	ATCG	2	8	5864068	5864075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18545	NC_009485	CAG	2	6	5864079	5864084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_009485	GCCAA	2	10	5864106	5864115	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18547	NC_009485	TGC	2	6	5864151	5864156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18548	NC_009485	ACA	2	6	5864216	5864221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18549	NC_009485	C	6	6	5864309	5864314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18550	NC_009485	GAC	2	6	5864317	5864322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18551	NC_009485	CAT	2	6	5864368	5864373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_009485	GCCC	2	8	5864388	5864395	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18553	NC_009485	GGC	2	6	5864419	5864424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18554	NC_009485	CGA	2	6	5864484	5864489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18555	NC_009485	TCA	2	6	5864511	5864516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18556	NC_009485	TTG	2	6	5864616	5864621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18557	NC_009485	ACG	2	6	5864643	5864648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18558	NC_009485	CCG	2	6	5864680	5864685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18559	NC_009485	CGAGA	2	10	5864707	5864716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18560	NC_009485	CGC	2	6	5865844	5865849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18561	NC_009485	GC	3	6	5865892	5865897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18562	NC_009485	CTC	2	6	5865903	5865908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18563	NC_009485	GAA	2	6	5867147	5867152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_009485	G	8	8	5867224	5867231	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18565	NC_009485	GCG	2	6	5867303	5867308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18566	NC_009485	ACGCG	2	10	5867384	5867393	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18567	NC_009485	CCG	2	6	5868981	5868986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18568	NC_009485	GCC	2	6	5870165	5870170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18569	NC_009485	CGC	2	6	5871429	5871434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18570	NC_009485	CGA	2	6	5871438	5871443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18572	NC_009485	CGGGA	2	10	5871580	5871589	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18573	NC_009485	CG	3	6	5871594	5871599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18574	NC_009485	GCG	2	6	5871621	5871626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18575	NC_009485	CGC	2	6	5871628	5871633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18578	NC_009485	TGC	3	9	5871806	5871814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18585	NC_009485	GGC	3	9	5882198	5882206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18588	NC_009485	GAC	2	6	5882289	5882294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18589	NC_009485	TCGA	2	8	5882309	5882316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18590	NC_009485	CGG	2	6	5882353	5882358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18591	NC_009485	G	7	7	5882383	5882389	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18592	NC_009485	ACGGG	2	10	5882449	5882458	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18593	NC_009485	TTG	2	6	5884352	5884357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18596	NC_009485	CGG	2	6	5884447	5884452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18597	NC_009485	CAC	2	6	5884465	5884470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18598	NC_009485	CAAAC	2	10	5884525	5884534	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18599	NC_009485	T	6	6	5884559	5884564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18601	NC_009485	TTG	2	6	5884618	5884623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18602	NC_009485	GA	3	6	5884664	5884669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18603	NC_009485	GCT	2	6	5884734	5884739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18604	NC_009485	GCC	2	6	5884742	5884747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18606	NC_009485	TTG	2	6	5884824	5884829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18607	NC_009485	TGC	2	6	5887772	5887777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18608	NC_009485	CGA	3	9	5887779	5887787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18609	NC_009485	ATC	2	6	5888887	5888892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18610	NC_009485	GAC	2	6	5888914	5888919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18611	NC_009485	GCC	2	6	5890955	5890960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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18613	NC_009485	TGG	2	6	5891018	5891023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_009485	GCT	2	6	5891032	5891037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18617	NC_009485	GCCCTC	2	12	5891088	5891099	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18618	NC_009485	CCT	2	6	5891130	5891135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18619	NC_009485	CAC	2	6	5891251	5891256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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18621	NC_009485	CCGG	2	8	5891438	5891445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18622	NC_009485	GGC	2	6	5895436	5895441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18624	NC_009485	GT	3	6	5895553	5895558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18625	NC_009485	GAC	2	6	5895630	5895635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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