MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus E33L plasmid pE33L54

Total Repeats: 398

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007105	TTA	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007105	GTAT	2	8	21	28	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007105	ATC	2	6	32	37	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007105	A	6	6	134	139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007105	A	7	7	184	190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007105	TTC	2	6	200	205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_007105	TGTA	2	8	225	232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007105	GGA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007105	ACA	2	6	1538	1543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007105	CAA	2	6	2307	2312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007105	TTA	2	6	2352	2357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007105	TTTA	2	8	2414	2421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007105	A	6	6	2451	2456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007105	CTT	2	6	2521	2526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007105	TTG	2	6	2587	2592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007105	ATT	2	6	2622	2627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007105	TAT	2	6	2663	2668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007105	AATC	2	8	2960	2967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_007105	AT	3	6	2986	2991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007105	CCT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_007105	A	6	6	3675	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007105	TTA	2	6	3712	3717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007105	TA	3	6	3741	3746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007105	TGA	2	6	3781	3786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_007105	ATA	2	6	3814	3819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007105	AATT	2	8	3843	3850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007105	TAA	2	6	3898	3903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007105	AAG	2	6	3998	4003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007105	AAT	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007105	GGA	2	6	4025	4030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007105	G	7	7	4671	4677	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007105	ATT	2	6	4704	4709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007105	GAA	2	6	4723	4728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007105	A	7	7	4734	4740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007105	GGC	2	6	4780	4785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007105	CGTC	2	8	4965	4972	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_007105	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007105	ATG	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007105	A	6	6	5033	5038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007105	TCAC	2	8	5583	5590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_007105	ATATT	2	10	5603	5612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007105	AT	3	6	5622	5627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007105	ATA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007105	CAA	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007105	A	6	6	5654	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007105	CAA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007105	CAA	2	6	6386	6391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_007105	AAT	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007105	CTT	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_007105	TC	3	6	6605	6610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007105	TTC	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007105	CAT	2	6	7596	7601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007105	ACC	2	6	8012	8017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_007105	CTT	2	6	8018	8023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007105	AGA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007105	ACT	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007105	TTTG	2	8	8194	8201	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007105	AAC	2	6	8559	8564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_007105	A	7	7	8647	8653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007105	A	6	6	8726	8731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007105	GAAT	2	8	9003	9010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007105	T	6	6	9096	9101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007105	A	6	6	9190	9195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007105	ATT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007105	AAT	2	6	10237	10242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007105	ATA	2	6	10249	10254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007105	ATGTT	2	10	10255	10264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007105	CTT	2	6	10349	10354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007105	TAA	2	6	10651	10656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007105	TAT	2	6	10702	10707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007105	A	6	6	10714	10719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007105	TAA	2	6	11224	11229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007105	CTAT	2	8	11235	11242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_007105	AAT	2	6	11253	11258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007105	TTC	2	6	11306	11311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007105	TA	3	6	11342	11347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007105	GTA	2	6	11357	11362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007105	ATT	3	9	11364	11372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007105	T	7	7	11394	11400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007105	ATT	2	6	11473	11478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007105	AAG	2	6	11934	11939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007105	TAA	2	6	11958	11963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007105	TTC	2	6	11970	11975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007105	CTC	2	6	12054	12059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_007105	TTC	2	6	12064	12069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007105	TCC	2	6	12078	12083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_007105	AT	3	6	12105	12110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_007105	T	7	7	12132	12138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007105	GTA	2	6	12164	12169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007105	T	6	6	12828	12833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007105	ACA	2	6	13159	13164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007105	AT	3	6	13166	13171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007105	TTATA	2	10	13187	13196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007105	TAA	2	6	13200	13205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007105	AAC	2	6	13466	13471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_007105	CCT	2	6	13530	13535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_007105	TTAA	2	8	13564	13571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007105	AGA	2	6	13575	13580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007105	GCTT	2	8	13626	13633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_007105	ATAA	2	8	13664	13671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007105	T	7	7	13738	13744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007105	ATA	2	6	13787	13792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007105	TA	3	6	13830	13835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007105	ATA	2	6	13839	13844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007105	GTAT	2	8	13874	13881	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007105	TTG	2	6	13892	13897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007105	T	6	6	13957	13962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_007105	TTA	2	6	15377	15382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007105	TCAT	2	8	15386	15393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_007105	A	6	6	15414	15419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007105	TAC	2	6	15504	15509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007105	T	6	6	15590	15595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007105	ACAA	2	8	15620	15627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_007105	T	6	6	15689	15694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007105	ATT	2	6	15695	15700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_007105	TTA	2	6	15731	15736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007105	TCT	2	6	15792	15797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007105	C	7	7	15921	15927	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_007105	CAC	2	6	16266	16271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_007105	ATA	2	6	16307	16312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007105	AAAG	2	8	16333	16340	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007105	TTC	2	6	16351	16356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_007105	C	6	6	16409	16414	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_007105	TA	3	6	16497	16502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007105	ATT	2	6	16513	16518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007105	A	6	6	16523	16528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_007105	A	6	6	16567	16572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_007105	TAA	2	6	16583	16588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007105	A	7	7	17420	17426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007105	A	8	8	18904	18911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007105	A	6	6	18980	18985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_007105	TCCA	2	8	19279	19286	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007105	A	6	6	19289	19294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_007105	A	7	7	19389	19395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007105	AGT	2	6	19449	19454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007105	GTT	2	6	20328	20333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007105	ATT	2	6	20342	20347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007105	CTC	2	6	20804	20809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_007105	AAT	2	6	20897	20902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007105	T	6	6	20970	20975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_007105	ATA	2	6	21012	21017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007105	AAT	2	6	21045	21050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_007105	CCA	2	6	21217	21222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_007105	GTAC	2	8	21308	21315	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_007105	CCA	2	6	21375	21380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_007105	CATT	2	8	21420	21427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_007105	AT	3	6	21475	21480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_007105	ATAA	2	8	21571	21578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007105	A	6	6	21577	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007105	TA	3	6	21624	21629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_007105	T	6	6	21639	21644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_007105	TG	3	6	21679	21684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_007105	CTTT	2	8	21686	21693	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_007105	T	6	6	21985	21990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_007105	AAT	2	6	22029	22034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_007105	AT	4	8	22095	22102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_007105	CTA	2	6	22155	22160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_007105	T	6	6	22179	22184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_007105	TTAAA	2	10	22227	22236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_007105	AAT	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_007105	ATT	2	6	22339	22344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_007105	GTA	2	6	22444	22449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_007105	GTT	2	6	22456	22461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_007105	AGG	2	6	22465	22470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_007105	TA	3	6	23948	23953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_007105	CTTT	2	8	24030	24037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_007105	ATG	2	6	24969	24974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_007105	ATA	2	6	25023	25028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_007105	T	6	6	26961	26966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_007105	A	6	6	27030	27035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_007105	TTA	2	6	27094	27099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_007105	ATA	2	6	27130	27135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_007105	A	6	6	27226	27231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_007105	ATTTC	2	10	27328	27337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
178	NC_007105	A	6	6	27373	27378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_007105	A	6	6	28510	28515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_007105	T	6	6	28544	28549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_007105	TAAA	2	8	28553	28560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_007105	TAT	2	6	28561	28566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_007105	AT	3	6	28605	28610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_007105	TCC	2	6	29572	29577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_007105	TAT	2	6	31199	31204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_007105	CCTT	2	8	31212	31219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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191	NC_007105	T	6	6	31318	31323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_007105	TA	3	6	31337	31342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_007105	TTTA	2	8	31370	31377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.