MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009445	GCG	3	9	3088763	3088771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_009445	GC	3	6	3088801	3088806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_009445	AGC	2	6	3088826	3088831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_009445	CGG	3	9	3088838	3088846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_009445	AG	3	6	3088871	3088876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_009445	CGG	2	6	3088900	3088905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_009445	TC	3	6	3088925	3088930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10008	NC_009445	GCG	2	6	3088952	3088957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_009445	TGCCG	2	10	3088999	3089008	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10010	NC_009445	GA	3	6	3089019	3089024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009445	TG	3	6	3090383	3090388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009445	GGCG	2	8	3090467	3090474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_009445	CTC	2	6	3090485	3090490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10014	NC_009445	GGCGC	2	10	3092181	3092190	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10015	NC_009445	GCTG	2	8	3092217	3092224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_009445	AGCGA	2	10	3093125	3093134	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10017	NC_009445	CGCTC	2	10	3093175	3093184	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10018	NC_009445	GCC	3	9	3093245	3093253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_009445	GGC	3	9	3093255	3093263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_009445	CCA	2	6	3093268	3093273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_009445	GCG	2	6	3093278	3093283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_009445	GC	3	6	3093310	3093315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10023	NC_009445	CAC	2	6	3093323	3093328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_009445	AC	3	6	3093364	3093369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10025	NC_009445	AGCGA	2	10	3093391	3093400	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10026	NC_009445	TGC	2	6	3093516	3093521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_009445	GAG	2	6	3095234	3095239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_009445	GAG	2	6	3095275	3095280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_009445	CTC	2	6	3095321	3095326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10030	NC_009445	TCC	2	6	3095666	3095671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_009445	GAAC	2	8	3095845	3095852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_009445	GCT	2	6	3095886	3095891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_009445	GCA	2	6	3095895	3095900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_009445	CG	3	6	3096375	3096380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_009445	TCG	2	6	3097173	3097178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_009445	GGC	3	9	3097185	3097193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_009445	CG	3	6	3097197	3097202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10038	NC_009445	TG	3	6	3097203	3097208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_009445	GACG	2	8	3097234	3097241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10040	NC_009445	CGA	2	6	3097248	3097253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10041	NC_009445	TCG	2	6	3097314	3097319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_009445	CG	3	6	3097358	3097363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10043	NC_009445	CCG	2	6	3097380	3097385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10044	NC_009445	TCGA	2	8	3097395	3097402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10045	NC_009445	GCG	2	6	3100650	3100655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_009445	AGCGA	2	10	3101946	3101955	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10047	NC_009445	ATC	2	6	3102038	3102043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_009445	AGCGA	2	10	3102638	3102647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10049	NC_009445	CGG	2	6	3104316	3104321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_009445	GCGG	2	8	3104379	3104386	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10051	NC_009445	GGA	2	6	3104455	3104460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009445	GAC	2	6	3105361	3105366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_009445	TGCT	2	8	3106366	3106373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10054	NC_009445	CAC	2	6	3106434	3106439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_009445	CGAAG	2	10	3106483	3106492	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10056	NC_009445	TC	4	8	3106505	3106512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_009445	GA	3	6	3106529	3106534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009445	TCG	2	6	3106562	3106567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10059	NC_009445	GT	3	6	3108066	3108071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009445	GGGCC	2	10	3108116	3108125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10061	NC_009445	G	6	6	3108158	3108163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009445	GAG	2	6	3108275	3108280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009445	ACGG	2	8	3109044	3109051	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_009445	CGT	2	6	3109585	3109590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_009445	GCGA	2	8	3109595	3109602	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10066	NC_009445	CGG	2	6	3109634	3109639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10067	NC_009445	TCG	2	6	3109676	3109681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_009445	CTC	2	6	3109687	3109692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10069	NC_009445	AGAA	2	8	3111517	3111524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_009445	CAT	2	6	3112319	3112324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_009445	TCG	2	6	3112375	3112380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_009445	CTC	2	6	3112422	3112427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10073	NC_009445	ATG	2	6	3112431	3112436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_009445	GCG	2	6	3112437	3112442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_009445	TGA	2	6	3112447	3112452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_009445	CTCC	2	8	3112460	3112467	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10077	NC_009445	GCA	2	6	3112502	3112507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_009445	GAGCG	2	10	3114160	3114169	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10079	NC_009445	AC	3	6	3114186	3114191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_009445	CGC	2	6	3114277	3114282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10081	NC_009445	GTC	2	6	3114295	3114300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_009445	CGT	2	6	3114353	3114358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_009445	GAC	2	6	3114407	3114412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10084	NC_009445	CGTG	2	8	3114425	3114432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10085	NC_009445	TTG	2	6	3115353	3115358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_009445	GTT	2	6	3115364	3115369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_009445	ACG	2	6	3115410	3115415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10088	NC_009445	CGG	2	6	3115455	3115460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_009445	GC	3	6	3115468	3115473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10090	NC_009445	GGC	2	6	3115474	3115479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_009445	CAG	2	6	3115527	3115532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_009445	GC	3	6	3115535	3115540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_009445	GC	3	6	3115557	3115562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10094	NC_009445	TCC	2	6	3117112	3117117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10095	NC_009445	GGC	2	6	3117166	3117171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_009445	AGG	2	6	3118372	3118377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_009445	CGCC	2	8	3118428	3118435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10098	NC_009445	CTC	2	6	3118446	3118451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10099	NC_009445	AGGATG	2	12	3118452	3118463	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_009445	GAG	2	6	3118513	3118518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_009445	GCT	2	6	3118552	3118557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_009445	AAC	2	6	3118560	3118565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_009445	ACG	2	6	3120108	3120113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_009445	CGGC	2	8	3120129	3120136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10105	NC_009445	GCG	2	6	3120166	3120171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_009445	CAGCG	2	10	3120196	3120205	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10107	NC_009445	TCG	2	6	3120216	3120221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_009445	CGC	3	9	3120253	3120261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10109	NC_009445	CG	3	6	3120267	3120272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_009445	GAG	2	6	3121973	3121978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009445	CGA	2	6	3121984	3121989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_009445	TCGCT	2	10	3122028	3122037	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10113	NC_009445	GA	3	6	3123906	3123911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009445	CG	3	6	3123936	3123941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_009445	GAGT	2	8	3123951	3123958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_009445	GCG	2	6	3124094	3124099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_009445	CAT	2	6	3124132	3124137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_009445	GC	3	6	3124138	3124143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10119	NC_009445	GC	3	6	3124166	3124171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10120	NC_009445	TGC	3	9	3124195	3124203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_009445	GCA	3	9	3124204	3124212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_009445	AGCGA	2	10	3124230	3124239	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10123	NC_009445	GCG	3	9	3124256	3124264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_009445	CCCG	2	8	3124305	3124312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10125	NC_009445	CCA	2	6	3124355	3124360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_009445	GCTGC	2	10	3124372	3124381	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10127	NC_009445	TGG	2	6	3124386	3124391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_009445	GCC	2	6	3124398	3124403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10129	NC_009445	GCG	2	6	3124405	3124410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_009445	GCT	2	6	3124411	3124416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_009445	CT	3	6	3125584	3125589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_009445	GAC	2	6	3125619	3125624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10134	NC_009445	GCG	2	6	3125676	3125681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10136	NC_009445	GCG	2	6	3127486	3127491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10143	NC_009445	CCG	2	6	3127657	3127662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10153	NC_009445	CGA	2	6	3129690	3129695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10161	NC_009445	CTG	2	6	3129928	3129933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10163	NC_009445	AG	3	6	3130038	3130043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10164	NC_009445	CCT	2	6	3130071	3130076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10241	NC_009445	GCC	2	6	3154836	3154841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10249	NC_009445	CCG	2	6	3155556	3155561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10250	NC_009445	A	7	7	3155596	3155602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_009445	CG	4	8	3155633	3155640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10252	NC_009445	TGT	2	6	3155697	3155702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_009445	TTG	2	6	3156372	3156377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_009445	CAAA	2	8	3156448	3156455	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10255	NC_009445	TTG	2	6	3156472	3156477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_009445	AGC	2	6	3157330	3157335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10258	NC_009445	GA	3	6	3157496	3157501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_009445	TGG	2	6	3157502	3157507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10260	NC_009445	GTG	2	6	3157534	3157539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_009445	CGT	2	6	3158162	3158167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10262	NC_009445	TTG	2	6	3158210	3158215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10380	NC_009445	TCCCG	2	10	3179931	3179940	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10381	NC_009445	CGC	2	6	3179982	3179987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10382	NC_009445	TTCA	2	8	3179998	3180005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10383	NC_009445	TCGTG	2	10	3180085	3180094	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10384	NC_009445	CG	3	6	3180187	3180192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10385	NC_009445	GC	3	6	3182887	3182892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10387	NC_009445	GC	3	6	3183253	3183258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10388	NC_009445	CGC	2	6	3183276	3183281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10500	NC_009445	CAT	2	6	3205191	3205196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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