MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 11078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008542	AAT	2	6	1235636	1235641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008542	GGT	2	6	1237367	1237372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008542	ACCG	2	8	1237379	1237386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_008542	CGGC	2	8	1237394	1237401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_008542	ACG	2	6	1238071	1238076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008542	ACG	2	6	1238114	1238119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_008542	CGGG	2	8	1241620	1241627	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4008	NC_008542	CCG	2	6	1241632	1241637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_008542	GGGC	2	8	1241646	1241653	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_008542	CCCG	2	8	1241663	1241670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4011	NC_008542	T	6	6	1241700	1241705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_008542	GTC	2	6	1241734	1241739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_008542	GC	3	6	1241742	1241747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4014	NC_008542	GCCGC	2	10	1244510	1244519	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4015	NC_008542	ACT	2	6	1244530	1244535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008542	GCCGT	2	10	1244582	1244591	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4017	NC_008542	CG	3	6	1245877	1245882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_008542	CG	3	6	1245884	1245889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_008542	GCC	2	6	1248424	1248429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_008542	CGG	2	6	1248482	1248487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_008542	T	6	6	1250058	1250063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_008542	GTC	2	6	1250091	1250096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008542	GCC	2	6	1250155	1250160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_008542	CGAGT	2	10	1251559	1251568	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4025	NC_008542	AG	3	6	1251571	1251576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008542	GCCGCA	2	12	1251596	1251607	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_008542	CCG	2	6	1251635	1251640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_008542	ATT	2	6	1251655	1251660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008542	GAT	2	6	1251686	1251691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008542	ACAA	2	8	1251764	1251771	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_008542	A	6	6	1252376	1252381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008542	ATCAA	2	10	1252390	1252399	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4033	NC_008542	GCG	2	6	1252442	1252447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_008542	CGGC	2	8	1255840	1255847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_008542	GCG	3	9	1256518	1256526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_008542	AC	3	6	1256558	1256563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_008542	ACG	2	6	1256600	1256605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_008542	AAGT	2	8	1256606	1256613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008542	GT	3	6	1256612	1256617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_008542	GAAGCG	2	12	1256624	1256635	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4041	NC_008542	GTAGC	2	10	1256636	1256645	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4042	NC_008542	T	6	6	1256729	1256734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_008542	CGG	2	6	1257171	1257176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008542	CTTTT	2	10	1257179	1257188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4045	NC_008542	T	6	6	1257185	1257190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_008542	CGT	2	6	1257237	1257242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008542	AAG	2	6	1257255	1257260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008542	GC	3	6	1257264	1257269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_008542	CGA	2	6	1257299	1257304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008542	CTA	2	6	1257357	1257362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_008542	CG	3	6	1257422	1257427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4052	NC_008542	ATC	2	6	1257450	1257455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008542	TAA	2	6	1257561	1257566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008542	GAG	2	6	1257572	1257577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008542	GGGCC	2	10	1257666	1257675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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4057	NC_008542	GCG	2	6	1257732	1257737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008542	AAC	2	6	1257824	1257829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008542	CAT	2	6	1257861	1257866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4061	NC_008542	GT	3	6	1257975	1257980	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008542	GC	3	6	1258022	1258027	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_008542	AC	3	6	1258059	1258064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_008542	TGC	2	6	1258067	1258072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_008542	TGC	2	6	1259050	1259055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_008542	GACG	2	8	1259119	1259126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_008542	TTCC	2	8	1259693	1259700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_008542	GCG	2	6	1259726	1259731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_008542	CG	3	6	1259730	1259735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4070	NC_008542	GATT	2	8	1260363	1260370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_008542	CGG	2	6	1260418	1260423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_008542	GTC	2	6	1260450	1260455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4076	NC_008542	GCG	3	9	1261568	1261576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_008542	GCG	2	6	1261622	1261627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008542	GCG	2	6	1261654	1261659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_008542	CGTG	2	8	1262236	1262243	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4082	NC_008542	GTCA	2	8	1263258	1263265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4085	NC_008542	T	7	7	1264226	1264232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_008542	CG	3	6	1264250	1264255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_008542	CGG	2	6	1264279	1264284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4091	NC_008542	CCGG	2	8	1264295	1264302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4092	NC_008542	GC	3	6	1264818	1264823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4093	NC_008542	CGCGC	3	15	1264819	1264833	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4094	NC_008542	CG	4	8	1265709	1265716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_008542	TGGA	2	8	1266828	1266835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008542	CG	3	6	1266860	1266865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4097	NC_008542	CG	3	6	1266893	1266898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4098	NC_008542	CGG	2	6	1266959	1266964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4101	NC_008542	GCCG	2	8	1267062	1267069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4102	NC_008542	TGC	2	6	1269241	1269246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_008542	CGT	2	6	1271304	1271309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008542	AAAGT	2	10	1271430	1271439	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_008542	T	6	6	1271505	1271510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_008542	GTCGC	2	10	1271555	1271564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4113	NC_008542	GAC	2	6	1271625	1271630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4115	NC_008542	T	6	6	1271676	1271681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_008542	T	6	6	1271687	1271692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008542	GCC	3	9	1272775	1272783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4119	NC_008542	GC	3	6	1272792	1272797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_008542	ACG	2	6	1272805	1272810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4128	NC_008542	CGGT	2	8	1274322	1274329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_008542	TCG	2	6	1274377	1274382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_008542	CG	3	6	1274381	1274386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_008542	CCGG	2	8	1274391	1274398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_008542	CGGC	2	8	1274441	1274448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4133	NC_008542	CATTC	2	10	1274476	1274485	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4134	NC_008542	GCC	2	6	1274501	1274506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4135	NC_008542	GTCC	2	8	1274509	1274516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4136	NC_008542	GCG	2	6	1275877	1275882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_008542	CG	4	8	1275924	1275931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4138	NC_008542	GCGCG	2	10	1275963	1275972	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4139	NC_008542	CGG	2	6	1276024	1276029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4140	NC_008542	GAACGC	2	12	1276036	1276047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_008542	CACG	2	8	1276059	1276066	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4142	NC_008542	ATC	2	6	1276120	1276125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4143	NC_008542	GTC	2	6	1276127	1276132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4144	NC_008542	ATC	2	6	1276159	1276164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4145	NC_008542	GTC	2	6	1277038	1277043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_008542	GCC	2	6	1277101	1277106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4148	NC_008542	CG	3	6	1278510	1278515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4149	NC_008542	GCGG	2	8	1278519	1278526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4150	NC_008542	AGA	2	6	1278568	1278573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_008542	CGCGG	2	10	1278593	1278602	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4152	NC_008542	GCCGC	2	10	1278615	1278624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4153	NC_008542	GC	3	6	1280835	1280840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4154	NC_008542	GCC	2	6	1280874	1280879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4155	NC_008542	TCAT	2	8	1280903	1280910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4156	NC_008542	GCG	2	6	1280957	1280962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_008542	GC	3	6	1282013	1282018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4163	NC_008542	CGT	2	6	1282019	1282024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4165	NC_008542	GGC	2	6	1283181	1283186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4171	NC_008542	TTGC	2	8	1284333	1284340	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4172	NC_008542	ATTA	2	8	1284373	1284380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4185	NC_008542	ACGGG	2	10	1289543	1289552	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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4196	NC_008542	CAAT	2	8	1290462	1290469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4197	NC_008542	CATT	2	8	1290522	1290529	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4224	NC_008542	GTTCG	2	10	1306194	1306203	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4233	NC_008542	GC	3	6	1308855	1308860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4234	NC_008542	CATC	2	8	1309524	1309531	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4249	NC_008542	TTCA	2	8	1313045	1313052	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4251	NC_008542	G	6	6	1313087	1313092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_008542	ACGG	2	8	1314380	1314387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4253	NC_008542	CCAC	2	8	1314429	1314436	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4254	NC_008542	ACA	2	6	1314448	1314453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NC_008542	C	6	6	1314454	1314459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4256	NC_008542	CTGG	2	8	1314499	1314506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4257	NC_008542	CG	3	6	1321013	1321018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4258	NC_008542	CGGCG	2	10	1322411	1322420	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4259	NC_008542	CTG	2	6	1322436	1322441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4260	NC_008542	GACGG	2	10	1322464	1322473	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4261	NC_008542	GGC	2	6	1322474	1322479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4262	NC_008542	CCG	2	6	1322498	1322503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4263	NC_008542	GCG	2	6	1322537	1322542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4264	NC_008542	CGA	2	6	1322543	1322548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4266	NC_008542	TTG	2	6	1323509	1323514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_008542	TTA	2	6	1323597	1323602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4268	NC_008542	CGGAAA	2	12	1323671	1323682	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4270	NC_008542	TGA	2	6	1324020	1324025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4274	NC_008542	CGTC	2	8	1326198	1326205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4275	NC_008542	A	6	6	1327455	1327460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4280	NC_008542	ATG	2	6	1328684	1328689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4282	NC_008542	CGG	2	6	1329203	1329208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4285	NC_008542	T	7	7	1329271	1329277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4383	NC_008542	GTT	2	6	1361384	1361389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4388	NC_008542	CG	4	8	1366446	1366453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4389	NC_008542	CGAGG	2	10	1367124	1367133	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4390	NC_008542	GCCG	2	8	1367141	1367148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4391	NC_008542	TCG	2	6	1368180	1368185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4393	NC_008542	GTC	2	6	1368232	1368237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4394	NC_008542	CG	3	6	1368238	1368243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4395	NC_008542	GC	3	6	1368281	1368286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4396	NC_008542	GAC	2	6	1368287	1368292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4399	NC_008542	AATG	2	8	1369865	1369872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4400	NC_008542	GTGG	2	8	1369874	1369881	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4401	NC_008542	TCG	2	6	1369883	1369888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4403	NC_008542	TGT	2	6	1369909	1369914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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