MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009445	AC	3	6	1176198	1176203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4002	NC_009445	TGC	2	6	1177251	1177256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_009445	AGCC	2	8	1177267	1177274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_009445	CTG	2	6	1177281	1177286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_009445	GCC	2	6	1177680	1177685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_009445	CGG	2	6	1177691	1177696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_009445	T	7	7	1177700	1177706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_009445	GCA	2	6	1177708	1177713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_009445	GTT	2	6	1177747	1177752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009445	GAG	2	6	1177872	1177877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009445	AAC	2	6	1177879	1177884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_009445	TCC	3	9	1177886	1177894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_009445	GCG	2	6	1177937	1177942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_009445	TGC	2	6	1178028	1178033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_009445	TCA	2	6	1178067	1178072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_009445	TCA	2	6	1178097	1178102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_009445	CTCGGC	2	12	1178651	1178662	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_009445	ACAA	2	8	1178692	1178699	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4019	NC_009445	GGC	2	6	1178766	1178771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_009445	GCG	2	6	1179020	1179025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_009445	CGA	2	6	1179031	1179036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_009445	GTC	2	6	1179066	1179071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_009445	CAA	2	6	1181111	1181116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_009445	CCAT	2	8	1181207	1181214	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_009445	CGC	2	6	1181456	1181461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_009445	GTC	2	6	1181471	1181476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_009445	TTC	2	6	1181539	1181544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_009445	CTG	2	6	1181554	1181559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_009445	GAC	2	6	1181606	1181611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_009445	GGTG	2	8	1181615	1181622	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_009445	TG	3	6	1182146	1182151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_009445	G	6	6	1184397	1184402	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_009445	CG	3	6	1186346	1186351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_009445	CG	3	6	1186387	1186392	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_009445	GCC	2	6	1186467	1186472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_009445	GCA	2	6	1186491	1186496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_009445	GC	3	6	1186497	1186502	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_009445	CG	3	6	1186609	1186614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_009445	GAT	2	6	1190970	1190975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_009445	CTCCC	2	10	1191006	1191015	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4041	NC_009445	GGGGA	2	10	1191022	1191031	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009445	GC	3	6	1191046	1191051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_009445	TC	3	6	1191138	1191143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_009445	CGCT	2	8	1191165	1191172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_009445	AGC	2	6	1191193	1191198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_009445	GTC	2	6	1191777	1191782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_009445	ACG	2	6	1191855	1191860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_009445	GGT	2	6	1191864	1191869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009445	GAC	2	6	1191893	1191898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_009445	TCT	2	6	1191928	1191933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_009445	GC	3	6	1192790	1192795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_009445	TGGC	2	8	1192826	1192833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_009445	GCC	2	6	1192852	1192857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_009445	CGGC	2	8	1192873	1192880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_009445	GCC	2	6	1194689	1194694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_009445	TCG	2	6	1194698	1194703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_009445	CGC	2	6	1194704	1194709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_009445	TCA	2	6	1194711	1194716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_009445	GTG	2	6	1194795	1194800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_009445	GCC	2	6	1194815	1194820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_009445	CGCGG	2	10	1194827	1194836	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4062	NC_009445	CAT	2	6	1194876	1194881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_009445	GAC	2	6	1194890	1194895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_009445	CCTGC	2	10	1194897	1194906	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4065	NC_009445	TCG	2	6	1194995	1195000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_009445	CGG	2	6	1195023	1195028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_009445	C	7	7	1195036	1195042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4068	NC_009445	GCG	2	6	1195045	1195050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_009445	CGG	2	6	1195116	1195121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_009445	CGT	2	6	1195145	1195150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_009445	GCGA	2	8	1195168	1195175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_009445	CCCG	2	8	1195188	1195195	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4073	NC_009445	GGCTC	2	10	1195276	1195285	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4074	NC_009445	TCA	2	6	1195286	1195291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_009445	TTG	2	6	1195393	1195398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_009445	CGGCG	2	10	1195445	1195454	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_009445	CGT	2	6	1195471	1195476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_009445	CGT	2	6	1195492	1195497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_009445	GAC	2	6	1195521	1195526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_009445	GA	4	8	1195530	1195537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_009445	AG	3	6	1195625	1195630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_009445	TGA	3	9	1196728	1196736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_009445	GCG	2	6	1196747	1196752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_009445	ACGC	2	8	1196757	1196764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_009445	CTG	2	6	1196772	1196777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_009445	CGG	2	6	1196799	1196804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_009445	GGC	2	6	1196816	1196821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_009445	AGC	2	6	1196864	1196869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4090	NC_009445	CGG	2	6	1198491	1198496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_009445	GTC	2	6	1198513	1198518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_009445	CAG	3	9	1198560	1198568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_009445	GTC	2	6	1198617	1198622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_009445	TCC	2	6	1199717	1199722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_009445	CGGG	2	8	1199771	1199778	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_009445	CAT	2	6	1201778	1201783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_009445	TGC	2	6	1201790	1201795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_009445	GAG	2	6	1201806	1201811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_009445	CCG	2	6	1201813	1201818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_009445	GTC	2	6	1201825	1201830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_009445	CCT	2	6	1201891	1201896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_009445	GCG	2	6	1201912	1201917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_009445	GGA	2	6	1201935	1201940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_009445	CGA	2	6	1201991	1201996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4106	NC_009445	TGA	2	6	1204032	1204037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_009445	GCC	2	6	1204045	1204050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4108	NC_009445	TAG	2	6	1204146	1204151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_009445	AAC	2	6	1205005	1205010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_009445	TCA	2	6	1205011	1205016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_009445	CTC	2	6	1205037	1205042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_009445	ACG	2	6	1205080	1205085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_009445	GACA	2	8	1205093	1205100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4114	NC_009445	CGG	2	6	1205145	1205150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_009445	GC	3	6	1205198	1205203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_009445	TCC	2	6	1205661	1205666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_009445	GC	4	8	1205670	1205677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4118	NC_009445	GCG	2	6	1205694	1205699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_009445	GAC	2	6	1205762	1205767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_009445	GC	3	6	1205781	1205786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_009445	GTC	2	6	1205806	1205811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4124	NC_009445	CTG	2	6	1205984	1205989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4127	NC_009445	CGG	2	6	1209113	1209118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_009445	GCC	2	6	1209119	1209124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4129	NC_009445	GC	3	6	1209131	1209136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_009445	GGT	2	6	1209142	1209147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_009445	GCT	2	6	1209176	1209181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_009445	CGG	2	6	1209182	1209187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_009445	GA	4	8	1209252	1209259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_009445	CAG	2	6	1209260	1209265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4137	NC_009445	CTG	2	6	1209360	1209365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4138	NC_009445	ATG	2	6	1209394	1209399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4140	NC_009445	CCG	2	6	1210112	1210117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4142	NC_009445	CTG	2	6	1210281	1210286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_009445	GCTCGC	2	12	1211437	1211448	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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4242	NC_009445	CGG	2	6	1240919	1240924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_009445	ATCG	2	8	1243321	1243328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4248	NC_009445	GCGG	2	8	1243340	1243347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4249	NC_009445	TCC	2	6	1243405	1243410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4250	NC_009445	CGG	2	6	1243420	1243425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4252	NC_009445	GCA	2	6	1244690	1244695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4255	NC_009445	CGT	2	6	1247240	1247245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_009445	CG	3	6	1247263	1247268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_009445	CG	4	8	1247272	1247279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_009445	CT	3	6	1247338	1247343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4259	NC_009445	TG	3	6	1247452	1247457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_009445	CGG	2	6	1247479	1247484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4261	NC_009445	CG	3	6	1248209	1248214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4262	NC_009445	GCT	2	6	1248342	1248347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_009445	TCC	2	6	1248492	1248497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4264	NC_009445	CCAT	2	8	1249079	1249086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4265	NC_009445	GTC	2	6	1249119	1249124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4267	NC_009445	CG	4	8	1250193	1250200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4268	NC_009445	CG	4	8	1250209	1250216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4269	NC_009445	TGT	2	6	1250230	1250235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4272	NC_009445	ACC	2	6	1251397	1251402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4273	NC_009445	CGG	2	6	1251408	1251413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4274	NC_009445	T	7	7	1251429	1251435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_009445	TCC	2	6	1257614	1257619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4281	NC_009445	GCCG	2	8	1258359	1258366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4282	NC_009445	CGC	2	6	1258401	1258406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4283	NC_009445	GCG	2	6	1258418	1258423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4284	NC_009445	GCC	2	6	1258432	1258437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4293	NC_009445	CG	3	6	1262628	1262633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4294	NC_009445	TGT	3	9	1262698	1262706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4301	NC_009445	GC	3	6	1263143	1263148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4302	NC_009445	GCG	2	6	1263151	1263156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4306	NC_009445	ACAG	2	8	1264892	1264899	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4321	NC_009445	TTG	2	6	1271216	1271221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4332	NC_009445	CG	4	8	1272292	1272299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4372	NC_009445	GAT	3	9	1284743	1284751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4373	NC_009445	TCCCA	2	10	1284755	1284764	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4378	NC_009445	ATC	2	6	1288964	1288969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4380	NC_009445	CGG	2	6	1290595	1290600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4381	NC_009445	GCTC	2	8	1292722	1292729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4382	NC_009445	CGC	2	6	1292730	1292735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4383	NC_009445	GCAGG	2	10	1292748	1292757	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4384	NC_009445	CCG	2	6	1292787	1292792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4385	NC_009445	GATT	2	8	1292805	1292812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4386	NC_009445	CGGCG	2	10	1292860	1292869	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4387	NC_009445	CGT	2	6	1292886	1292891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4388	NC_009445	GAC	2	6	1292905	1292910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4390	NC_009445	GAC	2	6	1292938	1292943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4391	NC_009445	GA	4	8	1292947	1292954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4392	NC_009445	AGGG	2	8	1292995	1293002	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_009445	GCT	2	6	1293018	1293023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4423	NC_009445	CGG	2	6	1306415	1306420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4431	NC_009445	AGCG	2	8	1309361	1309368	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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