MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009445	CGGGC	2	10	4279734	4279743	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14002	NC_009445	CCG	2	6	4280365	4280370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_009445	CGG	2	6	4280420	4280425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_009445	CGC	2	6	4280451	4280456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14005	NC_009445	GC	4	8	4280455	4280462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14006	NC_009445	GCC	2	6	4281727	4281732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_009445	GGC	2	6	4281737	4281742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_009445	CTG	3	9	4281848	4281856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_009445	CCG	2	6	4281927	4281932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14010	NC_009445	TC	3	6	4282957	4282962	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14011	NC_009445	GCG	2	6	4283059	4283064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_009445	TGC	2	6	4285564	4285569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_009445	CG	3	6	4285611	4285616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14014	NC_009445	CTCG	2	8	4287810	4287817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_009445	TGC	2	6	4287874	4287879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_009445	CCG	2	6	4287962	4287967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14017	NC_009445	GCT	2	6	4288145	4288150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_009445	GCG	2	6	4288154	4288159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_009445	CCAA	2	8	4288286	4288293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14020	NC_009445	CGC	2	6	4288358	4288363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_009445	CTC	2	6	4288376	4288381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14022	NC_009445	TCGA	2	8	4288386	4288393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_009445	GGC	2	6	4288429	4288434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14024	NC_009445	GGAC	2	8	4288438	4288445	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14025	NC_009445	AAC	2	6	4288449	4288454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_009445	CCA	2	6	4288515	4288520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14027	NC_009445	GAA	2	6	4288548	4288553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_009445	GGC	2	6	4288557	4288562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_009445	GGA	2	6	4288581	4288586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009445	ATC	2	6	4289168	4289173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_009445	GCT	2	6	4289179	4289184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_009445	CTG	2	6	4289283	4289288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_009445	GTC	2	6	4289321	4289326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_009445	GGTG	2	8	4289348	4289355	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_009445	CAT	2	6	4289377	4289382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_009445	TGA	3	9	4289456	4289464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_009445	GCC	2	6	4289517	4289522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_009445	CG	3	6	4289530	4289535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14039	NC_009445	GCC	2	6	4289574	4289579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14040	NC_009445	T	7	7	4289584	4289590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_009445	GGC	2	6	4289609	4289614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_009445	GCGA	2	8	4289725	4289732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14043	NC_009445	CGG	2	6	4289764	4289769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_009445	GCTTC	2	10	4289804	4289813	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14045	NC_009445	GAC	3	9	4289927	4289935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14046	NC_009445	CAT	2	6	4292059	4292064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14047	NC_009445	GC	3	6	4292076	4292081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14048	NC_009445	CGC	2	6	4292170	4292175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14049	NC_009445	TCC	2	6	4292508	4292513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14050	NC_009445	CAA	2	6	4292547	4292552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_009445	GAG	2	6	4292600	4292605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009445	CGA	2	6	4292612	4292617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14053	NC_009445	GCTTC	2	10	4292650	4292659	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14054	NC_009445	GCA	2	6	4292685	4292690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14055	NC_009445	CG	3	6	4294347	4294352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14056	NC_009445	AG	3	6	4294433	4294438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009445	CG	3	6	4295010	4295015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14058	NC_009445	TAT	2	6	4295072	4295077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009445	GGC	2	6	4297089	4297094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14060	NC_009445	CAGA	2	8	4297178	4297185	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14061	NC_009445	GC	3	6	4300148	4300153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14062	NC_009445	CAC	2	6	4301482	4301487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14063	NC_009445	GGGA	2	8	4301561	4301568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_009445	CAT	2	6	4304337	4304342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_009445	GCA	2	6	4304358	4304363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_009445	TCC	2	6	4304399	4304404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14067	NC_009445	CGC	2	6	4304417	4304422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14068	NC_009445	ACGG	2	8	4304454	4304461	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14069	NC_009445	CCGC	2	8	4304475	4304482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14070	NC_009445	GAC	2	6	4304508	4304513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14071	NC_009445	CCG	2	6	4304526	4304531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14072	NC_009445	CAC	2	6	4304540	4304545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_009445	TGC	2	6	4304549	4304554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_009445	TTG	2	6	4305919	4305924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_009445	ATT	2	6	4305966	4305971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_009445	CAC	2	6	4305983	4305988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14077	NC_009445	TTC	2	6	4305998	4306003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_009445	AGC	2	6	4306032	4306037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14079	NC_009445	CGG	2	6	4306055	4306060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14080	NC_009445	CCGA	2	8	4306083	4306090	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_009445	CGG	2	6	4306196	4306201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_009445	CAC	2	6	4306203	4306208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14083	NC_009445	ATA	2	6	4306278	4306283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_009445	CTC	2	6	4307454	4307459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14085	NC_009445	ATC	2	6	4308132	4308137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_009445	AGC	2	6	4308158	4308163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14087	NC_009445	CGG	2	6	4308167	4308172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_009445	CCG	2	6	4308184	4308189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_009445	ACC	2	6	4308217	4308222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14090	NC_009445	GAC	2	6	4308305	4308310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14091	NC_009445	CTC	2	6	4308473	4308478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14092	NC_009445	GCT	2	6	4308505	4308510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_009445	CAA	2	6	4308534	4308539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14094	NC_009445	A	6	6	4308538	4308543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_009445	GGC	2	6	4308547	4308552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_009445	CAC	2	6	4308556	4308561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14097	NC_009445	TTG	2	6	4308635	4308640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_009445	ATC	2	6	4308659	4308664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_009445	CCG	2	6	4308670	4308675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14100	NC_009445	CG	3	6	4308739	4308744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14101	NC_009445	CCT	2	6	4308819	4308824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14102	NC_009445	ATT	2	6	4308855	4308860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_009445	AGA	2	6	4308867	4308872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_009445	TC	3	6	4308896	4308901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14105	NC_009445	GCA	2	6	4308934	4308939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_009445	CCG	2	6	4308981	4308986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14107	NC_009445	ATC	2	6	4309012	4309017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14108	NC_009445	TC	4	8	4309016	4309023	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14109	NC_009445	CGAC	2	8	4309026	4309033	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14110	NC_009445	TCT	2	6	4309052	4309057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_009445	GGC	2	6	4309770	4309775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14112	NC_009445	CGAT	2	8	4310072	4310079	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14113	NC_009445	GC	4	8	4310091	4310098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14114	NC_009445	CGA	2	6	4310112	4310117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_009445	TCG	2	6	4310129	4310134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14117	NC_009445	CGCAG	2	10	4310157	4310166	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14118	NC_009445	GAG	2	6	4310178	4310183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_009445	GC	3	6	4311074	4311079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14120	NC_009445	GGC	2	6	4311080	4311085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14121	NC_009445	CTG	2	6	4311142	4311147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14122	NC_009445	AC	3	6	4312422	4312427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14123	NC_009445	GTTC	2	8	4312442	4312449	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_009445	CGCGGT	2	12	4313300	4313311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_009445	GCA	2	6	4313326	4313331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14126	NC_009445	GCT	2	6	4313335	4313340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_009445	ATCG	2	8	4313343	4313350	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14128	NC_009445	GCG	2	6	4313351	4313356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_009445	CGA	2	6	4313357	4313362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_009445	TGCG	2	8	4313368	4313375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14131	NC_009445	CG	3	6	4313394	4313399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14132	NC_009445	ATG	2	6	4313410	4313415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14242	NC_009445	CG	3	6	4368754	4368759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14243	NC_009445	TGT	2	6	4368782	4368787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14248	NC_009445	TC	4	8	4381853	4381860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14249	NC_009445	ACC	2	6	4381870	4381875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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14252	NC_009445	CCA	2	6	4381934	4381939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14253	NC_009445	CT	3	6	4384112	4384117	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14254	NC_009445	AGCGC	2	10	4387924	4387933	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14255	NC_009445	GCC	2	6	4387964	4387969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14256	NC_009445	TCCC	2	8	4387971	4387978	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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14258	NC_009445	CGGC	2	8	4388329	4388336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14380	NC_009445	CAGC	2	8	4417783	4417790	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14381	NC_009445	TGC	2	6	4417830	4417835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14384	NC_009445	GC	3	6	4417884	4417889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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