MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)

Total Repeats: 3069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007984	TAT	2	6	673668	673673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_007984	TTA	2	6	673736	673741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_007984	GAA	2	6	674257	674262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_007984	TA	3	6	674266	674271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_007984	ATTA	2	8	674278	674285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_007984	TATT	2	8	674395	674402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_007984	ATT	2	6	674433	674438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_007984	TATT	2	8	676908	676915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_007984	ACA	2	6	677535	677540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_007984	AT	3	6	677547	677552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_007984	T	6	6	677588	677593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_007984	ATT	2	6	677598	677603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_007984	AATTA	2	10	677605	677614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_007984	AAT	2	6	677630	677635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_007984	ATT	2	6	677639	677644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_007984	TAATT	2	10	677647	677656	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_007984	AT	3	6	677686	677691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_007984	ATA	2	6	677699	677704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_007984	TAT	2	6	677727	677732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_007984	TA	3	6	677735	677740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_007984	AT	3	6	677747	677752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_007984	ATT	2	6	677764	677769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_007984	AAT	3	9	677780	677788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_007984	TAA	2	6	677821	677826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_007984	TA	5	10	677845	677854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_007984	TTA	2	6	677857	677862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_007984	T	6	6	677917	677922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_007984	ATT	2	6	677926	677931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_007984	A	6	6	677942	677947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_007984	TAA	2	6	677954	677959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_007984	AAT	2	6	679197	679202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_007984	TAA	2	6	680348	680353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_007984	TAA	2	6	680361	680366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_007984	ATT	2	6	680371	680376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_007984	ATTT	2	8	680378	680385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_007984	A	6	6	680406	680411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_007984	ATG	2	6	680419	680424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_007984	A	6	6	680437	680442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_007984	AAT	2	6	681121	681126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_007984	TAT	2	6	681141	681146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_007984	TA	3	6	681787	681792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_007984	AT	3	6	681804	681809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_007984	ATAA	2	8	681811	681818	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_007984	AAAAT	2	10	681835	681844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_007984	TAAA	2	8	681854	681861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_007984	TA	3	6	681877	681882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_007984	TA	3	6	681893	681898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_007984	CAC	3	9	681911	681919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3049	NC_007984	ATG	2	6	681928	681933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_007984	ATT	2	6	682749	682754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_007984	TTA	2	6	682765	682770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_007984	AT	3	6	682778	682783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_007984	TAG	2	6	682785	682790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_007984	TA	4	8	682801	682808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_007984	TTC	2	6	682826	682831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_007984	TAA	2	6	682833	682838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_007984	ATTT	2	8	682844	682851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_007984	AT	3	6	682858	682863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_007984	TAC	2	6	682868	682873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_007984	GGT	2	6	682905	682910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_007984	CTAAA	2	10	684503	684512	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_007984	AGG	2	6	684531	684536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007984	TTA	2	6	686046	686051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_007984	ATT	2	6	686059	686064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_007984	TTA	2	6	686076	686081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_007984	ATA	2	6	686089	686094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_007984	CTATA	2	10	686099	686108	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3068	NC_007984	TA	5	10	686105	686114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_007984	T	6	6	686124	686129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.