MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_009445	CGA	2	6	4980725	4980730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_009445	CGA	2	6	4980743	4980748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_009445	TCC	2	6	4980810	4980815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_009445	CG	3	6	4980898	4980903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16005	NC_009445	GCA	3	9	4980908	4980916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_009445	CTT	2	6	4981760	4981765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16007	NC_009445	CGA	2	6	4981813	4981818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_009445	AGCG	2	8	4981828	4981835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16009	NC_009445	CTCC	2	8	4983123	4983130	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16010	NC_009445	TTG	2	6	4983132	4983137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_009445	GGC	2	6	4983188	4983193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_009445	AGC	2	6	4983214	4983219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_009445	GC	3	6	4983255	4983260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16014	NC_009445	A	6	6	4983324	4983329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_009445	CTG	2	6	4983330	4983335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_009445	GC	3	6	4983429	4983434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_009445	GCC	2	6	4983439	4983444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16018	NC_009445	TCG	2	6	4983507	4983512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_009445	AAC	2	6	4983532	4983537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_009445	GAA	2	6	4983544	4983549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_009445	ATC	2	6	4983574	4983579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16022	NC_009445	CAA	2	6	4983587	4983592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16023	NC_009445	CGC	2	6	4984803	4984808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16024	NC_009445	GCC	2	6	4984814	4984819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16025	NC_009445	GCG	2	6	4984841	4984846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_009445	CGA	2	6	4988390	4988395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16027	NC_009445	CAT	2	6	4997397	4997402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_009445	CCCT	2	8	4998926	4998933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16029	NC_009445	T	6	6	4998935	4998940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_009445	TTC	2	6	4999993	4999998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_009445	A	6	6	5000008	5000013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_009445	TGC	2	6	5000050	5000055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_009445	GAG	2	6	5002271	5002276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_009445	GAT	2	6	5003427	5003432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_009445	CGC	2	6	5003997	5004002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16036	NC_009445	GC	3	6	5004006	5004011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16037	NC_009445	GTT	3	9	5004962	5004970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16038	NC_009445	TC	3	6	5005746	5005751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16039	NC_009445	GTT	2	6	5007586	5007591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_009445	GGTT	2	8	5007593	5007600	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16041	NC_009445	CG	3	6	5008802	5008807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16042	NC_009445	GCCCC	2	10	5008835	5008844	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16043	NC_009445	C	6	6	5008841	5008846	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16044	NC_009445	TCC	2	6	5008869	5008874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16045	NC_009445	GTT	2	6	5008882	5008887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_009445	AT	3	6	5008929	5008934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_009445	GGA	2	6	5008980	5008985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_009445	ATG	2	6	5008996	5009001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_009445	CG	3	6	5009013	5009018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16050	NC_009445	GTC	2	6	5009031	5009036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_009445	ATG	2	6	5009039	5009044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_009445	CG	4	8	5009052	5009059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16053	NC_009445	CG	3	6	5009069	5009074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_009445	CCG	2	6	5009082	5009087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16055	NC_009445	GGC	2	6	5009132	5009137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_009445	TC	3	6	5009153	5009158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16057	NC_009445	CGAG	2	8	5009170	5009177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16058	NC_009445	GAC	2	6	5009209	5009214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_009445	GA	3	6	5009220	5009225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_009445	GCC	2	6	5009230	5009235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16061	NC_009445	CGC	2	6	5009252	5009257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16062	NC_009445	GGCACG	2	12	5009258	5009269	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_009445	TGA	2	6	5009272	5009277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_009445	GTT	2	6	5009278	5009283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_009445	GC	3	6	5010357	5010362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16066	NC_009445	CAT	2	6	5010409	5010414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_009445	TCC	2	6	5010425	5010430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16068	NC_009445	ACG	2	6	5010519	5010524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16069	NC_009445	CG	3	6	5010523	5010528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16070	NC_009445	GGTG	2	8	5010541	5010548	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_009445	ACGA	2	8	5010581	5010588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16072	NC_009445	GAT	2	6	5010654	5010659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_009445	CCGT	2	8	5010660	5010667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16074	NC_009445	GAC	2	6	5010698	5010703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_009445	ACC	2	6	5010718	5010723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16076	NC_009445	GCC	2	6	5010767	5010772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16077	NC_009445	GGC	2	6	5010802	5010807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_009445	GC	3	6	5010876	5010881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16079	NC_009445	CCG	2	6	5010929	5010934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16080	NC_009445	CGAT	2	8	5011067	5011074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16081	NC_009445	GGCA	2	8	5011097	5011104	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16082	NC_009445	GAA	2	6	5013518	5013523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_009445	CCGG	2	8	5013524	5013531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_009445	CCT	2	6	5013812	5013817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16085	NC_009445	GCG	2	6	5013931	5013936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_009445	CCTC	2	8	5015227	5015234	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16087	NC_009445	CG	3	6	5015248	5015253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16088	NC_009445	GAC	2	6	5015298	5015303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16089	NC_009445	TCAA	2	8	5015305	5015312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16090	NC_009445	ATTT	2	8	5015335	5015342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_009445	CGG	2	6	5015387	5015392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16092	NC_009445	GCC	2	6	5015431	5015436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16093	NC_009445	ACGGC	2	10	5015457	5015466	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16094	NC_009445	TGT	2	6	5016908	5016913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_009445	GAG	2	6	5018840	5018845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_009445	CAG	2	6	5018849	5018854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16097	NC_009445	GCGG	2	8	5018905	5018912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16098	NC_009445	ATA	2	6	5018966	5018971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16099	NC_009445	ATTTA	2	10	5018982	5018991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16100	NC_009445	GCC	2	6	5019007	5019012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_009445	GACCG	2	10	5019036	5019045	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16102	NC_009445	CAT	2	6	5021382	5021387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_009445	CGCTGG	2	12	5021437	5021448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_009445	ACG	2	6	5024830	5024835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_009445	GCC	2	6	5024841	5024846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16106	NC_009445	AT	3	6	5030883	5030888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_009445	TA	3	6	5030906	5030911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_009445	ATGG	2	8	5030921	5030928	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_009445	GCC	2	6	5032503	5032508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16110	NC_009445	ATCC	2	8	5032559	5032566	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16111	NC_009445	GCA	2	6	5032612	5032617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16112	NC_009445	CAG	2	6	5032618	5032623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_009445	CGC	2	6	5032630	5032635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_009445	GA	3	6	5032645	5032650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_009445	GC	3	6	5035221	5035226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16116	NC_009445	TTTC	2	8	5035775	5035782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16117	NC_009445	CGG	2	6	5035800	5035805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_009445	GCC	2	6	5035815	5035820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_009445	GGGC	2	8	5035831	5035838	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16120	NC_009445	TCG	2	6	5035849	5035854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_009445	TCG	2	6	5037166	5037171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16122	NC_009445	CGC	2	6	5038242	5038247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16123	NC_009445	GCA	2	6	5038276	5038281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_009445	CCGC	2	8	5038315	5038322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16125	NC_009445	CGG	2	6	5038395	5038400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16126	NC_009445	GGC	2	6	5038411	5038416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_009445	CCG	2	6	5038433	5038438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16129	NC_009445	GAA	2	6	5038530	5038535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16374	NC_009445	GA	3	6	5072842	5072847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16375	NC_009445	GC	4	8	5072854	5072861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16377	NC_009445	A	7	7	5072974	5072980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16380	NC_009445	TGGG	2	8	5073066	5073073	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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16500	NC_009445	CGAT	2	8	5126141	5126148	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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