MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_009485	CGA	3	9	5537678	5537686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_009485	CTC	2	6	5538916	5538921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17503	NC_009485	TGC	2	6	5538983	5538988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17504	NC_009485	GCA	2	6	5538997	5539002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17505	NC_009485	CGGC	2	8	5539032	5539039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17506	NC_009485	CGGC	2	8	5539562	5539569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17507	NC_009485	CG	3	6	5539962	5539967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17508	NC_009485	CT	3	6	5539984	5539989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17509	NC_009485	GTT	2	6	5540028	5540033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17510	NC_009485	GCC	2	6	5540200	5540205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17511	NC_009485	CCGG	2	8	5540230	5540237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17512	NC_009485	GGC	2	6	5540279	5540284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_009485	GCCC	2	8	5540343	5540350	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17514	NC_009485	TCGA	2	8	5540356	5540363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17515	NC_009485	GTC	2	6	5541407	5541412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_009485	ATG	2	6	5541418	5541423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_009485	GAG	2	6	5541425	5541430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_009485	GAC	2	6	5541470	5541475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_009485	GGC	2	6	5541493	5541498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17520	NC_009485	GGT	2	6	5541544	5541549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_009485	TCG	2	6	5545448	5545453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_009485	GCCTGC	2	12	5545546	5545557	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17523	NC_009485	GAC	2	6	5545573	5545578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17524	NC_009485	C	6	6	5545628	5545633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17525	NC_009485	CCTT	2	8	5546572	5546579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17526	NC_009485	GCG	2	6	5547480	5547485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17527	NC_009485	GGC	2	6	5547486	5547491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17528	NC_009485	CT	3	6	5547984	5547989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17529	NC_009485	GCAGC	2	10	5548015	5548024	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17530	NC_009485	CAT	2	6	5548046	5548051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17531	NC_009485	C	6	6	5548562	5548567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
17532	NC_009485	AGC	2	6	5548624	5548629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_009485	GCA	2	6	5548662	5548667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17534	NC_009485	TCC	2	6	5548745	5548750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17535	NC_009485	GGC	2	6	5548751	5548756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17536	NC_009485	GCC	2	6	5548760	5548765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17537	NC_009485	CGA	2	6	5548768	5548773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_009485	CG	3	6	5550188	5550193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17539	NC_009485	GGC	2	6	5550236	5550241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17540	NC_009485	GGT	2	6	5550253	5550258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_009485	GGCGAA	2	12	5550309	5550320	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17542	NC_009485	CGC	2	6	5550345	5550350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17543	NC_009485	CGC	3	9	5550366	5550374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17544	NC_009485	CG	3	6	5550408	5550413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17545	NC_009485	TGC	2	6	5550417	5550422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_009485	CTG	2	6	5550508	5550513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17547	NC_009485	GCT	2	6	5550556	5550561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_009485	TCGC	2	8	5550648	5550655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17549	NC_009485	GTC	2	6	5550657	5550662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17550	NC_009485	GCCA	2	8	5550801	5550808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17551	NC_009485	CGC	2	6	5550829	5550834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17552	NC_009485	TCG	2	6	5554753	5554758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_009485	CGG	2	6	5554785	5554790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17554	NC_009485	GC	3	6	5554806	5554811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_009485	CCG	2	6	5554822	5554827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17556	NC_009485	TTG	2	6	5555996	5556001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17557	NC_009485	CTG	2	6	5556051	5556056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_009485	GATCGC	2	12	5556067	5556078	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17559	NC_009485	ACA	2	6	5556533	5556538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17560	NC_009485	ACC	2	6	5556618	5556623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17561	NC_009485	TAT	2	6	5556640	5556645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_009485	AAT	2	6	5556660	5556665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17563	NC_009485	T	6	6	5556667	5556672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17564	NC_009485	CG	3	6	5556719	5556724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17565	NC_009485	GCG	2	6	5559557	5559562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17566	NC_009485	CG	3	6	5559569	5559574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17567	NC_009485	GC	3	6	5559611	5559616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17568	NC_009485	GCCG	2	8	5559633	5559640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17569	NC_009485	CAT	3	9	5559655	5559663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17570	NC_009485	CTG	2	6	5559664	5559669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_009485	ACG	2	6	5561502	5561507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17572	NC_009485	GCC	2	6	5561629	5561634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17573	NC_009485	CG	3	6	5562386	5562391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17574	NC_009485	ACG	2	6	5562392	5562397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17575	NC_009485	GC	3	6	5562894	5562899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17576	NC_009485	CG	4	8	5562914	5562921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17577	NC_009485	GA	3	6	5562927	5562932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17578	NC_009485	CGA	2	6	5563817	5563822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17579	NC_009485	GTC	2	6	5563834	5563839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17581	NC_009485	GC	3	6	5565250	5565255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17582	NC_009485	CG	3	6	5565260	5565265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17583	NC_009485	GGC	2	6	5565281	5565286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17585	NC_009485	GCG	2	6	5565440	5565445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17586	NC_009485	CTC	2	6	5565446	5565451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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17591	NC_009485	GCT	2	6	5567949	5567954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17593	NC_009485	GAA	2	6	5567969	5567974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17594	NC_009485	CG	3	6	5568020	5568025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17595	NC_009485	C	7	7	5568630	5568636	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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17599	NC_009485	GCG	2	6	5568726	5568731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17600	NC_009485	TCG	2	6	5568746	5568751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17601	NC_009485	CTG	2	6	5568768	5568773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17602	NC_009485	ATC	2	6	5568775	5568780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17603	NC_009485	GAC	3	9	5568792	5568800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17604	NC_009485	GC	3	6	5569587	5569592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17605	NC_009485	CGC	2	6	5569598	5569603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17607	NC_009485	ACCAC	2	10	5569703	5569712	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17608	NC_009485	GTTT	2	8	5569725	5569732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_009485	CG	3	6	5569742	5569747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17610	NC_009485	GTT	2	6	5569761	5569766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17611	NC_009485	ATCG	2	8	5569784	5569791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17612	NC_009485	GCC	2	6	5569831	5569836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17613	NC_009485	GACG	2	8	5569888	5569895	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17614	NC_009485	CTC	2	6	5569926	5569931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17615	NC_009485	AAC	2	6	5570919	5570924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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17617	NC_009485	CGG	3	9	5571099	5571107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17623	NC_009485	ACC	2	6	5572925	5572930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17624	NC_009485	GCCG	2	8	5572933	5572940	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17625	NC_009485	CGGC	2	8	5575024	5575031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17626	NC_009485	GCG	2	6	5575056	5575061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17628	NC_009485	GGC	2	6	5575140	5575145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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