MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis str. Al Hakam chromosome

Total Repeats: 24945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008600	TCA	3	9	1108533	1108541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_008600	GTG	2	6	1108572	1108577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008600	TGA	2	6	1108591	1108596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008600	AAG	2	6	1108602	1108607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008600	CTCCTT	2	12	1108645	1108656	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_008600	TAAA	2	8	1108684	1108691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008600	ATG	2	6	1108743	1108748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008600	CTTA	2	8	1108758	1108765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5509	NC_008600	ATC	2	6	1108788	1108793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_008600	AT	3	6	1108838	1108843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_008600	GAA	2	6	1108931	1108936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008600	A	6	6	1108954	1108959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_008600	A	7	7	1108969	1108975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_008600	GGA	2	6	1108980	1108985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008600	CAA	2	6	1108986	1108991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_008600	TGAAA	2	10	1109004	1109013	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_008600	ACG	2	6	1109023	1109028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_008600	T	6	6	1109038	1109043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_008600	GCC	2	6	1109054	1109059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_008600	AGA	2	6	1109081	1109086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_008600	A	6	6	1109086	1109091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_008600	TTG	2	6	1109098	1109103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008600	GAT	2	6	1109182	1109187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_008600	ATA	2	6	1109240	1109245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008600	GGGA	2	8	1109260	1109267	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_008600	GAG	2	6	1109284	1109289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_008600	TAAAA	2	10	1109291	1109300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_008600	A	7	7	1109297	1109303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_008600	AAG	3	9	1110545	1110553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_008600	CAA	2	6	1110556	1110561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_008600	GTT	2	6	1110567	1110572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_008600	TTC	2	6	1110580	1110585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_008600	ATCC	2	8	1111329	1111336	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_008600	ATTT	2	8	1111347	1111354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008600	T	9	9	1111352	1111360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008600	TATTT	2	10	1111375	1111384	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008600	TAA	3	9	1111403	1111411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008600	TTG	2	6	1111452	1111457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_008600	GTTTG	2	10	1111463	1111472	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008600	TAT	2	6	1111495	1111500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008600	TG	3	6	1111534	1111539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_008600	AGG	2	6	1111561	1111566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008600	G	6	6	1111577	1111582	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008600	ATT	2	6	1111593	1111598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008600	TTG	2	6	1111662	1111667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_008600	TA	3	6	1111713	1111718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008600	T	6	6	1111734	1111739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_008600	TAG	2	6	1111759	1111764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_008600	CTT	2	6	1111769	1111774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_008600	G	6	6	1111837	1111842	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_008600	TTC	2	6	1111844	1111849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_008600	ATT	2	6	1111861	1111866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_008600	TTC	2	6	1112000	1112005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_008600	AT	3	6	1112012	1112017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_008600	GGA	2	6	1112020	1112025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_008600	TAC	2	6	1112583	1112588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5557	NC_008600	CTA	2	6	1112589	1112594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_008600	AAG	2	6	1112597	1112602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008600	ACA	2	6	1112611	1112616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_008600	AGT	2	6	1112624	1112629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008600	TAA	2	6	1113604	1113609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008600	CCT	2	6	1113615	1113620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5563	NC_008600	TCCC	2	8	1113647	1113654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5564	NC_008600	TAATAT	2	12	1113678	1113689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008600	AAC	2	6	1113701	1113706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_008600	T	6	6	1114813	1114818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008600	ACT	3	9	1114829	1114837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_008600	TCA	2	6	1114852	1114857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_008600	TGC	2	6	1114879	1114884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_008600	TCA	2	6	1114885	1114890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_008600	TTTC	2	8	1114892	1114899	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5572	NC_008600	TCG	2	6	1114919	1114924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_008600	GATC	2	8	1114952	1114959	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_008600	TCCATT	2	12	1114971	1114982	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_008600	A	6	6	1115006	1115011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_008600	CAA	2	6	1115019	1115024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_008600	GGAT	2	8	1115130	1115137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_008600	CTTT	2	8	1116907	1116914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5579	NC_008600	AT	3	6	1116948	1116953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008600	A	6	6	1116956	1116961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008600	AT	3	6	1116968	1116973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_008600	AT	3	6	1116989	1116994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_008600	AT	3	6	1117009	1117014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_008600	AT	3	6	1117029	1117034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008600	TA	3	6	1117058	1117063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_008600	TAAT	2	8	1117668	1117675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008600	T	6	6	1119294	1119299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008600	AT	3	6	1119323	1119328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008600	TAA	2	6	1119346	1119351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008600	GGA	2	6	1119352	1119357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008600	ATGAA	2	10	1119423	1119432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_008600	GAA	2	6	1119445	1119450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_008600	GCA	2	6	1119466	1119471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5595	NC_008600	ATC	2	6	1119480	1119485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5597	NC_008600	GGAAA	2	10	1119544	1119553	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_008600	ATT	2	6	1119567	1119572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_008600	TAA	2	6	1119580	1119585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_008600	ATA	2	6	1119613	1119618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_008600	TTA	2	6	1119619	1119624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008600	TA	3	6	1119679	1119684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_008600	TG	3	6	1120776	1120781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_008600	T	6	6	1120783	1120788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_008600	GAGGTA	2	12	1120807	1120818	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5608	NC_008600	ATA	2	6	1120902	1120907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_008600	TTA	2	6	1120932	1120937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008600	ACG	2	6	1120953	1120958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_008600	TGT	2	6	1120963	1120968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008600	ATG	2	6	1120977	1120982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008600	AAG	2	6	1120983	1120988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008600	AGA	2	6	1120992	1120997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_008600	TTC	2	6	1121691	1121696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_008600	CAA	2	6	1121712	1121717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_008600	GC	3	6	1121721	1121726	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5618	NC_008600	GTG	2	6	1121779	1121784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008600	TGA	2	6	1122093	1122098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_008600	TAC	2	6	1122100	1122105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_008600	ATT	2	6	1122118	1122123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008600	AGA	3	9	1122124	1122132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_008600	GA	3	6	1122179	1122184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_008600	TAA	2	6	1122199	1122204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_008600	CT	3	6	1122215	1122220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5626	NC_008600	GAT	2	6	1122235	1122240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008600	AGATA	2	10	1122822	1122831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_008600	T	6	6	1122868	1122873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5629	NC_008600	ATA	2	6	1122940	1122945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_008600	TA	3	6	1122952	1122957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5631	NC_008600	GCAT	2	8	1122983	1122990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5633	NC_008600	AAG	2	6	1123069	1123074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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