MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacteroides fragilis YCH46 DNA

Total Repeats: 12461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006347	AAGAA	2	10	21	30	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006347	GAT	2	6	602	607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006347	ATT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006347	ATAA	2	8	660	667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006347	ATT	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006347	TAAACC	2	12	719	730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006347	TAA	3	9	4042	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006347	ATA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006347	GGT	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006347	TAA	2	6	8273	8278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006347	TTTA	2	8	8279	8286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006347	TAA	3	9	8295	8303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006347	A	6	6	8312	8317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006347	GGA	2	6	8396	8401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006347	CAT	2	6	8409	8414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006347	TA	3	6	8446	8451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006347	AAT	2	6	8457	8462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006347	TAA	2	6	8527	8532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006347	GTT	2	6	8617	8622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006347	GAA	2	6	15725	15730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006347	AC	3	6	15765	15770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006347	ATA	2	6	15778	15783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006347	GCA	2	6	16489	16494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006347	ATT	2	6	19420	19425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006347	A	6	6	19444	19449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006347	TAA	2	6	21659	21664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006347	ATTAA	2	10	24757	24766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006347	TA	3	6	24867	24872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006347	AAAG	2	8	24875	24882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006347	TGA	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006347	GT	3	6	24921	24926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006347	CTT	2	6	26628	26633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006347	TA	3	6	26639	26644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006347	ATAAA	2	10	26700	26709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006347	TTAT	2	8	26735	26742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006347	TTA	2	6	26776	26781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006347	T	6	6	26799	26804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006347	TTA	2	6	26827	26832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006347	AAAT	2	8	26871	26878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006347	CTTTT	2	10	27513	27522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_006347	TC	3	6	27524	27529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006347	T	7	7	27540	27546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006347	T	6	6	29157	29162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006347	ACGA	2	8	32487	32494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_006347	TAT	2	6	34071	34076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006347	AAT	2	6	34089	34094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006347	TGAT	2	8	34473	34480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006347	A	6	6	34498	34503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006347	T	7	7	34528	34534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006347	A	6	6	34554	34559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006347	TTTC	2	8	34567	34574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006347	TG	3	6	34585	34590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006347	TGTT	2	8	34628	34635	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006347	TA	3	6	36145	36150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006347	TCA	2	6	36167	36172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006347	TTGT	2	8	36191	36198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006347	TAAAA	2	10	37710	37719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006347	CCT	2	6	39892	39897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_006347	AGA	2	6	40167	40172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006347	TTA	2	6	40173	40178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006347	TCT	2	6	40187	40192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006347	ATTTTA	2	12	41987	41998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006347	GAG	2	6	42185	42190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006347	TTAT	2	8	42191	42198	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006347	TC	3	6	42222	42227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_006347	T	6	6	42258	42263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006347	TA	3	6	42302	42307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006347	TGGG	2	8	42316	42323	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006347	AGAA	2	8	42325	42332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006347	TGA	2	6	42448	42453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006347	ATG	2	6	42479	42484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006347	T	8	8	42486	42493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006347	TAG	2	6	42534	42539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006347	T	6	6	42775	42780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006347	CAA	2	6	42824	42829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006347	GTCA	2	8	42855	42862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_006347	ATA	2	6	42888	42893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006347	TTTG	2	8	42909	42916	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006347	TAA	2	6	44164	44169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006347	AATGT	2	10	44170	44179	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006347	ATG	2	6	44185	44190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006347	TAG	2	6	44201	44206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006347	AAT	2	6	44224	44229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006347	AT	4	8	44234	44241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006347	TTGG	2	8	45728	45735	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006347	ACAT	2	8	45747	45754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006347	CTT	2	6	45765	45770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006347	AGC	2	6	45786	45791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006347	TGT	2	6	46052	46057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006347	TTG	2	6	46070	46075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006347	TGC	2	6	46140	46145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006347	TTA	2	6	46149	46154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006347	TA	3	6	46412	46417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006347	TCA	2	6	46422	46427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_006347	TCAT	2	8	46436	46443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006347	AAG	3	9	46742	46750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006347	TTC	2	6	46771	46776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_006347	T	6	6	46783	46788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006347	AGGAG	2	10	46796	46805	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006347	TAC	2	6	46811	46816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_006347	TTAAT	2	10	46845	46854	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006347	TAA	2	6	46856	46861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006347	GTT	2	6	48006	48011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006347	T	6	6	48010	48015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006347	CAG	2	6	48032	48037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006347	GAA	2	6	48056	48061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006347	TTA	2	6	48236	48241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006347	AT	4	8	48262	48269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006347	T	6	6	48269	48274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006347	T	6	6	48284	48289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006347	GAA	2	6	48334	48339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006347	AAT	2	6	48410	48415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006347	TTGT	2	8	48435	48442	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006347	ATG	3	9	49960	49968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006347	A	6	6	50335	50340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006347	A	6	6	50367	50372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006347	T	7	7	50402	50408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006347	GGA	2	6	50411	50416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006347	AG	3	6	50431	50436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006347	A	6	6	50443	50448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006347	CAT	2	6	50456	50461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006347	AAG	3	9	50745	50753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006347	AGG	2	6	50799	50804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006347	GAT	2	6	50809	50814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006347	TAC	2	6	50815	50820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006347	TAATC	2	10	50850	50859	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_006347	TAA	2	6	50860	50865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006347	AAAT	2	8	52868	52875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006347	TGC	2	6	52890	52895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006347	AT	4	8	52951	52958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006347	AG	3	6	52966	52971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006347	GTTT	2	8	55344	55351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006347	GTT	2	6	55381	55386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006347	ATT	2	6	56497	56502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006347	GTG	2	6	56526	56531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006347	GAAC	2	8	58536	58543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006347	TTGCC	2	10	58546	58555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_006347	ATT	2	6	58556	58561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006347	CCT	2	6	58568	58573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_006347	GT	3	6	58631	58636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006347	TAAA	2	8	60476	60483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006347	TGCT	2	8	60545	60552	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_006347	AAAAT	2	10	62263	62272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006347	TAA	2	6	62276	62281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006347	ATT	2	6	62288	62293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006347	TGAAA	2	10	64055	64064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006347	A	7	7	64097	64103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006347	ACA	2	6	64111	64116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_006347	T	6	6	64143	64148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_006347	TATT	2	8	65510	65517	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_006347	TTA	2	6	67107	67112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_006347	TTA	2	6	69189	69194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_006347	ATCC	2	8	70576	70583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_006347	ATTT	2	8	73889	73896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_006347	A	8	8	142084	142091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_006347	GTT	2	6	142135	142140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_006347	ATG	2	6	142174	142179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_006347	AAT	2	6	142184	142189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_006347	AT	3	6	142241	142246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_006347	TAAT	2	8	142252	142259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_006347	AT	3	6	142258	142263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_006347	TCT	2	6	142304	142309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_006347	TGCG	2	8	142971	142978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
279	NC_006347	A	6	6	142997	143002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_006347	A	6	6	143016	143021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_006347	T	6	6	143074	143079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_006347	TTGT	2	8	143108	143115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
283	NC_006347	TATTC	2	10	143128	143137	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_006347	A	6	6	143624	143629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_006347	AGCAT	2	10	143711	143720	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
286	NC_006347	GGC	2	6	143800	143805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_006347	CCT	2	6	149491	149496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_006347	TAT	2	6	149543	149548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_006347	A	7	7	149579	149585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_006347	T	6	6	149609	149614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_006347	TTA	2	6	149635	149640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_006347	TC	4	8	149723	149730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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436	NC_006347	TGA	2	6	219471	219476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_006347	TA	3	6	219525	219530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_006347	TAA	2	6	219596	219601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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447	NC_006347	AAT	2	6	219776	219781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_006347	GGA	2	6	224212	224217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_006347	GAG	2	6	232829	232834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_006347	AGC	2	6	239741	239746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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