MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_009485	TCCC	2	8	3725495	3725502	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11502	NC_009485	AGGG	2	8	3725518	3725525	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_009485	TCG	2	6	3725543	3725548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_009485	GTCG	2	8	3725564	3725571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11505	NC_009485	G	6	6	3725615	3725620	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_009485	TCTCC	2	10	3725714	3725723	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11507	NC_009485	GA	3	6	3725733	3725738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_009485	CCGC	2	8	3725748	3725755	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11509	NC_009485	GGC	2	6	3727371	3727376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_009485	CGC	2	6	3727424	3727429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11511	NC_009485	TACGC	2	10	3727449	3727458	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11512	NC_009485	CAACT	2	10	3727474	3727483	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
11513	NC_009485	AGC	2	6	3727534	3727539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_009485	ATC	2	6	3727601	3727606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_009485	TG	3	6	3727623	3727628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_009485	CTTC	2	8	3727659	3727666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_009485	TCC	2	6	3727675	3727680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_009485	AC	3	6	3727715	3727720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_009485	TCGA	2	8	3727790	3727797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11520	NC_009485	TCG	2	6	3727810	3727815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_009485	GCG	2	6	3727822	3727827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_009485	CGG	2	6	3727929	3727934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_009485	GCC	2	6	3727940	3727945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11524	NC_009485	TCCAGG	2	12	3727948	3727959	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_009485	CGG	2	6	3729867	3729872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_009485	CG	3	6	3729883	3729888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11527	NC_009485	GCA	2	6	3729911	3729916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_009485	TGC	3	9	3729952	3729960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_009485	CG	3	6	3729977	3729982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11530	NC_009485	GCGGT	2	10	3730041	3730050	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11531	NC_009485	TGCC	2	8	3730076	3730083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_009485	AAC	2	6	3730133	3730138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_009485	CTG	2	6	3730158	3730163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11534	NC_009485	GT	3	6	3734140	3734145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_009485	GGC	2	6	3734166	3734171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_009485	ACG	2	6	3734185	3734190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_009485	TGAAT	2	10	3735411	3735420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_009485	ATG	2	6	3735421	3735426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_009485	TCA	2	6	3735428	3735433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_009485	TAA	2	6	3735436	3735441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_009485	GAGGC	2	10	3735495	3735504	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11542	NC_009485	GGCC	2	8	3736310	3736317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_009485	GC	3	6	3736342	3736347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11544	NC_009485	TCA	2	6	3736386	3736391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_009485	TGC	2	6	3736395	3736400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_009485	CG	4	8	3736408	3736415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11547	NC_009485	GCT	2	6	3736418	3736423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_009485	GGC	2	6	3737187	3737192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_009485	CGC	2	6	3737232	3737237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11550	NC_009485	GGA	2	6	3737282	3737287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_009485	TTG	2	6	3738841	3738846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_009485	GAG	2	6	3738858	3738863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_009485	CGA	2	6	3738869	3738874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_009485	TCGC	2	8	3738920	3738927	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_009485	GAA	2	6	3738941	3738946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_009485	GAC	2	6	3743953	3743958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_009485	GGC	2	6	3743986	3743991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_009485	ACCC	2	8	3744549	3744556	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11559	NC_009485	GAA	2	6	3744594	3744599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11560	NC_009485	GATG	2	8	3744604	3744611	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_009485	CCG	2	6	3744621	3744626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_009485	ACA	2	6	3744692	3744697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_009485	GC	3	6	3745636	3745641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11564	NC_009485	GCG	2	6	3745702	3745707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_009485	GAC	2	6	3745719	3745724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_009485	CAT	2	6	3745793	3745798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_009485	GC	3	6	3747027	3747032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11568	NC_009485	AGG	2	6	3747115	3747120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_009485	TGTT	2	8	3750955	3750962	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_009485	GAC	2	6	3751038	3751043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11571	NC_009485	TCG	2	6	3751050	3751055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11573	NC_009485	GAA	2	6	3751148	3751153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_009485	CGGCTG	2	12	3751171	3751182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_009485	GT	3	6	3751198	3751203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11577	NC_009485	CAA	2	6	3751292	3751297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11582	NC_009485	CGG	2	6	3751363	3751368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11590	NC_009485	GGC	2	6	3751586	3751591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11593	NC_009485	AGG	2	6	3751672	3751677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_009485	GCAGA	2	10	3751680	3751689	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11596	NC_009485	AGG	2	6	3751738	3751743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11601	NC_009485	GAAG	2	8	3751868	3751875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_009485	AAAG	2	8	3751883	3751890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_009485	GCT	2	6	3751905	3751910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11605	NC_009485	GGC	2	6	3751919	3751924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_009485	GCG	2	6	3752013	3752018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_009485	CAA	2	6	3752024	3752029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11608	NC_009485	GCC	2	6	3752101	3752106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11609	NC_009485	GA	3	6	3752112	3752117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_009485	ACG	2	6	3752118	3752123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11611	NC_009485	GCT	2	6	3752185	3752190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11612	NC_009485	CGA	2	6	3752208	3752213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11614	NC_009485	ACG	2	6	3755009	3755014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_009485	CCG	2	6	3755053	3755058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11616	NC_009485	TCGCT	2	10	3755085	3755094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11617	NC_009485	TCT	2	6	3755144	3755149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_009485	GC	3	6	3755181	3755186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11619	NC_009485	CGC	2	6	3758492	3758497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11620	NC_009485	CT	3	6	3758498	3758503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11623	NC_009485	GCT	2	6	3758704	3758709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11624	NC_009485	GACA	2	8	3759864	3759871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11625	NC_009485	TCGC	2	8	3759887	3759894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11626	NC_009485	CGT	2	6	3760043	3760048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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