MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia garinii PBi plasmid cp26

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006128	TA	3	6	763	768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006128	AT	3	6	769	774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006128	TAA	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006128	A	6	6	831	836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006128	T	6	6	2221	2226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006128	A	6	6	2235	2240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006128	A	7	7	2253	2259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006128	TA	3	6	2264	2269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006128	AAAT	2	8	2366	2373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006128	TA	3	6	2380	2385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006128	AG	3	6	2405	2410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006128	CT	3	6	2425	2430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_006128	A	6	6	2460	2465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006128	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006128	TAAT	2	8	3818	3825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006128	TAT	2	6	3826	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006128	AT	3	6	3837	3842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006128	AATT	2	8	3843	3850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006128	ATA	2	6	3851	3856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006128	TAAAA	2	10	3886	3895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006128	TTAT	2	8	3896	3903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006128	AT	3	6	3909	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006128	TATAA	2	10	3917	3926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006128	TAT	2	6	3929	3934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006128	ATTA	2	8	3952	3959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006128	TAAA	2	8	3968	3975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006128	A	7	7	5783	5789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006128	ATTA	2	8	6456	6463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006128	TAA	2	6	6495	6500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006128	ATT	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006128	TA	3	6	6543	6548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006128	ACTTT	2	10	7650	7659	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_006128	T	7	7	7657	7663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006128	TAT	3	9	7672	7680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006128	AAT	2	6	9978	9983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006128	A	6	6	10566	10571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006128	A	7	7	10591	10597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006128	TA	3	6	10606	10611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006128	TA	3	6	10618	10623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006128	TTG	2	6	10647	10652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006128	AAT	2	6	10662	10667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006128	TA	3	6	10724	10729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006128	TA	3	6	10735	10740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006128	T	8	8	10742	10749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006128	A	6	6	10779	10784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006128	ATA	3	9	11332	11340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006128	T	6	6	11343	11348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006128	AAT	2	6	11363	11368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006128	TAA	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006128	ATTA	2	8	11378	11385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006128	T	8	8	11402	11409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006128	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006128	ACT	2	6	11443	11448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006128	T	6	6	11454	11459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006128	TTTTAT	2	12	11549	11560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006128	T	6	6	11568	11573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006128	TATT	2	8	11611	11618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006128	TAG	2	6	11622	11627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006128	T	6	6	11648	11653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006128	A	7	7	11654	11660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006128	AAT	2	6	11672	11677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006128	ACA	2	6	11697	11702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006128	AT	3	6	11731	11736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006128	TTAA	2	8	11737	11744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006128	ATT	2	6	11830	11835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006128	AATA	2	8	11839	11846	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006128	ATT	2	6	11849	11854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006128	ATT	3	9	11868	11876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006128	ATT	2	6	11883	11888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006128	TAT	2	6	11908	11913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006128	T	6	6	12062	12067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006128	T	7	7	12087	12093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006128	A	6	6	12097	12102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006128	ATCTA	2	10	12120	12129	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006128	ATA	2	6	12133	12138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006128	TA	4	8	12137	12144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006128	A	6	6	12149	12154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006128	T	6	6	12158	12163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006128	AT	3	6	12164	12169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006128	AAT	2	6	12170	12175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006128	TTGTT	2	10	12226	12235	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006128	TAA	2	6	12257	12262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006128	ATT	2	6	12281	12286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006128	AAAG	2	8	12300	12307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006128	TTTAG	2	10	12332	12341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006128	AAT	2	6	12358	12363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006128	ATA	2	6	12399	12404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006128	T	7	7	12409	12415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006128	T	6	6	12462	12467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006128	AAT	2	6	12469	12474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006128	AT	3	6	12496	12501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006128	AAATTT	2	12	12517	12528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006128	TTTAT	2	10	14154	14163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006128	A	7	7	14170	14176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006128	TAA	2	6	14226	14231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006128	TTTTA	2	10	14251	14260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006128	TTA	2	6	14273	14278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006128	ATT	2	6	14284	14289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006128	A	7	7	14338	14344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006128	ATT	2	6	14365	14370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006128	ATT	2	6	14380	14385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006128	GTT	2	6	14400	14405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006128	A	6	6	14414	14419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006128	TTA	2	6	14453	14458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006128	GTTT	2	8	17362	17369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006128	AAT	2	6	17382	17387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006128	AAT	2	6	17393	17398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006128	AAT	2	6	17404	17409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006128	AAT	2	6	17415	17420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006128	AAT	2	6	17426	17431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006128	AAT	2	6	17437	17442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006128	ATT	2	6	17455	17460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006128	T	8	8	17459	17466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006128	A	6	6	17471	17476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006128	GAAAA	2	10	17479	17488	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006128	TTG	2	6	17490	17495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006128	TAA	2	6	17499	17504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006128	AGG	2	6	17516	17521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006128	A	6	6	18184	18189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006128	AG	3	6	18215	18220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006128	T	6	6	18253	18258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006128	ATTTTA	2	12	18298	18309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006128	TAA	2	6	18349	18354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006128	A	7	7	18380	18386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006128	T	6	6	18462	18467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006128	TG	3	6	18473	18478	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006128	GC	3	6	18491	18496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_006128	TGA	2	6	18513	18518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006128	T	7	7	18524	18530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006128	GTTT	2	8	18547	18554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006128	T	8	8	18572	18579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006128	ATTTT	2	10	19969	19978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006128	TTA	2	6	20004	20009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006128	TTA	2	6	20019	20024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006128	TAAAT	2	10	20039	20048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_006128	CCTT	2	8	21421	21428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_006128	T	7	7	21471	21477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006128	A	9	9	22458	22466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006128	TTATA	2	10	22485	22494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006128	TAAAG	4	20	23812	23831	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006128	TAAA	2	8	23832	23839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006128	AT	3	6	23841	23846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006128	ATATA	2	10	23857	23866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_006128	TTA	2	6	23897	23902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006128	A	6	6	24005	24010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006128	TAT	2	6	24024	24029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006128	T	7	7	24035	24041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006128	TAT	2	6	24050	24055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006128	TTA	2	6	24071	24076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006128	TTA	2	6	25172	25177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_006128	AAT	2	6	25197	25202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_006128	TAA	2	6	25238	25243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_006128	AAATT	2	10	25252	25261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_006128	ATT	3	9	25318	25326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_006128	A	6	6	25352	25357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_006128	TAT	2	6	25378	25383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_006128	ATTA	2	8	25388	25395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_006128	TAAT	3	12	25399	25410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_006128	TAA	2	6	25418	25423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_006128	T	7	7	27067	27073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_006128	A	6	6	27074	27079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_006128	AAC	2	6	27086	27091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.