MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 chromosome

Total Repeats: 26279

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_009485	GA	3	6	1462713	1462718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_009485	GCCCCA	2	12	1463845	1463856	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_009485	GTC	2	6	1463860	1463865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_009485	GGCT	2	8	1463959	1463966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_009485	GCCG	2	8	1464008	1464015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_009485	A	6	6	1464051	1464056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_009485	TGG	2	6	1464095	1464100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_009485	TCC	2	6	1464593	1464598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_009485	CCCG	2	8	1464620	1464627	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4510	NC_009485	CGGGC	2	10	1464632	1464641	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4511	NC_009485	GCC	2	6	1464701	1464706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NC_009485	CTGC	2	8	1465751	1465758	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_009485	C	6	6	1465779	1465784	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4514	NC_009485	CGCGG	2	10	1467354	1467363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4515	NC_009485	CTC	2	6	1467364	1467369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_009485	TCC	2	6	1469162	1469167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_009485	GTT	2	6	1469210	1469215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_009485	CGGC	2	8	1469239	1469246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_009485	GTT	2	6	1469319	1469324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_009485	TGTC	2	8	1469330	1469337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_009485	CG	4	8	1469347	1469354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_009485	CAAGC	2	10	1469393	1469402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4523	NC_009485	GC	3	6	1469504	1469509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_009485	TGT	2	6	1469524	1469529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_009485	CTT	2	6	1469536	1469541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_009485	GTG	2	6	1469620	1469625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_009485	GAGT	2	8	1469640	1469647	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_009485	TGA	2	6	1469649	1469654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_009485	TCG	2	6	1469696	1469701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_009485	CG	3	6	1469712	1469717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_009485	GA	4	8	1469769	1469776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_009485	CGT	2	6	1469802	1469807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_009485	TG	3	6	1469840	1469845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_009485	CAC	2	6	1469940	1469945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_009485	CAC	2	6	1469951	1469956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_009485	AGG	2	6	1470030	1470035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_009485	CTCGC	2	10	1470268	1470277	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4538	NC_009485	CG	3	6	1470279	1470284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4539	NC_009485	GCA	2	6	1470349	1470354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_009485	CGA	2	6	1470407	1470412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_009485	GCG	2	6	1470455	1470460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_009485	GAG	2	6	1470473	1470478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_009485	GTC	2	6	1470491	1470496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_009485	GGTG	2	8	1470519	1470526	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_009485	CGG	2	6	1470527	1470532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_009485	ATCA	2	8	1470544	1470551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_009485	CGA	2	6	1470555	1470560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_009485	CGC	2	6	1470567	1470572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4549	NC_009485	GC	3	6	1470641	1470646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_009485	GTC	2	6	1470723	1470728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_009485	TGC	2	6	1470836	1470841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4552	NC_009485	AAG	2	6	1471889	1471894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_009485	ACCG	2	8	1471941	1471948	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_009485	GCC	2	6	1471950	1471955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_009485	C	6	6	1473538	1473543	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4556	NC_009485	CCG	2	6	1476101	1476106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_009485	ACG	2	6	1478996	1479001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_009485	ATGA	2	8	1479077	1479084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_009485	CG	3	6	1481025	1481030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_009485	CGT	2	6	1482793	1482798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_009485	GCA	2	6	1484362	1484367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4562	NC_009485	GCCT	2	8	1484386	1484393	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_009485	A	8	8	1487350	1487357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_009485	CGA	2	6	1487424	1487429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_009485	GCC	2	6	1488330	1488335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_009485	AGC	2	6	1488390	1488395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_009485	G	6	6	1488426	1488431	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_009485	TGA	2	6	1488487	1488492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_009485	T	7	7	1488554	1488560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_009485	GA	3	6	1488572	1488577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_009485	TTG	2	6	1488612	1488617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_009485	CCT	2	6	1488648	1488653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_009485	TCC	2	6	1488662	1488667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NC_009485	T	8	8	1488701	1488708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_009485	CCG	2	6	1488741	1488746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_009485	CT	3	6	1489715	1489720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_009485	AAC	2	6	1489795	1489800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_009485	CGA	2	6	1489811	1489816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_009485	AGA	2	6	1489825	1489830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_009485	GGC	2	6	1489918	1489923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_009485	CGCTC	2	10	1489926	1489935	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4582	NC_009485	GAC	2	6	1489948	1489953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_009485	GCC	2	6	1490322	1490327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_009485	GGC	2	6	1490328	1490333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_009485	ATT	2	6	1490350	1490355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_009485	TGCC	2	8	1490380	1490387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_009485	CGA	2	6	1490418	1490423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_009485	CGC	2	6	1491939	1491944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_009485	CTT	2	6	1491946	1491951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_009485	CGGG	2	8	1491975	1491982	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_009485	TC	5	10	1492090	1492099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4592	NC_009485	ATC	2	6	1492127	1492132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_009485	GAG	2	6	1492154	1492159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_009485	GTC	2	6	1492177	1492182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_009485	CGG	2	6	1492187	1492192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4596	NC_009485	GCC	2	6	1492254	1492259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_009485	CAAC	2	8	1492305	1492312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4598	NC_009485	GGC	2	6	1492332	1492337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_009485	GCG	2	6	1492363	1492368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_009485	GGA	2	6	1493047	1493052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_009485	AAG	2	6	1493836	1493841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_009485	TACT	2	8	1493889	1493896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_009485	CAA	3	9	1493947	1493955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_009485	GC	3	6	1494730	1494735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_009485	GAA	2	6	1494863	1494868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_009485	CCGT	2	8	1495168	1495175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4607	NC_009485	GCAAT	2	10	1495256	1495265	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4608	NC_009485	CTG	2	6	1495394	1495399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_009485	TTC	2	6	1496936	1496941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_009485	TCG	2	6	1496984	1496989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_009485	CCA	2	6	1497045	1497050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4612	NC_009485	GAT	2	6	1497079	1497084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_009485	CGA	2	6	1497099	1497104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_009485	CT	3	6	1497113	1497118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_009485	CGG	2	6	1497225	1497230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_009485	GCAG	2	8	1497254	1497261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_009485	ACC	2	6	1497280	1497285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4618	NC_009485	TTC	2	6	1497314	1497319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_009485	CGG	2	6	1497330	1497335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_009485	CAG	2	6	1497435	1497440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4621	NC_009485	CAG	2	6	1497471	1497476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_009485	GCG	2	6	1499124	1499129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_009485	CGAA	2	8	1499130	1499137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4624	NC_009485	AGC	2	6	1499162	1499167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_009485	CGA	2	6	1499291	1499296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_009485	GGA	2	6	1499371	1499376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_009485	GGCT	2	8	1499706	1499713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_009485	TTG	2	6	1499748	1499753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_009485	AGC	2	6	1499811	1499816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4631	NC_009485	GT	3	6	1499861	1499866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4893	NC_009485	CGC	2	6	1550439	1550444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4989	NC_009485	CCG	2	6	1571076	1571081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4995	NC_009485	CAGCC	2	10	1571278	1571287	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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