MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009485	ATCG	2	8	1571531	1571538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_009485	CTGG	2	8	1571562	1571569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5003	NC_009485	CT	3	6	1571598	1571603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_009485	GCG	2	6	1572530	1572535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_009485	TC	3	6	1572536	1572541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5006	NC_009485	CGG	2	6	1572561	1572566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_009485	GGC	2	6	1572648	1572653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_009485	CCG	2	6	1572660	1572665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_009485	CGA	2	6	1572683	1572688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_009485	GCC	2	6	1572737	1572742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_009485	TCC	2	6	1572752	1572757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_009485	CCGC	2	8	1572802	1572809	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5013	NC_009485	CCT	2	6	1572867	1572872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_009485	GAC	2	6	1572886	1572891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_009485	CCG	2	6	1572898	1572903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_009485	GCA	2	6	1573372	1573377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_009485	ACC	2	6	1573825	1573830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_009485	GGT	3	9	1573892	1573900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009485	CTG	2	6	1574428	1574433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_009485	TCG	3	9	1574438	1574446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_009485	CG	3	6	1574467	1574472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_009485	CT	4	8	1574569	1574576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5023	NC_009485	TC	4	8	1574582	1574589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5024	NC_009485	TTTC	2	8	1574620	1574627	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5025	NC_009485	TTC	2	6	1574795	1574800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5027	NC_009485	TCC	2	6	1574875	1574880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_009485	GGT	2	6	1574948	1574953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009485	CCCG	2	8	1575326	1575333	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5030	NC_009485	GCGG	2	8	1575340	1575347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5031	NC_009485	CA	3	6	1575359	1575364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_009485	GAA	2	6	1575391	1575396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009485	TCG	2	6	1575697	1575702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_009485	TTA	2	6	1575721	1575726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5036	NC_009485	GGC	2	6	1575778	1575783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_009485	AAGT	2	8	1575803	1575810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_009485	GCTA	2	8	1576217	1576224	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5039	NC_009485	ATT	2	6	1576243	1576248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_009485	GCGG	2	8	1576390	1576397	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_009485	CGC	2	6	1576401	1576406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_009485	TTC	2	6	1577104	1577109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_009485	GC	3	6	1577129	1577134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_009485	CG	3	6	1577977	1577982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_009485	CGA	2	6	1577988	1577993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5047	NC_009485	CGG	2	6	1578037	1578042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5049	NC_009485	CG	3	6	1578347	1578352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5050	NC_009485	GC	3	6	1579492	1579497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_009485	CGC	2	6	1579592	1579597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5057	NC_009485	GCCT	2	8	1584118	1584125	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_009485	CTC	2	6	1585841	1585846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5060	NC_009485	GAA	2	6	1586369	1586374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_009485	ATGGA	2	10	1586391	1586400	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_009485	ATG	2	6	1586532	1586537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_009485	GC	3	6	1586570	1586575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_009485	TAG	2	6	1587815	1587820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5069	NC_009485	TCT	2	6	1589643	1589648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_009485	CGT	2	6	1592862	1592867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5073	NC_009485	CGG	3	9	1592910	1592918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5085	NC_009485	GCC	2	6	1598390	1598395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5089	NC_009485	GCG	2	6	1598481	1598486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5092	NC_009485	GAG	2	6	1598729	1598734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_009485	TGA	2	6	1598759	1598764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5095	NC_009485	TCA	2	6	1598804	1598809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5097	NC_009485	CTGT	2	8	1598894	1598901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_009485	GCA	2	6	1599158	1599163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5101	NC_009485	GTT	2	6	1600299	1600304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_009485	TCAAA	2	10	1600330	1600339	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5103	NC_009485	ATC	2	6	1600340	1600345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_009485	AT	3	6	1600359	1600364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_009485	GCC	2	6	1600398	1600403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5107	NC_009485	GA	3	6	1601352	1601357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_009485	CGA	2	6	1602625	1602630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5110	NC_009485	GAT	2	6	1606010	1606015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_009485	CAA	2	6	1606060	1606065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_009485	CCG	2	6	1606160	1606165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_009485	TTGG	2	8	1606186	1606193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_009485	TGGC	2	8	1606206	1606213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5115	NC_009485	GC	3	6	1606212	1606217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_009485	GGC	2	6	1606234	1606239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_009485	AGGC	2	8	1606317	1606324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5118	NC_009485	TGGCC	2	10	1606351	1606360	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_009485	T	6	6	1606395	1606400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009485	GTG	2	6	1606409	1606414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_009485	GC	3	6	1608301	1608306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5122	NC_009485	GGT	2	6	1608512	1608517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_009485	CGG	2	6	1608533	1608538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_009485	GC	3	6	1608564	1608569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_009485	TGT	2	6	1608580	1608585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_009485	CGGTCG	2	12	1608637	1608648	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_009485	CGA	2	6	1608650	1608655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_009485	ACC	2	6	1608663	1608668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_009485	GGC	2	6	1609113	1609118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_009485	GCGTT	2	10	1609124	1609133	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5131	NC_009485	ATC	2	6	1609146	1609151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_009485	GCTC	2	8	1612477	1612484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_009485	GCT	2	6	1612506	1612511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_009485	CGAT	2	8	1612558	1612565	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5135	NC_009485	ATTG	2	8	1612735	1612742	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5143	NC_009485	GC	3	6	1613315	1613320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5144	NC_009485	CG	3	6	1613326	1613331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5145	NC_009485	GCG	2	6	1614436	1614441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5159	NC_009485	GGC	2	6	1621782	1621787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5163	NC_009485	CCGT	2	8	1621897	1621904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5255	NC_009485	GGT	2	6	1642307	1642312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5481	NC_009485	CCCTCC	2	12	1695177	1695188	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
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5490	NC_009485	ATG	2	6	1699177	1699182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_009485	TCG	2	6	1699414	1699419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5492	NC_009485	CG	4	8	1699418	1699425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5493	NC_009485	CGC	2	6	1699453	1699458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5496	NC_009485	CG	3	6	1702384	1702389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5497	NC_009485	CAGCC	2	10	1702418	1702427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5499	NC_009485	GGCG	2	8	1702452	1702459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_009485	GC	3	6	1703959	1703964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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