MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia cenocepacia HI2424 chromosome 1

Total Repeats: 11078

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_008542	CGC	2	6	3466550	3466555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_008542	CG	3	6	3466558	3466563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11003	NC_008542	ACG	2	6	3468305	3468310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11004	NC_008542	AGG	2	6	3468347	3468352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_008542	GCC	2	6	3468409	3468414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11006	NC_008542	CG	3	6	3468435	3468440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11007	NC_008542	CGGC	2	8	3468469	3468476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11008	NC_008542	GC	3	6	3468485	3468490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11009	NC_008542	GCCA	2	8	3468518	3468525	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11010	NC_008542	CA	3	6	3468616	3468621	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11011	NC_008542	GCG	2	6	3468978	3468983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11012	NC_008542	CGC	2	6	3468991	3468996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11013	NC_008542	GCCG	2	8	3468997	3469004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11014	NC_008542	GCG	2	6	3471054	3471059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11015	NC_008542	CCT	2	6	3471063	3471068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11016	NC_008542	GTC	2	6	3471073	3471078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_008542	CT	3	6	3473155	3473160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11018	NC_008542	CGA	2	6	3473268	3473273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_008542	CG	4	8	3473276	3473283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11020	NC_008542	GCT	2	6	3473287	3473292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_008542	TGC	2	6	3473328	3473333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_008542	T	7	7	3473365	3473371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_008542	GT	3	6	3473402	3473407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_008542	TCC	2	6	3473423	3473428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11025	NC_008542	TCC	2	6	3473434	3473439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11026	NC_008542	T	7	7	3473479	3473485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_008542	CGTC	2	8	3473486	3473493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11028	NC_008542	TCG	2	6	3473548	3473553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_008542	GC	3	6	3473997	3474002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11030	NC_008542	CGGG	2	8	3474587	3474594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_008542	TTCGG	2	10	3474597	3474606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11032	NC_008542	TGA	2	6	3474615	3474620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_008542	GC	3	6	3474629	3474634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_008542	GCGT	2	8	3474641	3474648	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11035	NC_008542	CGC	2	6	3474703	3474708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11036	NC_008542	GC	3	6	3474724	3474729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11037	NC_008542	CG	3	6	3474731	3474736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11038	NC_008542	AGA	2	6	3475192	3475197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_008542	AGCA	2	8	3475210	3475217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11040	NC_008542	TGT	2	6	3475222	3475227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_008542	GCG	2	6	3475240	3475245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_008542	GCT	2	6	3475268	3475273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_008542	CG	3	6	3475324	3475329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_008542	GCG	2	6	3475377	3475382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_008542	GATGC	2	10	3475426	3475435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11046	NC_008542	CGT	2	6	3475568	3475573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_008542	CG	3	6	3476197	3476202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11048	NC_008542	AGG	2	6	3476297	3476302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_008542	TCG	2	6	3476485	3476490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_008542	CGC	2	6	3476524	3476529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11051	NC_008542	CGC	2	6	3476884	3476889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_008542	GCC	2	6	3476903	3476908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11053	NC_008542	CG	3	6	3476934	3476939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11054	NC_008542	CTG	2	6	3478318	3478323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_008542	CCG	2	6	3478361	3478366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11056	NC_008542	TGCGG	2	10	3478375	3478384	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11057	NC_008542	CGCT	2	8	3478416	3478423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11058	NC_008542	GAA	2	6	3478464	3478469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_008542	GTT	2	6	3478500	3478505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_008542	TCG	2	6	3478517	3478522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_008542	TGG	2	6	3478530	3478535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_008542	GGTGGG	2	12	3478546	3478557	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_008542	CAT	3	9	3478564	3478572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_008542	CGC	2	6	3478692	3478697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_008542	CCG	2	6	3480272	3480277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_008542	GCA	2	6	3480907	3480912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_008542	CGC	3	9	3480921	3480929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_008542	CGT	2	6	3480930	3480935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11069	NC_008542	CAAA	2	8	3480954	3480961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11070	NC_008542	T	7	7	3480989	3480995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_008542	GCG	2	6	3481009	3481014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_008542	CG	3	6	3481033	3481038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_008542	GCG	2	6	3482980	3482985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_008542	ACG	2	6	3482990	3482995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11075	NC_008542	CCGG	2	8	3483007	3483014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11076	NC_008542	CGC	2	6	3483026	3483031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_008542	GC	3	6	3483511	3483516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11078	NC_008542	TCGC	2	8	3483814	3483821	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.