MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_009485	GTC	2	6	4201835	4201840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_009485	TCGC	2	8	4201897	4201904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13003	NC_009485	GCC	2	6	4201905	4201910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13004	NC_009485	GCTG	2	8	4201925	4201932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13005	NC_009485	GA	3	6	4201956	4201961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_009485	CTG	2	6	4203191	4203196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_009485	CAAA	2	8	4204578	4204585	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13008	NC_009485	TTG	2	6	4204596	4204601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_009485	TGC	2	6	4204649	4204654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_009485	CGC	2	6	4204672	4204677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_009485	CCG	2	6	4204721	4204726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13012	NC_009485	GAG	2	6	4204736	4204741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_009485	CGG	2	6	4205751	4205756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13014	NC_009485	TC	3	6	4207610	4207615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13015	NC_009485	CAA	2	6	4207632	4207637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_009485	A	7	7	4207636	4207642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_009485	TTGA	2	8	4207655	4207662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_009485	TTA	2	6	4207733	4207738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_009485	CGC	2	6	4207810	4207815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13020	NC_009485	CGT	2	6	4207817	4207822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_009485	CGC	2	6	4207852	4207857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13022	NC_009485	GTC	2	6	4209741	4209746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_009485	TC	3	6	4209755	4209760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_009485	CGT	2	6	4209761	4209766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_009485	TCA	2	6	4209802	4209807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_009485	CGC	2	6	4209918	4209923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13027	NC_009485	GGA	2	6	4209963	4209968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_009485	GA	3	6	4209967	4209972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_009485	GGC	2	6	4210032	4210037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_009485	GCAA	2	8	4210353	4210360	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13031	NC_009485	ACC	2	6	4210438	4210443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13032	NC_009485	GCG	2	6	4210446	4210451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_009485	CGG	2	6	4210458	4210463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_009485	ATC	2	6	4210496	4210501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_009485	AACC	2	8	4210525	4210532	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13036	NC_009485	TTGC	2	8	4211614	4211621	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_009485	ATCG	2	8	4212047	4212054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_009485	AAGG	2	8	4212084	4212091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_009485	CTGC	2	8	4212168	4212175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_009485	GGC	2	6	4212190	4212195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_009485	GC	3	6	4212194	4212199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_009485	ATC	2	6	4212202	4212207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_009485	CGG	2	6	4212232	4212237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_009485	CGG	2	6	4212239	4212244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_009485	CGGCG	2	10	4213125	4213134	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13046	NC_009485	TCGC	2	8	4213184	4213191	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_009485	CAA	2	6	4213230	4213235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_009485	GCT	2	6	4214491	4214496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_009485	CGGA	2	8	4214498	4214505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13050	NC_009485	CG	3	6	4215628	4215633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13051	NC_009485	AGG	2	6	4215651	4215656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_009485	GCG	2	6	4215896	4215901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_009485	GCC	2	6	4215902	4215907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_009485	TCC	2	6	4216187	4216192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_009485	CGGG	2	8	4216209	4216216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13056	NC_009485	CGC	2	6	4217847	4217852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_009485	TGA	2	6	4217867	4217872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_009485	C	6	6	4217910	4217915	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13059	NC_009485	GCG	2	6	4218559	4218564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_009485	GGA	2	6	4220822	4220827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_009485	CG	3	6	4221088	4221093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_009485	CTGCCG	2	12	4221907	4221918	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13063	NC_009485	TGA	2	6	4221951	4221956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_009485	CGC	2	6	4222036	4222041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13065	NC_009485	AGC	2	6	4222061	4222066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13066	NC_009485	GAG	2	6	4222182	4222187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_009485	CG	3	6	4222222	4222227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_009485	GCG	2	6	4222248	4222253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_009485	A	6	6	4223412	4223417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_009485	GCC	2	6	4223418	4223423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13071	NC_009485	GGC	2	6	4223430	4223435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13072	NC_009485	TGC	2	6	4223450	4223455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_009485	TCC	2	6	4223477	4223482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13074	NC_009485	CGC	2	6	4223483	4223488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13075	NC_009485	AAT	2	6	4223515	4223520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_009485	TGG	2	6	4223524	4223529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_009485	GCCG	2	8	4223562	4223569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13078	NC_009485	CCG	2	6	4223592	4223597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13079	NC_009485	GC	3	6	4224236	4224241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_009485	CCG	2	6	4224280	4224285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13081	NC_009485	GCC	2	6	4225388	4225393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13082	NC_009485	GC	3	6	4225443	4225448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13083	NC_009485	CGG	2	6	4225462	4225467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_009485	GCC	2	6	4225475	4225480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13085	NC_009485	GTC	2	6	4225504	4225509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_009485	CAA	2	6	4225567	4225572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13087	NC_009485	GC	3	6	4225939	4225944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13088	NC_009485	CG	3	6	4225965	4225970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_009485	CGG	2	6	4225976	4225981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_009485	GCAG	2	8	4225990	4225997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_009485	GCGG	2	8	4225998	4226005	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13092	NC_009485	GCG	2	6	4227201	4227206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_009485	GCG	2	6	4227228	4227233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_009485	AACG	2	8	4227294	4227301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13095	NC_009485	GCC	2	6	4228683	4228688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_009485	CG	3	6	4228695	4228700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13097	NC_009485	CGGC	2	8	4228746	4228753	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13098	NC_009485	GCAG	2	8	4229405	4229412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_009485	GCTGA	2	10	4229683	4229692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13100	NC_009485	CCA	2	6	4229708	4229713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13101	NC_009485	CGG	2	6	4229727	4229732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13102	NC_009485	TTCA	2	8	4229768	4229775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13103	NC_009485	CAT	2	6	4229793	4229798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_009485	CG	3	6	4229808	4229813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13105	NC_009485	CGG	2	6	4229885	4229890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_009485	CGCC	2	8	4229896	4229903	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13107	NC_009485	GATC	2	8	4229916	4229923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_009485	CAACG	2	10	4229932	4229941	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13109	NC_009485	TCGC	2	8	4230734	4230741	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_009485	AGG	2	6	4230802	4230807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_009485	GCA	2	6	4230808	4230813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_009485	GCT	2	6	4230878	4230883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_009485	GAC	2	6	4231273	4231278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_009485	GC	4	8	4231325	4231332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_009485	ATC	2	6	4231341	4231346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13116	NC_009485	GA	3	6	4231511	4231516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13117	NC_009485	TCC	2	6	4231555	4231560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13118	NC_009485	CTC	2	6	4231596	4231601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13119	NC_009485	AGCAGG	2	12	4231688	4231699	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13120	NC_009485	GGC	2	6	4232293	4232298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13121	NC_009485	GCGG	2	8	4233013	4233020	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_009485	CG	4	8	4233041	4233048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13123	NC_009485	GAA	2	6	4233062	4233067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_009485	CAG	2	6	4233074	4233079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_009485	CAA	2	6	4233104	4233109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_009485	CAG	2	6	4233113	4233118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_009485	CCT	2	6	4233139	4233144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13128	NC_009485	CG	3	6	4233196	4233201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13129	NC_009485	AACG	2	8	4233732	4233739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13255	NC_009485	GGGA	2	8	4262482	4262489	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13256	NC_009485	GC	3	6	4262495	4262500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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