MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_009485	GAC	2	6	3362685	3362690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_009485	AGA	2	6	3362691	3362696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_009485	GATC	2	8	3362726	3362733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10504	NC_009485	TTG	2	6	3362853	3362858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_009485	AAG	2	6	3362909	3362914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_009485	ACA	2	6	3362983	3362988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10507	NC_009485	GT	3	6	3362998	3363003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_009485	GAA	2	6	3363113	3363118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_009485	GTC	2	6	3363235	3363240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_009485	AGG	2	6	3363293	3363298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_009485	GGA	2	6	3363338	3363343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_009485	TAG	2	6	3363367	3363372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_009485	GCGA	2	8	3363375	3363382	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10514	NC_009485	G	6	6	3363523	3363528	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_009485	ACC	2	6	3363529	3363534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10516	NC_009485	CTC	2	6	3363550	3363555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10517	NC_009485	CGA	2	6	3363604	3363609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10518	NC_009485	CGT	2	6	3363677	3363682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10519	NC_009485	TAT	2	6	3363691	3363696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_009485	TAGGCG	2	12	3363735	3363746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10521	NC_009485	GGA	2	6	3363846	3363851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_009485	CCAA	2	8	3364024	3364031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_009485	CGG	2	6	3364068	3364073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_009485	CGTC	2	8	3364081	3364088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10525	NC_009485	AAC	2	6	3364100	3364105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_009485	AGG	2	6	3364174	3364179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_009485	AGC	2	6	3364190	3364195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_009485	AAAG	2	8	3364204	3364211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_009485	TGT	2	6	3364552	3364557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_009485	GA	3	6	3364668	3364673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_009485	AGG	2	6	3364720	3364725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_009485	AGAGG	2	10	3364856	3364865	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_009485	CGG	2	6	3364895	3364900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_009485	GGT	2	6	3365113	3365118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_009485	ACC	2	6	3365167	3365172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10536	NC_009485	TGG	2	6	3365227	3365232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10537	NC_009485	TCGT	2	8	3365306	3365313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10538	NC_009485	GCCT	2	8	3365331	3365338	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10539	NC_009485	GGT	2	6	3365390	3365395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_009485	TGA	2	6	3365451	3365456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_009485	CGT	2	6	3365480	3365485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_009485	TCA	2	6	3365505	3365510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10543	NC_009485	CGT	2	6	3365585	3365590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_009485	TGG	2	6	3365678	3365683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_009485	TGT	2	6	3365687	3365692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_009485	GCA	2	6	3365708	3365713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10548	NC_009485	GAC	2	6	3365799	3365804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10549	NC_009485	GCA	2	6	3365831	3365836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_009485	ATGC	2	8	3365837	3365844	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10551	NC_009485	GAT	2	6	3365908	3365913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_009485	CAAC	2	8	3365937	3365944	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10553	NC_009485	GCTT	2	8	3365950	3365957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10554	NC_009485	TGG	2	6	3365984	3365989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_009485	GAG	2	6	3365997	3366002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_009485	ATCCC	2	10	3366013	3366022	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10557	NC_009485	CTC	2	6	3366039	3366044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_009485	CAA	4	12	3366125	3366136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10559	NC_009485	CGC	2	6	3366137	3366142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10560	NC_009485	GCG	2	6	3366157	3366162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_009485	CGT	2	6	3366176	3366181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_009485	TGC	2	6	3366186	3366191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_009485	TGC	2	6	3366197	3366202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10564	NC_009485	ATC	2	6	3366230	3366235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10568	NC_009485	CGC	2	6	3369240	3369245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10569	NC_009485	GCG	2	6	3369259	3369264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10570	NC_009485	GGA	2	6	3369273	3369278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10572	NC_009485	CGG	2	6	3370655	3370660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_009485	CAC	2	6	3370664	3370669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10574	NC_009485	CGT	2	6	3370699	3370704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_009485	CGGC	2	8	3370721	3370728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10576	NC_009485	GCTGTA	2	12	3370747	3370758	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10577	NC_009485	CG	3	6	3370767	3370772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10579	NC_009485	CATC	2	8	3371182	3371189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10582	NC_009485	GCA	2	6	3376568	3376573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_009485	T	6	6	3376610	3376615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_009485	GAA	2	6	3376625	3376630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10589	NC_009485	GA	3	6	3380173	3380178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_009485	ATCA	2	8	3382154	3382161	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10591	NC_009485	CTG	2	6	3388285	3388290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_009485	GCG	2	6	3388335	3388340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10593	NC_009485	CGA	2	6	3388413	3388418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10595	NC_009485	AG	3	6	3389430	3389435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10598	NC_009485	TGG	2	6	3398602	3398607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_009485	GCC	3	9	3398613	3398621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10604	NC_009485	GC	3	6	3405453	3405458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10605	NC_009485	GTG	2	6	3405472	3405477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10609	NC_009485	TGC	2	6	3406715	3406720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10611	NC_009485	GGCG	2	8	3406758	3406765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_009485	GCT	2	6	3406784	3406789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10613	NC_009485	GA	3	6	3406811	3406816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_009485	GAG	2	6	3406843	3406848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_009485	CGCGA	2	10	3406858	3406867	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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10621	NC_009485	CGCC	2	8	3407085	3407092	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10622	NC_009485	CGG	2	6	3407186	3407191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_009485	GGAT	2	8	3407199	3407206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10625	NC_009485	TGA	2	6	3411757	3411762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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