MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_009445	GC	3	6	5977541	5977546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19002	NC_009445	GC	3	6	5977554	5977559	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19003	NC_009445	ATC	3	9	5977865	5977873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_009445	GTC	2	6	5977916	5977921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_009445	ATCGG	2	10	5977957	5977966	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19006	NC_009445	GCC	2	6	5978943	5978948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19007	NC_009445	CGG	2	6	5978961	5978966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19008	NC_009445	GCTGC	2	10	5979052	5979061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19009	NC_009445	CG	4	8	5979062	5979069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_009445	GCA	2	6	5979101	5979106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_009445	CAG	2	6	5979108	5979113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_009445	CTTG	2	8	5979133	5979140	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19013	NC_009445	CGC	2	6	5979148	5979153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19014	NC_009445	TGT	2	6	5979162	5979167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19015	NC_009445	CAT	2	6	5979179	5979184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19016	NC_009445	GTT	2	6	5979186	5979191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19017	NC_009445	TTGC	2	8	5979194	5979201	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19018	NC_009445	TCCC	2	8	5981901	5981908	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19019	NC_009445	TGG	2	6	5981917	5981922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_009445	CAT	2	6	5981924	5981929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_009445	AAGC	2	8	5981947	5981954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19022	NC_009445	GCC	2	6	5983228	5983233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19023	NC_009445	TGCA	2	8	5984050	5984057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19024	NC_009445	GCC	2	6	5984061	5984066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19025	NC_009445	T	6	6	5984141	5984146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_009445	GCA	2	6	5985532	5985537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19027	NC_009445	TTA	2	6	5985562	5985567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19028	NC_009445	GAG	2	6	5985600	5985605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_009445	CGA	2	6	5985611	5985616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19030	NC_009445	CG	3	6	5985632	5985637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19031	NC_009445	C	6	6	5985691	5985696	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19032	NC_009445	CGT	2	6	5985705	5985710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19034	NC_009445	GGA	2	6	5985848	5985853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_009445	GCA	2	6	5985867	5985872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19036	NC_009445	CGCC	2	8	5985879	5985886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19037	NC_009445	GTT	2	6	5985894	5985899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_009445	CGC	2	6	5985905	5985910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19039	NC_009445	GAG	2	6	5985933	5985938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19040	NC_009445	CGA	2	6	5985944	5985949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19041	NC_009445	CG	3	6	5985965	5985970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19042	NC_009445	CGT	2	6	5986038	5986043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19043	NC_009445	AGT	2	6	5986079	5986084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19045	NC_009445	CG	3	6	5986204	5986209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19046	NC_009445	TGC	2	6	5986240	5986245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19047	NC_009445	CGT	2	6	5986438	5986443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19048	NC_009445	CG	3	6	5986445	5986450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19049	NC_009445	CAA	2	6	5986461	5986466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19050	NC_009445	TCCG	2	8	5986512	5986519	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19051	NC_009445	GTC	2	6	5986531	5986536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19052	NC_009445	GAC	2	6	5986581	5986586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_009445	GCC	2	6	5986685	5986690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19054	NC_009445	GCA	2	6	5987151	5987156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19055	NC_009445	GAC	2	6	5987178	5987183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_009445	CTC	2	6	5987275	5987280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19057	NC_009445	CG	3	6	5987676	5987681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19058	NC_009445	CCG	2	6	5988200	5988205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19059	NC_009445	GCA	2	6	5988230	5988235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_009445	ATC	2	6	5988236	5988241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19061	NC_009445	CCG	2	6	5989329	5989334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19062	NC_009445	GCT	2	6	5989354	5989359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19063	NC_009445	CGC	2	6	5989518	5989523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19064	NC_009445	CGC	2	6	5989566	5989571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19065	NC_009445	TCGA	2	8	5989578	5989585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19066	NC_009445	GAGCG	2	10	5989670	5989679	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19067	NC_009445	CTCG	2	8	5989703	5989710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19068	NC_009445	TCGCT	2	10	5989725	5989734	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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19071	NC_009445	C	6	6	5989786	5989791	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19072	NC_009445	G	6	6	5991908	5991913	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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19075	NC_009445	CT	3	6	5991976	5991981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19076	NC_009445	GCA	2	6	5991993	5991998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19083	NC_009445	GACT	2	8	5992177	5992184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19084	NC_009445	ATCG	2	8	5992224	5992231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19085	NC_009445	CAAC	2	8	5992278	5992285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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19088	NC_009445	CG	3	6	5993453	5993458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19089	NC_009445	GC	3	6	5993466	5993471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19090	NC_009445	GCG	2	6	5993495	5993500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19091	NC_009445	GAG	2	6	5993541	5993546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19094	NC_009445	TA	3	6	5993619	5993624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19095	NC_009445	GTT	2	6	5994490	5994495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19096	NC_009445	CGA	2	6	5994510	5994515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19097	NC_009445	CAAA	2	8	5994573	5994580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19098	NC_009445	CG	3	6	5994817	5994822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19099	NC_009445	TCG	2	6	5994863	5994868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19101	NC_009445	CCG	2	6	5994879	5994884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19102	NC_009445	GCC	2	6	5994910	5994915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19103	NC_009445	ACC	2	6	5996681	5996686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19104	NC_009445	CTCCC	2	10	5996710	5996719	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19105	NC_009445	C	6	6	5996717	5996722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19106	NC_009445	ACCCCC	2	12	5996792	5996803	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19107	NC_009445	C	13	13	5996805	5996817	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19108	NC_009445	GGGGA	2	10	5996823	5996832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19109	NC_009445	GAG	2	6	5999402	5999407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19110	NC_009445	GCC	2	6	5999469	5999474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19111	NC_009445	CCT	2	6	5999483	5999488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19112	NC_009445	AGG	2	6	5999514	5999519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19113	NC_009445	GTC	2	6	6000213	6000218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19114	NC_009445	CGT	2	6	6000245	6000250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19115	NC_009445	GAC	2	6	6000297	6000302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19116	NC_009445	TCG	2	6	6000339	6000344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19117	NC_009445	CA	3	6	6000349	6000354	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19118	NC_009445	TCGCA	2	10	6000357	6000366	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19119	NC_009445	CAC	2	6	6000402	6000407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19120	NC_009445	ACC	2	6	6000416	6000421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19121	NC_009445	TG	3	6	6000441	6000446	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19122	NC_009445	A	6	6	6000495	6000500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19123	NC_009445	CGA	2	6	6000509	6000514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19125	NC_009445	GTC	2	6	6000565	6000570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19126	NC_009445	CG	3	6	6000587	6000592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19127	NC_009445	CGC	2	6	6000602	6000607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19128	NC_009445	CT	3	6	6004254	6004259	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19129	NC_009445	CGC	2	6	6005467	6005472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19130	NC_009445	TCGGCG	2	12	6005474	6005485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19131	NC_009445	CGCC	2	8	6005535	6005542	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19132	NC_009445	TCGA	2	8	6006889	6006896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19133	NC_009445	CCGG	2	8	6006905	6006912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19134	NC_009445	GCCG	2	8	6006920	6006927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19135	NC_009445	TGC	2	6	6007041	6007046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19136	NC_009445	CTCCC	2	10	6007062	6007071	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19137	NC_009445	GCA	2	6	6007152	6007157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19138	NC_009445	ACCCCC	2	12	6007197	6007208	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
19139	NC_009445	GGGGA	2	10	6007225	6007234	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19140	NC_009445	GGC	2	6	6007314	6007319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19141	NC_009445	CCT	2	6	6010153	6010158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19142	NC_009445	CGC	2	6	6010189	6010194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19143	NC_009445	TCA	2	6	6010285	6010290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19144	NC_009445	CCG	2	6	6012322	6012327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19145	NC_009445	TGC	2	6	6012332	6012337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19146	NC_009445	GC	3	6	6012392	6012397	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19147	NC_009445	CGCAA	2	10	6012431	6012440	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
19148	NC_009445	TGCA	2	8	6012443	6012450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19149	NC_009445	TCC	2	6	6012567	6012572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19150	NC_009445	ACGC	2	8	6012617	6012624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19151	NC_009445	GAA	2	6	6012625	6012630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19154	NC_009445	GCG	2	6	6012711	6012716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19155	NC_009445	CG	3	6	6012722	6012727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19156	NC_009445	CGCCAG	2	12	6012735	6012746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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19158	NC_009445	CGT	2	6	6012772	6012777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19159	NC_009445	CGA	2	6	6012796	6012801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19160	NC_009445	GTCG	2	8	6012915	6012922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19161	NC_009445	ACG	2	6	6012935	6012940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19162	NC_009445	CGT	2	6	6012960	6012965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19166	NC_009445	TCC	2	6	6013298	6013303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19167	NC_009445	TGGC	2	8	6013337	6013344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19168	NC_009445	GGGCC	2	10	6013359	6013368	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19169	NC_009445	A	6	6	6013386	6013391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19170	NC_009445	ATAG	2	8	6013406	6013413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19171	NC_009445	GCA	2	6	6013414	6013419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19239	NC_009445	CGA	2	6	6055092	6055097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19243	NC_009445	CGGC	2	8	6055834	6055841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19244	NC_009445	CGC	2	6	6055913	6055918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19245	NC_009445	CA	3	6	6055947	6055952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19246	NC_009445	GC	3	6	6057235	6057240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19247	NC_009445	TGC	2	6	6057259	6057264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19248	NC_009445	GATT	2	8	6057320	6057327	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19249	NC_009445	CGGC	2	8	6057343	6057350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19250	NC_009445	GGC	2	6	6058621	6058626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19251	NC_009445	GCC	2	6	6058640	6058645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19252	NC_009445	GCG	2	6	6059655	6059660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19253	NC_009445	CGCCC	2	10	6059667	6059676	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19254	NC_009445	TCC	2	6	6059798	6059803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19256	NC_009445	GCCG	2	8	6059862	6059869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19257	NC_009445	CCA	2	6	6059909	6059914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19261	NC_009445	CCA	2	6	6064266	6064271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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19497	NC_009445	CG	3	6	6147609	6147614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19498	NC_009445	AGGC	2	8	6147615	6147622	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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