MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_009445	CTT	2	6	5491519	5491524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17502	NC_009445	GCGAC	2	10	5491562	5491571	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17503	NC_009445	GC	4	8	5494549	5494556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17504	NC_009445	GAG	2	6	5494595	5494600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17505	NC_009445	CGA	2	6	5494606	5494611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17506	NC_009445	CTT	2	6	5494624	5494629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17507	NC_009445	GCTTC	2	10	5494646	5494655	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17508	NC_009445	ACG	2	6	5496149	5496154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17509	NC_009445	TCCTCA	2	12	5498489	5498500	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17510	NC_009445	CAA	2	6	5498523	5498528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17511	NC_009445	CCG	2	6	5498579	5498584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17512	NC_009445	GAC	2	6	5500004	5500009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17513	NC_009445	TGG	2	6	5500010	5500015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_009445	GGC	2	6	5500016	5500021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17515	NC_009445	CGA	2	6	5500071	5500076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17516	NC_009445	TGG	2	6	5500097	5500102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_009445	GCC	2	6	5500195	5500200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17518	NC_009445	TTC	2	6	5500206	5500211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17519	NC_009445	GCG	2	6	5500231	5500236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17520	NC_009445	CTTG	2	8	5500261	5500268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17521	NC_009445	CGA	2	6	5500341	5500346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17522	NC_009445	GAGC	2	8	5500352	5500359	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17523	NC_009445	CCA	2	6	5500366	5500371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17524	NC_009445	ACA	2	6	5500487	5500492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17525	NC_009445	GC	3	6	5500506	5500511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17526	NC_009445	GATG	2	8	5501307	5501314	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17527	NC_009445	GT	3	6	5505541	5505546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_009445	GCC	2	6	5505556	5505561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17529	NC_009445	GCC	2	6	5505605	5505610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17530	NC_009445	GGTCA	2	10	5505920	5505929	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17531	NC_009445	AGC	2	6	5505948	5505953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17532	NC_009445	CG	3	6	5505997	5506002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17533	NC_009445	CG	3	6	5506024	5506029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17534	NC_009445	CGT	2	6	5506034	5506039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17535	NC_009445	GCC	2	6	5506040	5506045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17536	NC_009445	GCC	2	6	5506291	5506296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17537	NC_009445	A	6	6	5508461	5508466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17538	NC_009445	GAAT	2	8	5508666	5508673	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_009445	TTC	2	6	5508703	5508708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17540	NC_009445	CGCAC	2	10	5508724	5508733	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17541	NC_009445	CGT	2	6	5508858	5508863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17542	NC_009445	GGGA	2	8	5509608	5509615	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_009445	TCA	2	6	5509636	5509641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17544	NC_009445	TCGG	2	8	5510626	5510633	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17545	NC_009445	AGG	2	6	5510640	5510645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17546	NC_009445	AGCG	2	8	5512560	5512567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17547	NC_009445	GAC	2	6	5512578	5512583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17548	NC_009445	GCA	2	6	5513541	5513546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17549	NC_009445	AC	3	6	5513550	5513555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17550	NC_009445	GAG	2	6	5513602	5513607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17551	NC_009445	GAC	2	6	5513612	5513617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17552	NC_009445	CGT	2	6	5513671	5513676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_009445	CAT	2	6	5513808	5513813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17554	NC_009445	TC	4	8	5513830	5513837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17555	NC_009445	CGG	2	6	5513865	5513870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17556	NC_009445	CGG	2	6	5514516	5514521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17557	NC_009445	GGC	2	6	5514678	5514683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17558	NC_009445	TCAAA	2	10	5514715	5514724	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17559	NC_009445	GAT	2	6	5514731	5514736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17560	NC_009445	CCG	2	6	5518261	5518266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17561	NC_009445	ATG	2	6	5518291	5518296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17562	NC_009445	GCC	2	6	5519087	5519092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17563	NC_009445	CGG	2	6	5521827	5521832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17564	NC_009445	CCG	2	6	5521864	5521869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17565	NC_009445	ATC	2	6	5521887	5521892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17566	NC_009445	CGCC	2	8	5521940	5521947	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17567	NC_009445	GAC	2	6	5524665	5524670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17568	NC_009445	CCG	2	6	5526443	5526448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17569	NC_009445	CGA	2	6	5526465	5526470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17570	NC_009445	TTC	2	6	5526496	5526501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17571	NC_009445	CTC	2	6	5526901	5526906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17572	NC_009445	GCT	2	6	5526976	5526981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17573	NC_009445	GTCG	2	8	5527808	5527815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17574	NC_009445	TTCCC	2	10	5529123	5529132	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
17575	NC_009445	CGG	2	6	5529161	5529166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17576	NC_009445	ATC	2	6	5529211	5529216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17577	NC_009445	CTG	2	6	5529261	5529266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17578	NC_009445	CT	3	6	5530292	5530297	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17579	NC_009445	TCC	2	6	5530370	5530375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17580	NC_009445	AG	3	6	5530390	5530395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17581	NC_009445	ACC	2	6	5530425	5530430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17582	NC_009445	GA	3	6	5530837	5530842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17583	NC_009445	GCG	2	6	5530848	5530853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17584	NC_009445	GCG	3	9	5530919	5530927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17585	NC_009445	GCC	2	6	5530943	5530948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17586	NC_009445	CG	3	6	5530954	5530959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17588	NC_009445	GTT	2	6	5531018	5531023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17589	NC_009445	GGC	2	6	5531036	5531041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17590	NC_009445	GCG	2	6	5531112	5531117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17591	NC_009445	CGA	2	6	5531215	5531220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_009445	GC	3	6	5531255	5531260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17593	NC_009445	CG	3	6	5531264	5531269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17594	NC_009445	AGG	2	6	5531312	5531317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17595	NC_009445	CGGCG	2	10	5532498	5532507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17596	NC_009445	CG	3	6	5532506	5532511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17597	NC_009445	ACC	2	6	5532525	5532530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17598	NC_009445	CG	4	8	5537905	5537912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17599	NC_009445	CGC	2	6	5537987	5537992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17600	NC_009445	GC	3	6	5538014	5538019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17601	NC_009445	TCGCGC	2	12	5539712	5539723	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17602	NC_009445	CCG	2	6	5539761	5539766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17603	NC_009445	CCA	2	6	5540777	5540782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17604	NC_009445	GTG	2	6	5540791	5540796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17605	NC_009445	CGGA	2	8	5540849	5540856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17606	NC_009445	GCG	2	6	5540943	5540948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17607	NC_009445	TC	4	8	5542533	5542540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17608	NC_009445	GCA	2	6	5542559	5542564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17609	NC_009445	CGGT	2	8	5542625	5542632	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17610	NC_009445	CGCT	2	8	5542649	5542656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17611	NC_009445	GATT	2	8	5542691	5542698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17612	NC_009445	G	6	6	5542739	5542744	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17613	NC_009445	CG	3	6	5543029	5543034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17614	NC_009445	CCG	2	6	5543037	5543042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17615	NC_009445	GCT	2	6	5543329	5543334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17616	NC_009445	CCG	2	6	5543335	5543340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17617	NC_009445	TGC	2	6	5543402	5543407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17618	NC_009445	GC	4	8	5543421	5543428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17619	NC_009445	CGGC	2	8	5543498	5543505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17620	NC_009445	CAT	2	6	5543531	5543536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17621	NC_009445	GGC	2	6	5543878	5543883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17622	NC_009445	GCC	2	6	5543891	5543896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17623	NC_009445	CT	3	6	5543898	5543903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17624	NC_009445	ATG	2	6	5543908	5543913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17625	NC_009445	GCC	2	6	5543937	5543942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17626	NC_009445	TCC	2	6	5544306	5544311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17627	NC_009445	ATGG	2	8	5544358	5544365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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17629	NC_009445	CG	3	6	5544619	5544624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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