MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_009485	TCGC	2	8	3557071	3557078	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11002	NC_009485	CGC	2	6	3557096	3557101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11003	NC_009485	GCCA	2	8	3557118	3557125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_009485	GAC	2	6	3557158	3557163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_009485	GAC	2	6	3557326	3557331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_009485	GGC	2	6	3557401	3557406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11007	NC_009485	CGAA	2	8	3557415	3557422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_009485	GCA	2	6	3557425	3557430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11009	NC_009485	CG	3	6	3557440	3557445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11010	NC_009485	GGGA	2	8	3557460	3557467	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_009485	AGC	2	6	3557481	3557486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_009485	GCC	3	9	3557507	3557515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_009485	CG	3	6	3557539	3557544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_009485	CG	3	6	3557633	3557638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_009485	TCG	2	6	3557724	3557729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_009485	GGCGA	2	10	3557834	3557843	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11017	NC_009485	GCT	2	6	3557863	3557868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_009485	AG	3	6	3557873	3557878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_009485	GTG	2	6	3557894	3557899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_009485	TCGT	2	8	3557939	3557946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_009485	CTG	2	6	3557949	3557954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_009485	TCG	2	6	3558099	3558104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_009485	ATC	2	6	3558107	3558112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11024	NC_009485	CGC	2	6	3558139	3558144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_009485	CGA	2	6	3558187	3558192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_009485	AAG	2	6	3561607	3561612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_009485	CGA	2	6	3562037	3562042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_009485	CG	3	6	3562066	3562071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11029	NC_009485	TCGC	2	8	3564137	3564144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_009485	GCGA	3	12	3564148	3564159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_009485	TC	3	6	3564172	3564177	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_009485	CGG	2	6	3564237	3564242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11033	NC_009485	GGC	2	6	3565319	3565324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11034	NC_009485	GAA	2	6	3565347	3565352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_009485	GCC	2	6	3565395	3565400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_009485	CGTC	2	8	3565403	3565410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11037	NC_009485	GCA	2	6	3565424	3565429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_009485	ACG	2	6	3565486	3565491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_009485	GCC	2	6	3565520	3565525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_009485	TCGGC	2	10	3565531	3565540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11041	NC_009485	TTG	2	6	3565549	3565554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_009485	TGC	2	6	3565568	3565573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_009485	ATG	2	6	3565609	3565614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_009485	CGG	2	6	3565699	3565704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_009485	GTT	2	6	3565726	3565731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_009485	CGG	2	6	3565744	3565749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_009485	GAC	2	6	3565825	3565830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11049	NC_009485	ACC	2	6	3565931	3565936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11050	NC_009485	TGG	2	6	3566693	3566698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_009485	CAG	2	6	3566727	3566732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_009485	GAC	2	6	3566763	3566768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_009485	GCG	2	6	3568187	3568192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_009485	TGA	2	6	3568280	3568285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11055	NC_009485	CGA	2	6	3568341	3568346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_009485	CAT	3	9	3568405	3568413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_009485	CAG	2	6	3569085	3569090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_009485	G	6	6	3570476	3570481	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_009485	GGC	2	6	3570523	3570528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_009485	TCG	2	6	3570549	3570554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_009485	CAG	2	6	3571070	3571075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11062	NC_009485	CAT	2	6	3571557	3571562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11063	NC_009485	CAT	2	6	3571566	3571571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_009485	TGC	2	6	3571586	3571591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_009485	CAT	2	6	3571593	3571598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_009485	CAT	2	6	3571617	3571622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_009485	GAT	2	6	3571691	3571696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_009485	GCG	2	6	3571744	3571749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_009485	CG	3	6	3571820	3571825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11070	NC_009485	CGC	2	6	3571907	3571912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11071	NC_009485	TCG	2	6	3571962	3571967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_009485	ACC	2	6	3571970	3571975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11073	NC_009485	GCT	2	6	3571976	3571981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_009485	TCGGA	2	10	3571987	3571996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11075	NC_009485	TTG	2	6	3572005	3572010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_009485	CGG	2	6	3572023	3572028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_009485	TC	3	6	3572588	3572593	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_009485	CTT	2	6	3572594	3572599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_009485	GC	3	6	3577221	3577226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11080	NC_009485	GTCA	2	8	3577723	3577730	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11081	NC_009485	GC	4	8	3577734	3577741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11082	NC_009485	CGT	2	6	3578184	3578189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_009485	AGA	2	6	3578200	3578205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11084	NC_009485	GAC	2	6	3578260	3578265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_009485	GCG	2	6	3578288	3578293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_009485	CG	3	6	3578297	3578302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11087	NC_009485	GCG	2	6	3578305	3578310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11088	NC_009485	GTCGA	2	10	3578378	3578387	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11089	NC_009485	TCG	2	6	3578399	3578404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_009485	CGACT	2	10	3578417	3578426	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11091	NC_009485	GCA	2	6	3580141	3580146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_009485	GAA	2	6	3580299	3580304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_009485	CG	3	6	3580658	3580663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11094	NC_009485	CTT	2	6	3580691	3580696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_009485	CCG	2	6	3580736	3580741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11096	NC_009485	ATGG	2	8	3580765	3580772	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_009485	GC	3	6	3580793	3580798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11098	NC_009485	CTCTT	2	10	3580821	3580830	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11099	NC_009485	CG	3	6	3580866	3580871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11100	NC_009485	GCAGCG	2	12	3581003	3581014	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11101	NC_009485	ATCC	2	8	3581018	3581025	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_009485	TCA	2	6	3581050	3581055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11103	NC_009485	A	6	6	3581151	3581156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_009485	GCCG	2	8	3582891	3582898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11105	NC_009485	GCCA	2	8	3587266	3587273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11106	NC_009485	TTCC	2	8	3587324	3587331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11107	NC_009485	AGT	2	6	3587381	3587386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11109	NC_009485	ACA	2	6	3587430	3587435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_009485	CGAT	2	8	3588607	3588614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11111	NC_009485	CGGC	2	8	3589321	3589328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11112	NC_009485	TC	4	8	3589345	3589352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11113	NC_009485	CAT	2	6	3589356	3589361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_009485	TCG	2	6	3589462	3589467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_009485	ACGCT	2	10	3589475	3589484	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11116	NC_009485	ATG	2	6	3589531	3589536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_009485	CCT	3	9	3589538	3589546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_009485	TCTCG	2	10	3589625	3589634	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11119	NC_009485	GCACG	2	10	3592086	3592095	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11120	NC_009485	CG	4	8	3592099	3592106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11121	NC_009485	TCG	2	6	3592119	3592124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_009485	GCT	2	6	3592150	3592155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_009485	GCC	2	6	3592179	3592184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11124	NC_009485	CGC	2	6	3592187	3592192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11125	NC_009485	CACTTC	2	12	3592204	3592215	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11127	NC_009485	GCG	2	6	3592648	3592653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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