MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L9

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007107	TA	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007107	AAT	2	6	20	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007107	TAT	2	6	31	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007107	A	7	7	61	67	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007107	TTG	2	6	106	111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007107	TCAC	2	8	119	126	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_007107	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007107	TAG	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007107	GA	3	6	217	222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007107	ATT	2	6	230	235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007107	AAG	2	6	244	249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007107	CTT	2	6	274	279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_007107	T	6	6	278	283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007107	TA	3	6	348	353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007107	TATT	3	12	371	382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007107	TA	3	6	390	395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007107	TTA	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007107	T	8	8	424	431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007107	TAT	3	9	437	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007107	TC	3	6	476	481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_007107	ACT	2	6	484	489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007107	AT	3	6	491	496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007107	T	6	6	502	507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007107	ACTCTC	2	12	528	539	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007107	AAGGAA	2	12	564	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007107	T	7	7	580	586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007107	AATA	2	8	592	599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007107	AGG	2	6	666	671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007107	A	6	6	1201	1206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007107	T	6	6	1233	1238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007107	ATT	2	6	1272	1277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007107	TAAT	2	8	1327	1334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007107	AAAC	2	8	1352	1359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_007107	AT	3	6	1407	1412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007107	AT	3	6	1445	1450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007107	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007107	GTTA	2	8	1460	1467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007107	AG	3	6	1469	1474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007107	AT	3	6	1486	1491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007107	TTTA	2	8	1517	1524	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007107	AAG	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007107	ATTTT	2	10	1541	1550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007107	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007107	GAA	2	6	1578	1583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007107	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007107	AT	4	8	1686	1693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007107	GAA	2	6	1729	1734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007107	CAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_007107	TCG	2	6	2095	2100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007107	GTG	2	6	2138	2143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_007107	A	7	7	3673	3679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007107	A	6	6	3785	3790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007107	TTG	2	6	3800	3805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007107	AGG	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007107	T	7	7	4518	4524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007107	T	6	6	4540	4545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007107	A	8	8	4553	4560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007107	T	8	8	4577	4584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007107	ATT	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007107	CTTT	2	8	4621	4628	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_007107	TA	4	8	4648	4655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007107	GTA	2	6	4681	4686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007107	ACG	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_007107	TCA	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_007107	A	6	6	4728	4733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007107	TCTTT	2	10	4767	4776	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007107	T	6	6	4774	4779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007107	ATG	2	6	4780	4785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007107	T	6	6	4798	4803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007107	CGG	2	6	4804	4809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007107	CCG	2	6	4882	4887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_007107	CAGC	2	8	4971	4978	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_007107	G	6	6	4996	5001	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007107	TTA	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007107	TTAAC	2	10	5076	5085	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007107	TCC	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007107	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007107	TA	3	6	5740	5745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007107	TAT	2	6	6222	6227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007107	TAAAG	2	10	6241	6250	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007107	CAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_007107	GTTT	2	8	6313	6320	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007107	TAT	2	6	6326	6331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007107	CTAT	2	8	6332	6339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_007107	T	6	6	6366	6371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007107	AG	3	6	6410	6415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007107	TAT	2	6	6430	6435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007107	T	7	7	6561	6567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007107	A	7	7	6584	6590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007107	ATT	2	6	6615	6620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007107	AT	3	6	6651	6656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007107	T	7	7	7327	7333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007107	ATT	2	6	7338	7343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007107	ATGTT	2	10	7352	7361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007107	TA	4	8	7451	7458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007107	TAA	2	6	7468	7473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007107	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007107	ATT	2	6	7502	7507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007107	TCC	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_007107	TTA	2	6	7533	7538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007107	AATTT	2	10	7574	7583	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007107	TTTA	2	8	8182	8189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007107	GA	3	6	8246	8251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007107	AATG	2	8	8268	8275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007107	T	6	6	8305	8310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007107	TAGA	2	8	8313	8320	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007107	TA	4	8	8321	8328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007107	TAA	2	6	8344	8349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007107	GAT	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007107	T	6	6	8603	8608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007107	GAT	2	6	8628	8633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007107	ATC	2	6	8643	8648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_007107	T	8	8	8654	8661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007107	TAT	2	6	8731	8736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007107	AT	3	6	8792	8797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007107	AGG	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007107	AT	3	6	8831	8836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007107	TATTG	2	10	8894	8903	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007107	ATTT	2	8	8932	8939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007107	ACA	2	6	8954	8959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007107	GAA	2	6	8970	8975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007107	TAT	2	6	8981	8986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007107	TAG	2	6	8995	9000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007107	TATTTT	2	12	9043	9054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007107	TTA	2	6	9076	9081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007107	TTA	2	6	9097	9102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.