MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. ORS 278 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009445	CCA	2	6	144496	144501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_009445	GC	3	6	144544	144549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_009445	CCCA	2	8	144555	144562	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
504	NC_009445	CGC	2	6	145409	145414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_009445	GCC	2	6	145434	145439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_009445	ATGA	2	8	145476	145483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009445	CGCC	2	8	145489	145496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
508	NC_009445	CGC	2	6	145587	145592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_009445	CGC	2	6	145643	145648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_009445	GC	4	8	145678	145685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
511	NC_009445	GGT	2	6	145687	145692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009445	GCC	2	6	145714	145719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_009445	TCG	2	6	145726	145731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009445	GGC	2	6	146468	146473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009445	TCGGC	2	10	146483	146492	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
516	NC_009445	TCA	2	6	146521	146526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_009445	GC	3	6	146534	146539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
518	NC_009445	CGC	3	9	146537	146545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_009445	GCC	2	6	147566	147571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
520	NC_009445	TG	3	6	148382	148387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009445	ACC	2	6	148473	148478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_009445	CGG	2	6	148484	148489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009445	CCGG	2	8	148508	148515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_009445	GAC	2	6	148531	148536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009445	TGC	2	6	148552	148557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009445	CGG	2	6	148577	148582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009445	CG	3	6	148611	148616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_009445	TCG	2	6	149785	149790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009445	CAAC	2	8	149864	149871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
530	NC_009445	GGC	2	6	149912	149917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_009445	CG	4	8	150171	150178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_009445	TCA	2	6	150189	150194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009445	CGTCGC	2	12	150667	150678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
534	NC_009445	GCC	2	6	150691	150696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_009445	CCGG	2	8	155425	155432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_009445	AGC	2	6	156405	156410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009445	GGC	2	6	156418	156423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009445	TC	3	6	156437	156442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_009445	TCG	2	6	156450	156455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009445	TGG	2	6	156462	156467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009445	GCCC	2	8	156518	156525	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
542	NC_009445	ACC	2	6	156531	156536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_009445	CAT	2	6	158090	158095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_009445	TA	3	6	159408	159413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009445	CG	3	6	159517	159522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
546	NC_009445	GGC	2	6	159551	159556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009445	GCG	2	6	159616	159621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_009445	GGC	2	6	162138	162143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_009445	TCC	2	6	162154	162159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_009445	GAG	2	6	162168	162173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009445	CGA	2	6	162179	162184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009445	GTGGG	2	10	162266	162275	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009445	AG	3	6	162331	162336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009445	GGC	2	6	165158	165163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009445	ATC	2	6	166272	166277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_009445	GCGG	2	8	166326	166333	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
557	NC_009445	CGC	2	6	166470	166475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_009445	CAC	2	6	166492	166497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_009445	CCA	2	6	168009	168014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_009445	CACC	2	8	168015	168022	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
561	NC_009445	GAG	2	6	168103	168108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009445	CGCC	2	8	168163	168170	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
563	NC_009445	CTC	2	6	168180	168185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_009445	GAG	2	6	168191	168196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009445	CCTT	2	8	168230	168237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_009445	GAG	2	6	168250	168255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009445	CGC	2	6	168256	168261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_009445	CGC	2	6	168299	168304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_009445	CCGC	2	8	168309	168316	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
570	NC_009445	C	6	6	168328	168333	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
571	NC_009445	GCC	2	6	168364	168369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_009445	GGC	2	6	169348	169353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009445	AATG	2	8	169767	169774	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009445	AAG	2	6	169990	169995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009445	T	6	6	170005	170010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_009445	CG	3	6	170581	170586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
579	NC_009445	GGT	2	6	170587	170592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_009445	GAA	2	6	170708	170713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009445	GCG	2	6	170731	170736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009445	CGG	2	6	170746	170751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_009445	ACGTTG	2	12	170801	170812	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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586	NC_009445	GCCGG	2	10	172350	172359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
587	NC_009445	GGCGG	2	10	174735	174744	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
588	NC_009445	T	6	6	174810	174815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009445	GCA	2	6	174827	174832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_009445	GCA	2	6	174838	174843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009445	ACG	2	6	174849	174854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_009445	CCCG	2	8	176023	176030	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
593	NC_009445	CG	3	6	176054	176059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
594	NC_009445	CG	3	6	176065	176070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
595	NC_009445	CTT	2	6	178065	178070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009445	TGGG	2	8	178083	178090	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009445	CGA	2	6	178145	178150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_009445	AGG	2	6	178163	178168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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600	NC_009445	CG	3	6	178205	178210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_009445	A	6	6	178212	178217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009445	ACG	2	6	178254	178259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009445	GC	3	6	178281	178286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
604	NC_009445	CCG	2	6	178310	178315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_009445	AGC	2	6	178341	178346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_009445	GCCG	2	8	178442	178449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
607	NC_009445	CTT	2	6	178584	178589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_009445	GCA	2	6	180372	180377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_009445	CCG	2	6	180385	180390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_009445	CGGTCG	2	12	180437	180448	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009445	AGC	2	6	180472	180477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009445	CGC	2	6	180487	180492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_009445	TTG	2	6	183721	183726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009445	TCCA	2	8	183795	183802	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_009445	GGAT	2	8	183826	183833	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009445	GAC	2	6	183869	183874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_009445	CGG	2	6	184600	184605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_009445	CGGG	2	8	184619	184626	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
619	NC_009445	CGG	2	6	184675	184680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_009445	TCC	2	6	185805	185810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
621	NC_009445	GCG	2	6	185838	185843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009445	GCGG	2	8	185865	185872	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
623	NC_009445	GA	3	6	185977	185982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009445	TCA	2	6	188504	188509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_009445	TGA	2	6	188541	188546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_009445	GAG	2	6	188608	188613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_009445	CCT	2	6	188621	188626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_009445	CTC	2	6	188722	188727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_009445	GAG	2	6	188733	188738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_009445	CAG	2	6	188739	188744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_009445	CCG	2	6	188773	188778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_009445	CGA	2	6	190092	190097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009445	CAAAA	2	10	190107	190116	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
636	NC_009445	GTG	2	6	190183	190188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_009445	CCA	2	6	190361	190366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_009445	GCTTC	2	10	192758	192767	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
639	NC_009445	GGA	2	6	192780	192785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009445	TGCATT	2	12	192797	192808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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642	NC_009445	GAG	2	6	192867	192872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_009445	CTC	2	6	192945	192950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
645	NC_009445	CGG	2	6	192968	192973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
646	NC_009445	CGG	2	6	193039	193044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_009445	CGC	2	6	193048	193053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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651	NC_009445	GTT	2	6	195461	195466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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662	NC_009445	CCG	2	6	200645	200650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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683	NC_009445	GAC	2	6	211628	211633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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761	NC_009445	CGT	2	6	244279	244284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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767	NC_009445	CG	3	6	244472	244477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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923	NC_009445	GCC	2	6	270837	270842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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937	NC_009445	TCG	2	6	278097	278102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
938	NC_009445	CCG	2	6	278377	278382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
939	NC_009445	CCG	2	6	278384	278389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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950	NC_009445	CGC	2	6	281598	281603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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988	NC_009445	CCA	2	6	292782	292787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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