MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009485	GTA	2	6	4496362	4496367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009485	CGT	2	6	4496383	4496388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_009485	CCG	2	6	4496788	4496793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14004	NC_009485	GCC	2	6	4496820	4496825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_009485	GCG	2	6	4496897	4496902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_009485	ATG	2	6	4496940	4496945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_009485	CAT	2	6	4496962	4496967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_009485	GCT	2	6	4496973	4496978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_009485	GCCGC	2	10	4496982	4496991	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14010	NC_009485	AGC	2	6	4496992	4496997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14011	NC_009485	ACGC	2	8	4499062	4499069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14012	NC_009485	CTC	2	6	4499076	4499081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_009485	GAG	2	6	4499125	4499130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_009485	CGC	2	6	4499131	4499136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14015	NC_009485	GCGCG	2	10	4499137	4499146	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14016	NC_009485	GCC	3	9	4504591	4504599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_009485	GAC	2	6	4504605	4504610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_009485	GCC	2	6	4504624	4504629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14019	NC_009485	GCA	2	6	4504635	4504640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_009485	GAT	2	6	4504668	4504673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_009485	CAG	2	6	4504674	4504679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_009485	TCA	2	6	4504702	4504707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_009485	TGG	2	6	4504750	4504755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_009485	GCC	2	6	4504766	4504771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_009485	ATCG	2	8	4504846	4504853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14026	NC_009485	CCG	2	6	4504984	4504989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14027	NC_009485	CGA	2	6	4505008	4505013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_009485	TAA	2	6	4505016	4505021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_009485	TCGC	2	8	4505068	4505075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14030	NC_009485	GAA	2	6	4505076	4505081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_009485	CAT	2	6	4505122	4505127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_009485	GTC	2	6	4505307	4505312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_009485	GAG	2	6	4505328	4505333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_009485	CGA	2	6	4505369	4505374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_009485	CAT	2	6	4505446	4505451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_009485	AGC	2	6	4505498	4505503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14037	NC_009485	CG	3	6	4505516	4505521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_009485	GCC	2	6	4505558	4505563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_009485	T	7	7	4505567	4505573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_009485	CAG	2	6	4505599	4505604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14041	NC_009485	ACG	2	6	4506045	4506050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_009485	CCG	2	6	4506058	4506063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_009485	GCC	2	6	4507276	4507281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14044	NC_009485	AT	3	6	4507333	4507338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_009485	GGC	2	6	4507801	4507806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_009485	TGA	2	6	4507841	4507846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_009485	CCG	2	6	4507924	4507929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14048	NC_009485	TTGT	2	8	4507932	4507939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_009485	CGG	2	6	4508223	4508228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_009485	CCA	2	6	4508234	4508239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14051	NC_009485	GAT	2	6	4508249	4508254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009485	TGCCG	2	10	4508344	4508353	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14053	NC_009485	AGGCG	2	10	4508390	4508399	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14054	NC_009485	GACGT	2	10	4508405	4508414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14055	NC_009485	CGC	2	6	4508425	4508430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14056	NC_009485	CCG	2	6	4508490	4508495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14057	NC_009485	CGC	2	6	4508504	4508509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14058	NC_009485	GAG	2	6	4508540	4508545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009485	TCGA	2	8	4508567	4508574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_009485	CAT	2	6	4508587	4508592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_009485	TTC	2	6	4508597	4508602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_009485	GCG	2	6	4508763	4508768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_009485	CCGG	2	8	4508802	4508809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14064	NC_009485	GCGAC	2	10	4508843	4508852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14065	NC_009485	CG	3	6	4508884	4508889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14066	NC_009485	GC	3	6	4508893	4508898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14067	NC_009485	GGC	2	6	4508902	4508907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14068	NC_009485	GC	3	6	4508936	4508941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14069	NC_009485	GTC	2	6	4508942	4508947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_009485	GCT	2	6	4508968	4508973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_009485	TCG	2	6	4508982	4508987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_009485	GGT	2	6	4509010	4509015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_009485	CTG	2	6	4509107	4509112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_009485	ATCG	2	8	4509138	4509145	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14075	NC_009485	TCG	2	6	4509189	4509194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_009485	CGA	2	6	4509199	4509204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_009485	TGC	2	6	4509255	4509260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_009485	ACG	2	6	4509303	4509308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_009485	ACCG	2	8	4509311	4509318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14080	NC_009485	GAG	2	6	4509350	4509355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_009485	AGA	2	6	4509372	4509377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_009485	CGG	2	6	4509400	4509405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14083	NC_009485	CAA	2	6	4509421	4509426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_009485	CTG	2	6	4509428	4509433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14085	NC_009485	CAT	2	6	4509439	4509444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_009485	GCTC	2	8	4509447	4509454	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_009485	TGC	2	6	4509459	4509464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_009485	CGG	2	6	4509513	4509518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14089	NC_009485	GCC	2	6	4509539	4509544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14090	NC_009485	CTG	2	6	4509560	4509565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_009485	CGC	2	6	4509575	4509580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_009485	CCGA	2	8	4509599	4509606	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_009485	GGA	2	6	4509631	4509636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_009485	GTG	2	6	4509677	4509682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_009485	CCG	3	9	4509684	4509692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14096	NC_009485	CTG	2	6	4509737	4509742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_009485	GC	3	6	4509758	4509763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_009485	GAGG	2	8	4509776	4509783	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_009485	CAA	2	6	4509805	4509810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_009485	CGC	2	6	4509826	4509831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14101	NC_009485	GCC	2	6	4509847	4509852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14102	NC_009485	TTC	2	6	4509932	4509937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14103	NC_009485	CGGCCT	2	12	4509964	4509975	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14104	NC_009485	CG	3	6	4509994	4509999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_009485	GGC	2	6	4510007	4510012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_009485	CAC	2	6	4510045	4510050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14107	NC_009485	CGT	2	6	4510128	4510133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_009485	GAT	2	6	4510201	4510206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_009485	CG	3	6	4510269	4510274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14110	NC_009485	GATC	2	8	4510275	4510282	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14111	NC_009485	CGGCC	2	10	4510354	4510363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14112	NC_009485	TCA	2	6	4510376	4510381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_009485	AGC	2	6	4510408	4510413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14114	NC_009485	GGCC	2	8	4510470	4510477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14115	NC_009485	TGG	2	6	4510490	4510495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_009485	AGGAG	2	10	4510503	4510512	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14117	NC_009485	CAC	2	6	4510550	4510555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14118	NC_009485	CCA	2	6	4512532	4512537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14119	NC_009485	GCC	2	6	4514190	4514195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_009485	GC	3	6	4514209	4514214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14121	NC_009485	CAG	2	6	4514764	4514769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_009485	CCGTCC	2	12	4514775	4514786	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
14123	NC_009485	GACG	2	8	4514811	4514818	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_009485	ACGC	2	8	4514823	4514830	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14125	NC_009485	CGA	2	6	4514834	4514839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14127	NC_009485	GCT	2	6	4514873	4514878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14128	NC_009485	CGG	2	6	4514880	4514885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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14131	NC_009485	GCG	2	6	4516072	4516077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_009485	CGCA	2	8	4516084	4516091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14133	NC_009485	C	6	6	4516115	4516120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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14241	NC_009485	TGCTG	2	10	4561820	4561829	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14242	NC_009485	CG	3	6	4561847	4561852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14243	NC_009485	TTTC	2	8	4561901	4561908	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14244	NC_009485	CTGTGA	2	12	4564706	4564717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14245	NC_009485	AGC	2	6	4564787	4564792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14246	NC_009485	GCCCC	2	10	4564802	4564811	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14247	NC_009485	CGC	2	6	4565432	4565437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14248	NC_009485	TGG	2	6	4565456	4565461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14249	NC_009485	CAAA	2	8	4565489	4565496	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14250	NC_009485	ATG	2	6	4565508	4565513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_009485	ATG	2	6	4565531	4565536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_009485	TCG	2	6	4565551	4565556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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